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Structural bases of transcriptional regulation by chromatin conformation

Research Project

Project/Area Number 19K21175
Project/Area Number (Other) 18H06041 (2018)
Research Category

Grant-in-Aid for Research Activity Start-up

Allocation TypeMulti-year Fund (2019)
Single-year Grants (2018)
Review Section 0701:Biology at molecular to cellular levels, and related fields
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

Nozawa Kayo  東京大学, 定量生命科学研究所, 助教 (10808554)

Project Period (FY) 2018-08-24 – 2020-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2019)
Budget Amount *help
¥2,990,000 (Direct Cost: ¥2,300,000、Indirect Cost: ¥690,000)
Fiscal Year 2019: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2018: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000)
Keywordsクロマチン / 転写 / RNAポリメラーゼ / RNAポリメラーゼII
Outline of Research at the Start

ヒトを構成する約2万種類のタンパク質の情報はDNAに保存されており、RNAポリメラーゼII (Pol II)の働きによってmRNAに転写され、タンパク質の設計図として機能する。しかし、設計図は必要な時に作られなければ細胞の秩序が壊れ、生命活動を維持することはできない。このPol IIの機能の「オン」、「オフ」を制御しているのが、クロマチン構造や転写メディエーター、Pol IIのC端ドメインのリン酸化パターンである。本研究では、転写反応をX線結晶構造解析を用いて可視化し、その知見を生化学実験にフィードバックすることで、原子分解能レベルで解明したいと考えている。

Outline of Final Research Achievements

Mediator binds to the promoter through the C-terminal region of RNA polymerase II (Pol II CTD) and presents the CTD to TFIIH kinase to induce transcription. In this study, we constructed a fusion protein of Med-complex and CTD and performed small-angle X-ray scattering analysis to visualize the structural transformation of Mediator that occurred at the initiation of transcription. It was observed that CTD detach from Mediator upon phosphorylation. Furthermore, to test if Mediator stimulates Pol II CTD phosphorylation by TFIIH kinase, Pol II and TFIIH kinase were successfully expressed, purified, and subjected to the kinase assay. It was observed that the recombinantly prepared Mediator protein increased the phosphorylation efficiency by 10-fold.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

ヒトを構成する約2万種類のタンパク質の情報はDNAに保存され、Pol IIの働きでmRNAに転写されることで初めて、その設計図として機能する。しかし、設計図は必要な時に作られなければ細胞の秩序が壊れ、生命活動を維持することはできない。このPol IIの機能の「オン」、「オフ」を制御しているのが、Medによって誘起されるクロマチンの構造変換やPol II CTDのリン酸化パターンである。本研究で得られた成果をさらに生化学実験にフィードバックすることで、転写が関わる細胞分裂の異常や癌化についても、新たな知見が得られると期待される。

Report

(3 results)
  • 2019 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2018 Annual Research Report
  • Research Products

    (4 results)

All 2019 2018

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results,  Open Access: 1 results) Presentation (2 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Invited: 2 results) Book (1 results)

  • [Journal Article] Crystallographic analysis of the overlapping dinucleosome as a novel chromatin unit2018

    • Author(s)
      Nishimura Masahiro、Nozawa Kayo、Kurumizaka Hitoshi
    • Journal Title

      Biophysics and Physicobiology

      Volume: 15 Issue: 0 Pages: 251-254

    • DOI

      10.2142/biophysico.15.0_251

    • NAID

      130007535611

    • ISSN
      2189-4779
    • Related Report
      2018 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] Structural and functional basis of the Mediator complex in the eukaryotic transcriptional system2019

    • Author(s)
      Kayo Nozawa
    • Organizer
      第57回日本生物物理学会年会
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] Crystallographic and biochemical studies of the Mediator complex provide an insight into the phosphorylation mechanism of the RNA polymerase II CTD.2019

    • Author(s)
      Kayo Nozawa
    • Organizer
      16th Conference of the Asian Crystallographic Association (AsCA2019)
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Book] あなたのタンパク質精製、大丈夫ですか?2018

    • Author(s)
      胡桃坂 仁志、有村 泰宏
    • Total Pages
      186
    • Publisher
      羊土社
    • ISBN
      9784758122382
    • Related Report
      2018 Annual Research Report

URL: 

Published: 2018-08-27   Modified: 2024-03-26  

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