• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to previous page

Identification of candidate tumor marker genes for pancreatic ductal adenocarcinoma by NGS-HiCEP method

Research Project

Project/Area Number 19K21342
Project/Area Number (Other) 18H06247 (2018)
Research Category

Grant-in-Aid for Research Activity Start-up

Allocation TypeMulti-year Fund (2019)
Single-year Grants (2018)
Review Section 0905:Surgery of the organs maintaining homeostasis and related fields
Research InstitutionNational Defense Medical College

Principal Investigator

Takao Mikiya  防衛医科大学校(医学教育部医学科進学課程及び専門課程、動物実験施設、共同利用研究施設、病院並びに防衛, 外科学, 助教 (70821924)

Project Period (FY) 2018-08-24 – 2021-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2020)
Budget Amount *help
¥2,990,000 (Direct Cost: ¥2,300,000、Indirect Cost: ¥690,000)
Fiscal Year 2019: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2018: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000)
Keywords膵癌 / 早期診断 / 予後マーカー / 包括的高感度転写産物プロファイリング:HiCEP / 次世代シークエンサー:NGS
Outline of Research at the Start

膵癌は他の癌と比較して悪性度が高く、極端に治療成績が悪いため、診断や治療効果の向上に繋げる技術開発が求められている。本研究では膵癌患者の手術で切除した組織に加えて手術前後の採血検体を採取し、遺伝子の発現を解析することを目的としている。日本発の技術である包括的高感度転写産物プロファイリング法(High Coverage Expression Profiling: HiCEP)を活用し、さらに次世代シークエンサーを組み合わせた新規の高感度解析法により、身体への負担の少ない早期診断マーカー等を探索する。

Outline of Final Research Achievements

High coverage expression profiling (HiCEP) is an AFLP-based comprehensive gene expression analysis invented in Japan, which can efficiently detect an especially low amount of mRNA with high sensitivity and reliability, and which enables us to analyze mRNA expression much more quantitatively and reproducibly. On the other hand, it requires complicated processes to obtain the sequence information of the detected peaks. In order to solve this problem, we established the gene expression database of human cancers by combining the next-generation sequencing (NGS) with HiCEP method.
We applied the NGS combined HiCEP method to analyze pancreatic ductal adenocarcinoma(PDAC) cases in this study, and succeeded in establishing the gene expression database of PDAC and in identifying candidate tumor marker genes.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

膵癌は他の癌と比較して悪性度が高く、極端に予後不良な「21世紀に残された消化器癌」と言われ、その対策は急務である。膵癌細胞の分子的背景は不明な点が多く、その特性を解析して非侵襲的早期診断や治療効果の向上に繋げる技術開発が求められている。
本研究では膵癌患者の手術検体組織に加えて、手術前後に末梢血検体を採取し、日本発の技術である包括的高感度転写産物プロファイリング(High Coverage Expression Profiling: HiCEP)法を活用し、かつ次世代シークエンサーを組み合わせた新規の高感度解析法により、膵癌に特異的な候補遺伝子を同定できた。今後臨床応用に向けて解析を進めている。

Report

(4 results)
  • 2020 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2019 Research-status Report
  • 2018 Annual Research Report
  • Research Products

    (18 results)

All 2021 2020 2019 2018

All Journal Article (1 results) (of which Open Access: 1 results) Presentation (17 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results)

  • [Journal Article] The 150 most important questions in cancer research and clinical oncology series: questions 94-1012018

    • Author(s)
      Cancer Communications
    • Journal Title

      Cancer Communications

      Volume: 38 Issue: 1 Pages: 3-4

    • DOI

      10.1186/s40880-018-0341-9

    • Related Report
      2018 Annual Research Report
    • Open Access
  • [Presentation] HiCEP法と次世代シークエンシングを併用した膵癌マーカーの同定2021

