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Gene expression profiling using targeted RNA seqencing in early stage lung adenocarcinoma wiht a solid component or micropapillary component

Research Project

Project/Area Number 19K18214
Research Category

Grant-in-Aid for Early-Career Scientists

Allocation TypeMulti-year Fund
Review Section Basic Section 55040:Respiratory surgery-related
Research InstitutionTottori University

Principal Investigator

Kidokoro Yoshiteru  鳥取大学, 医学部附属病院, 助教 (50768752)

Project Period (FY) 2019-04-01 – 2022-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2021)
Budget Amount *help
¥4,160,000 (Direct Cost: ¥3,200,000、Indirect Cost: ¥960,000)
Fiscal Year 2020: ¥1,950,000 (Direct Cost: ¥1,500,000、Indirect Cost: ¥450,000)
Fiscal Year 2019: ¥2,210,000 (Direct Cost: ¥1,700,000、Indirect Cost: ¥510,000)
Keywords浸潤性肺腺癌 / 充実型増殖 / 発現変動遺伝子 / 組織不均一性 / 網羅的遺伝子発現解析 / レーザーマイクロダイセクション / 次世代シーケンサー / Invasive adenocarcinoma / transcriptome / solid components / solid predominant
Outline of Research at the Start

腫瘍組織は均一ながん細胞集団ではなく,様々な細胞から成り立つheterogeneityを有し,特に浸潤性肺腺癌では腫瘍内の不均一性が大きい.浸潤性肺腺癌の中に充実型や微小乳頭型の増殖形態が存在する場合,予後不良因子となる.本研究では,腫瘍細胞の増殖形態ごとの遺伝子発現状況を網羅的に解析することで, 浸潤性肺腺癌がそれぞれの増殖形態を獲得するメカニズムを解明する.これらの予後不良である浸潤性肺腺癌において, 治療標的となり得る遺伝子を同定することを目的としている.本研究の成果は, 将来的に予後不良な増殖形態に対応した新たな分子標的治療薬を開発する上で,基礎的データになることが期待される.

Outline of Final Research Achievements

Lung adenocarcinoma (LUAD) has histologically intratumor heterogeneity. Especially, a solid component and a micropapillary component are highly malignant, and even in LUAD of the same stage, the presence of these two subtypes shows a poor prognosis. Therefore, we studied the genetic characteristics of these two subtypes.
First, tissues were collected from the stage I LUAD resected specimens using a laser microdissection for a solid component and a acinar component which is the one of the subtypes of LUAD. Second, RNA was collected from the tissue and we compared the RNA in the solid component with the acinar component. However, in the micropapillary type, pure tissue was not cut out. Finally, the analysis was performed only in the solid component compared with the acinar component. Many RNAs involved in cell proliferation were found in a solid component. In addition, PDL1 was highly expressed in a solid component, suggesting the involvement of immunosuppression.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

肺腺癌の中で,とくに予後不良となる充実型増殖の遺伝子発現状況の研究を行い多数の遺伝子の発現上昇あるいは発現低下を確認した.すでに免疫療法として治療対象となっているPDL1が充実型で多く見れらた.加えて,乳癌領域で癌遺伝子の調節を行う因子として報告されているTAF1の発現上昇,転移抑制として働き癌抑制因子としての機能が知られているHOXB3の発現低下,過去の報告で肺癌の増殖能を活性化する可能性が示されているPSMA6などが見られた.さらなる研究は必要であるが,これらの遺伝子は肺癌の新規治療の標的となりえ,予後不良な肺癌の治療に貢献できる可能性がある.

Report

(4 results)
  • 2021 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2020 Research-status Report
  • 2019 Research-status Report
  • Research Products

    (7 results)

All 2022 2021 2020

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 1 results,  Open Access: 1 results) Presentation (5 results)

  • [Journal Article] Gene expression profiling using targeted RNA-sequencing to elucidate the progression from histologically normal lung tissues to non-invasive lesions in invasive lung adenocarcinoma2022

    • Author(s)
      Kadonaga Taichi、Sakabe Tomohiko、Kidokoro Yoshiteru、Haruki Tomohiro、Nosaka Kanae、Nakamura Hiroshige、Umekita Yoshihisa
    • Journal Title

      Virchows Archiv

      Volume: 480 Issue: 4 Pages: 831-841

    • DOI

      10.1007/s00428-021-03250-y

    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Journal Article] Gene expression profiling by targeted RNA sequencing in pathological stage I lung adenocarcinoma with a solid component2020

    • Author(s)
      Kidokoro Yoshiteru、Sakabe Tomohiko、Haruki Tomohiro、Kadonaga Taichi、Nosaka Kanae、Nakamura Hiroshige、Umekita Yoshihisa
    • Journal Title

      Lung Cancer

      Volume: 147 Pages: 56-63

    • DOI

      10.1016/j.lungcan.2020.06.035

    • Related Report
      2020 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] 充実型肺腺癌はなぜ予後が不良か 次世代シーケンサーを用いた遺伝子発現解析からの解明2021

    • Author(s)
      城所嘉輝、中西敦之、野坂祐仁、大島祐貴、松居真司、 窪内康晃、髙木雄三、春木朋広、中村廣繁
    • Organizer
      第121回日本外科学会定期学術集会
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Presentation] 肺腺癌における正常肺組織とlepidic componentの遺伝子発現解析2021

    • Author(s)
      門永太一、坂部友彦、城所嘉輝、牧嶋かれん、野坂加苗、梅北善久
    • Organizer
      第110回日本病理学会総会
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Presentation] 充実型肺腺癌はなぜ予後が不良か -次世代シーケンサーを用いた遺伝子発現解析からの解明-2021

    • Author(s)
      城所嘉輝,中西敦之,野坂祐仁,大島祐貴,松居真司, 窪内康晃,髙木雄三,春木朋広,中村廣繁
    • Organizer
      第121回日本外科学会定期学術集会
    • Related Report
      2020 Research-status Report
  • [Presentation] 充実型増殖を有する病理病期Ⅰ期肺腺癌における遺伝子発現解析 -同一腫瘍内の腺房型増殖と比較して-2020

    • Author(s)
      城所嘉輝, 坂部友彦, 春木朋広, 門永太一, 野坂加苗, 中村廣繁, 梅北善久
    • Organizer
      第109回日本病理学会総会
    • Related Report
      2020 Research-status Report
  • [Presentation] 病理病期Ⅰ期肺腺癌における充実型増殖の遺伝子発現解析2020

    • Author(s)
      城所嘉輝, 中西敦之, 野坂祐仁, 大島祐貴, 松居真司, 門永太一, 窪内康晃, 高木雄三, 春木朋広, 梅北善久, 中村廣繁
    • Organizer
      第61回日本肺癌学会学術集会
    • Related Report
      2020 Research-status Report

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Published: 2019-04-18   Modified: 2023-01-30  

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