Elucidation of the pathogenesis of adult T-cell leukemia using chromatin structural data at various levels of hematopoietic differentiation
| Project/Area Number |
19K16740
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
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| Allocation Type | Multi-year Fund |
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| Review Section |
Basic Section 50010:Tumor biology-related
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| Research Institution | The University of Tokyo |
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Principal Investigator |
Tanaka Azusa 東京大学, 大学院医学系研究科(医学部), 特別研究員 (70749796)
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| Project Period (FY) |
2019-04-01 – 2022-03-31
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| Project Status |
Completed (Fiscal Year 2021)
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| Budget Amount *help |
¥4,160,000 (Direct Cost: ¥3,200,000、Indirect Cost: ¥960,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,040,000 (Direct Cost: ¥800,000、Indirect Cost: ¥240,000)
Fiscal Year 2020: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Fiscal Year 2019: ¥1,820,000 (Direct Cost: ¥1,400,000、Indirect Cost: ¥420,000)
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| Keywords | 成人T細胞白血病ウイルス / エピゲノム / 成人T細胞白血病 / クロマチン / ATAC-seq / クロマチン構造 |
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| Outline of Research at the Start |
成人T細胞白血病(ATL) は、ヒトT細胞白血病ウイルス(HTLV-1) の感染により発症する難治性のT細胞悪性腫瘍である。
ATL細胞の由来はCD4陽性メモリー細胞と考えられてるが、その細胞分画とは異なる細胞形質も有している。どのような経路を経てATLが発症したのか、細胞の過去の状態、現在、未来の運命決定を説明するには遺伝子発現だけでなく、エピゲノムの情報が必須である。本研究ではATLのクロマチンデータとデータベース上に蓄積された様々な血球分画のクロマチンデータを詳細に比較解析することで、感染細胞がどのような経路でATL発症へと至るのかを推定し、実験的に検証し解明する。
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| Outline of Final Research Achievements |
Human T-cell leukemia virus type 1 (HTLV-1) causes adult T-cell leukemia-lymphoma (ATL). The leukemic cells typically have a CD4+ memory T cell phenotype, but the mechanisms underlying this process are not presently understood. To clarify the mechanism of leukemia development, we focused on the chromatin structure, which is a central mechanism of cell regulation, and investigated the characteristics of ATL cells. We first developed a method for comparative analysis between samples. Next, we analyzed the chromatin accessibility landscape of HTLV-1-infected cells from ATL cases by comparing the ATAC-seq data with those from 13 types of hematopoietic cells from healthy donors using this method. It was found that in some cases, although ATL is a T-cell leukemia, the chromatin structure resembled to that of myeloid cells, suggesting the possibility of the existence of "T-cell leukemia cells with traits similar to those of myeloid cells".
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| Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements |
HTLV-1は母子感染するレトロウイルスで、数千年前から人類と共存してきた。感染者の90%は無症候のまま健康状態を保っているが、感染者の5%は成人T細胞白血病 (ATL) として知られる難治性の白血病やリンパ腫を発症する。HTLV-1は造血幹細胞を含め様々な細胞に感染し、さらに感染を維持したまま分化することが報告されているが、ATL発症メカニズムの関しては未だ不明な点も多い。本研究課題では健常人由来の細胞とのクロマチン構造の比較解析により、T細胞以外の要素を有するATL症例の存在が示唆された。
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Report
(4 results)
Research Products
(4 results)