    • Author(s)
      前原一輝, 高尾幹也, 松尾洋孝, 荒木良子, 清水聖子, 中山昌喜, 瀧端康博, 永生高広, 北村陽典, 川口真, 河村優輔, 森友理乃, 田中里沙, 安倍真澄, 伊藤敬一, 四ノ宮成祥, 岸庸二
    • Organizer
      第66回防衛衛生学会, 2020
    • Related Report
      2020 Annual Research Report
  • [Presentation] Development of a gene expression database of pancreatic ductal adenocarcinoma cases by NGS-combined HiCEP to identify tumor markers2020

    • Author(s)
      Takao M, Matsuo H, Araki R, Shimizu S, Kawaguchi M, Nakayama A, Kitamura Y, Kawamura Y, Maehara K, Abe M, Ito K, Hoshikawa M, Yamamoto J, Kishi Y, Shinomiya N
    • Organizer
      American Association for Cancer Research (AACR) 2020.
    • Related Report
      2020 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Identification of candidate tumor marker genes for pancreatic ductal adenocarcinoma tissue by NGS-HiCEP method2020

    • Author(s)
      Takao M, Matsuo H, Shimizu S, Kitamura Y, Kawaguchi M, Nakayama A, Kawamura Y, Ito K, Kishi Y, Shinomiya N
    • Organizer
      第79回日本癌学会学術総会, 2020
    • Related Report
      2020 Annual Research Report
  • [Presentation] The use of NGS-HiCEP to build an extensive renal cell carcinoma gene expression database for identifying tumor markers2020

    • Author(s)
      Shimizu S, Matsuo H, Kawaguchi M, Nakayama A, Takao M, Kitamura Y, Tsujita Y, Kawamura Y, Ito K, Shinomiya N
    • Organizer
      第79回日本癌学会学術総会, 2020
    • Related Report
      2020 Annual Research Report
  • [Presentation] 次世代シークエンシングの併用によるHiCEP法(NGS-HiCEP法)の開発―腎癌組織の網羅的遺伝子発現データベースの構築と腎癌マーカーの同定2020

    • Author(s)
      前原一輝, 川口真, 松尾洋孝, 荒木良子, 清水聖子, 高尾幹也, 中山昌喜, 北村陽典, 辻田裕二郎, 河村優輔, 堀江美音, 藤原慎, 湯野川春信, 安倍真澄, 伊藤敬一, 四ノ宮成祥
    • Organizer
      第38回日本ヒト細胞学会学術集会(高知), 2020
    • Related Report
      2020 Annual Research Report
  • [Presentation] Development of a gene expression database of pancreatic ductal adenocarcinoma cases by NGS-combined HiCEP to identify tumor markers2020

    • Author(s)
      高尾幹也、松尾洋孝、荒木良子、清水聖子、川口真、中山昌喜、北村陽典、河村優輔、前原一輝、安倍真澄、伊藤敬一、星川真有美、山本順司、岸庸二、四ノ宮成祥
    • Organizer
      AACR Annual Meeting 2020
    • Related Report
      2019 Research-status Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Identification of candidate tumor marker genes for pancreatic ductal adenocarcinoma tissue by NGS-HiCEP method2020

    • Author(s)
      高尾幹也、松尾洋孝、清水聖子、北村陽典、川口真、中山昌喜、河村優輔、伊藤敬一、岸庸二、四ノ宮成祥
    • Organizer
      第79回日本癌学会学術総会
    • Related Report
      2019 Research-status Report
  • [Presentation] Development of a gene expression database of renal cell carcinoma cases by NGS-combined HiCEP to identify tumor markers.2019

    • Author(s)
      川口真、松尾洋孝、荒木良子、清水聖子、高尾幹也、中山昌喜、北村陽典、安倍真澄、伊藤敬一、四ノ宮成祥
    • Organizer
      AACR Annual Meeting 2019
    • Related Report
      2019 Research-status Report 2018 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] HiCEP法と次世代シークエンサーを併用した腎癌組織の遺伝子発現データベースの構築と腎癌マーカーの同定2019

