機能性副腎腫瘍のゲノム・エピゲノム解析とAIによる新規診断法の確立
Project/Area Number |
19K18003
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Research Category |
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
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Allocation Type | Multi-year Fund |
Review Section |
Basic Section 54040:Metabolism and endocrinology-related
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Research Institution | Kanazawa University |
Principal Investigator |
米谷 充弘 金沢大学, 附属病院, 准教授 (80613752)
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Project Period (FY) |
2019-04-01 – 2024-03-31
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Project Status |
Granted (Fiscal Year 2022)
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Budget Amount *help |
¥4,160,000 (Direct Cost: ¥3,200,000、Indirect Cost: ¥960,000)
Fiscal Year 2021: ¥390,000 (Direct Cost: ¥300,000、Indirect Cost: ¥90,000)
Fiscal Year 2020: ¥1,040,000 (Direct Cost: ¥800,000、Indirect Cost: ¥240,000)
Fiscal Year 2019: ¥2,730,000 (Direct Cost: ¥2,100,000、Indirect Cost: ¥630,000)
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Keywords | 機能性副腎腫瘍 / 遺伝子解析 / DNAメチル化解析 / 原発性アルドステロン症 / 副腎腫瘍 / ゲノム・エピゲノム / 人工知能 |
Outline of Research at the Start |
ステロイドホルモン過剰産生を伴う機能性副腎腫瘍(FAT)は、心血管合併症を含む様々な合併症を引き起こし、臨床上大変重要な疾患であるが、ホルモン過剰を是正する内科的治療が未確立であること、良悪性を確実に鑑別する方法が確立していないことが臨床上の大きな課題である。本研究では、1)FATに関するゲノム・エピゲノム情報の網羅的な解析を実施し、ステロイドホルモン過剰産生機構と腫瘍発生・進展の分子機構を明らかにすること、2)AIによる深層学習技術を用いて、FATに対する新たな機能性・良悪性の診断法の確立、の2点を目標とする。
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Outline of Annual Research Achievements |
本研究では機能性副腎腫瘍におけるステロイドホルモン過剰産生および腫瘍発生・進展機構に関して、エピジェネティク制御に着目して明らかにする。さらにゲノム・エピゲノム解析と臨床情報、画像情報を統合して、新たな機能性・良悪性の診断法の確立につなげる。2021年度はKCNJ5やPRKACAといった機能性副腎腫瘍に高頻度に変異が見られる遺伝子をターゲットとして、次世代シーケンサーを用いて解析を実施した。次世代シーケンサーでの解析により、副腎腫瘍に関してこれまで報告歴のある17遺伝子を対象として解析を実施した。結果として、機能性副腎腫瘍80例と非機能性副腎腫瘍13例の解析を実施した。機能性副腎腫瘍の中で、原発性アルドステロン症おいて67%、クッシング症候群において77%、褐色細胞腫において45%の症例でターゲットとした遺伝子の一つに変異を認めた。この結果は、各々の腫瘍において約30-50%にまだ未知の遺伝子変異を有している可能性を示唆している。また報告例のある複数の遺伝子変異を認める症例はなく、また同時に解析した非機能性副腎腫瘍には解析遺伝子には変異を認めなかった。この解析の中で大変興味深いことに、これまでに報告がある遺伝子ではあるが変異部位がこれまでに未報告である症例やホルモン産生特異的な遺伝子変異とホルモン過剰産生が一致していない症例が見出された。これらは新たな知見であ り、2022年度以降に報告を予定している。また、遺伝子変異とエピゲノム異常の関連に関して評価するために、すでに確立しているパイロシークエンス法を用いた手法で解析していく準備を進めている。2021年度は副腎腫瘍に関して、筆頭著者として国際誌へ2報の論文報告を行い、今年度も原発性アルドステロン症を中心とした臨床論文2報を責任著者として国際誌に報告した。
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Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
3: Progress in research has been slightly delayed.
Reason
マイクロアレイ法を用いら全ゲノムのDNAメチル化解析に関して、DNA抽出に関して、本手法の実施・解析のためのQualityを得ることが困難であったため、これまでの解析実績のあるパイロシークエンス法に切り替えざるを得なかった。
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Strategy for Future Research Activity |
2022年度中に、次世代シーケンサーを用いた遺伝子解析とエピゲノム解析が終了し、その結果の関連および臨床所見、画像所見との関連性の評価を行い、AIを用いた新たな診断法の確立に着手する。
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Report
(4 results)
Research Products
(61 results)
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[Journal Article] Primary Aldosteronism Subtype Discordance Between Computed Tomography and Adrenal Venous Sampling2019
Author(s)
Aono D, Kometani M, Karashima S, Usukura M, Gondo Y, Hashimoto A, Demura M, Furukawa K, Takeda Y, Kawashiri M, Yoneda T.
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Journal Title
Hypertens Res
Volume: 42
Issue: 12
Pages: 1942-1950
DOI
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Peer Reviewed
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[Presentation] Impact of the time of day performing AVS on the success rate and subtype diagnosis in primary aldosteronism2022
Author(s)
Mau Yoneda, Mitsuhiro Kometani, Shigehiro Karashima, Mikiya Usukura, Shunsuke Mori, Daisuke Aono, Seigo Konishi, Xurong Mai, Kenji Furukawa, Yoshiyu Takeda, Takashi Yoneda
Organizer
The 29th Scientific Meeting of the International Society of Hypertension
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[Presentation] Pheochromocytoma with hyperaldosteronism-linked mutations in the potassium channel KCNJ52022
Author(s)
Xurong Mai, Mitsuhiro Kometani, Toshiaki Kato, Shunsuke Mori, Daisuke Aono, Seigo Konishi, Shigehiro Karashima, Yoshiyu Takeda, Mau Yoneda, Kenji Furukawa, Takashi Yoneda
Organizer
The 29th Scientific Meeting of the International Society of Hypertension
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Organizer
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