    • Author(s)
      川口真、松尾洋孝、荒木良子、清水聖子、高尾幹也、中山昌喜、北村陽典、湯野川春信、安倍真澄、四ノ宮成祥、伊藤敬一
    • Organizer
      第107回日本泌尿器科学会総会
    • Related Report
      2019 Research-status Report 2018 Annual Research Report
  • [Presentation] Development of the gene expression database of pancreatic ductal adenocarcinoma cases by NGS combined HiCEP method to identify the tumor markers2019

    • Author(s)
      高尾幹也、松尾洋孝、荒木良子、清水聖子、川口真、中山昌喜、湯野川春信、安倍真澄、伊藤敬一、星川真有美、青笹季文、山本順司、四ノ宮成祥
    • Organizer
      第31回日本肝胆膵外科学会・学術集会
    • Related Report
      2019 Research-status Report
  • [Presentation] Development of a gene expression database of pancreatic ductal adenocarcinoma cases to identify tumor markers2019

    • Author(s)
      高尾幹也、松尾洋孝、清水聖子、川口真、中山昌喜、河村優輔、伊藤敬一、岸庸二、四ノ宮成祥
    • Organizer
      第78回日本癌学会学術総会
    • Related Report
      2019 Research-status Report
  • [Presentation] HiCEP法と次世代シークエンサーを併用した新規発現解析法による膵癌の遺伝子発現データベースの構築と膵癌マーカーの同定2019

    • Author(s)
      高尾幹也、松尾洋孝、荒木良子、清水聖子、川口真、中山昌喜、河村優輔、青柳有香、前原一輝、湯野川春信、安倍真澄、伊藤敬一、岸庸二、四ノ宮成祥
    • Organizer
      第37回日本ヒト細胞学会学術集会
    • Related Report
      2019 Research-status Report
  • [Presentation] NGS-HiCEP法を活用した膵癌発現データベースの構築と膵癌マーカー候補遺伝子の探索2019

    • Author(s)
      高尾幹也、松尾洋孝、荒木良子、清水聖子、中岡博史、川口真、中山昌喜、河村優輔、湯野川春信、安倍真澄、伊藤敬一、星川真有美、山本順司、岸庸二、四ノ宮成祥
    • Organizer
      第30回日本疫学会学術総会
    • Related Report
      2019 Research-status Report
  • [Presentation] 次世代シークエンサーを併用したHiCEP法による腎癌の遺伝子発現データベースの構築と腎癌マーカーの同定2019

    • Author(s)
      川口真、松尾洋孝、荒木良子、清水聖子、高尾幹也、中山昌喜、湯野川春信、安倍真澄、四ノ宮成祥、伊藤敬一
    • Organizer
      第28回泌尿器科分子・細胞研究会
    • Related Report
      2018 Annual Research Report
  • [Presentation] Development of the gene expression database of pancreatic ductal adenocarcinoma cases by NGS combined HiCEP method to identify the tumor markers.2019

    • Author(s)
      高尾幹也、松尾洋孝、荒木良子、清水聖子、川口真、中山昌喜、湯野川春信、安倍真澄、伊藤敬一、星川真有美、青笹季文、山本順司、四ノ宮Development of the gene expression database of pancreatic ductal adenocarcinoma cases by NGS combin成祥
    • Organizer
      第31回日本肝胆膵外科学会・学術集会
    • Related Report
      2018 Annual Research Report
  • [Presentation] Development of a gene expression database of pancreatic ductal adenocarcinoma cases to identify tumor markers.2019

    • Author(s)
      高尾幹也、松尾洋孝、清水聖子、川口真、中山昌喜、河村優輔、伊藤敬一、岸庸二、四ノ宮成祥
    • Organizer
      第78回日本癌学会学術総会
    • Related Report
      2018 Annual Research Report
  • [Presentation] Development of the gene expression database of renal cell carcinoma cases to identify the tumor markers.2018

    • Author(s)
      川口真、松尾洋孝、清水聖子、高尾幹也、中山昌喜、山本順司、伊藤敬一、四ノ宮成祥
    • Organizer
      第77回日本癌学会学術総会
    • Related Report
      2018 Annual Research Report

URL: 

Published: 2018-08-27   Modified: 2024-03-26  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi