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An analytic method for the intracellular domain of cell membranes by microfluidic disruption

Research Project

Project/Area Number 19K22079
Research Category

Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)

Allocation TypeMulti-year Fund
Review Section Medium-sized Section 27:Chemical engineering and related fields
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

Yamaguchi Satoshi  東京大学, 先端科学技術研究センター, 准教授 (80398106)

Project Period (FY) 2019-06-28 – 2022-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2021)
Budget Amount *help
¥6,500,000 (Direct Cost: ¥5,000,000、Indirect Cost: ¥1,500,000)
Fiscal Year 2021: ¥2,080,000 (Direct Cost: ¥1,600,000、Indirect Cost: ¥480,000)
Fiscal Year 2020: ¥3,120,000 (Direct Cost: ¥2,400,000、Indirect Cost: ¥720,000)
Fiscal Year 2019: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Keywords膜タンパク質 / 1細胞解析 / 細胞膜 / 細胞内小器官 / 光応答性材料 / 細胞固定化剤 / 分子イメージング / 細胞内膜タンパク質 / GPCR / 光応答性細胞固定化剤 / マイクロ流路 / 免疫染色法 / 電子顕微鏡観察 / 光分解性材料 / ヒドロゲル薄膜 / マイクロ流体 / 細胞破砕 / タンパク質間相互作用
Outline of Research at the Start

本研究では、マイクロ流体のせん断応力を利用して基板上に並べた細胞を瞬時に破砕することによって、直前まで生きていた細胞の細胞膜の裏側表面に解析用の分子プローブや薬剤ライブラリーを作用させる技術を開発する。本手法では、細胞膜裏側の分子を1細胞レベルで定量的に調べることが出来、未知であった分子システムの作用機序についての理解が深まり、学術上の発展につながることが期待される。また、細胞の表現型のみを指標とした網羅的薬剤探索戦略から、細胞膜裏側表面の分子解析に基づいた合理的な分子設計へと創薬戦略に変革をもたらすことも期待される。

Outline of Final Research Achievements

We have developed a technique for high-throughput single-cell analysis of membrane proteins both on the inside of cell membranes and on the surface of intracellular organelles using microfluidic channels modified with a photo-responsive cell immobilization reagent. First, single-cell arrays were constructed at the bottom of the channels by irradiating light patterns onto the surface. The immobilized cells were disrupted by high-speed pumping in the channel, achieving efficient construction of arrays of the bottom cell membrane (cell membrane sheet). Electron microscopic observation revealed various vesicles and cytoskeletal fibers on these sheets. In addition, phosphorylation of intracellular domains of receptors involved in cell motility could be detected on the sheets. By narrowing the cell intervals, we found that only the cell parietal can be selectively disrupted, leading to cell disruption with remaining intracellular organelles intact.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

細胞膜の内側や細胞内小器官表面に存在する膜タンパク質は、様々な生命現象や疾患に関わる。しかし、細胞膜透過性の無い抗体などの解析ツールや薬剤ライブラリを生きたままの状態で作用させられなかった。また、膜タンパク質への修飾や結合を1細胞レベルで解析出来なかった。本研究成果により、直前まで生きていた細胞の細胞膜の裏側や細胞内小器官表面に対し、界面活性剤や有機溶媒などで膜構造を壊すことなく、分子を作用させられるようになった。今後は、この革新的な技術によって標的膜タンパク質の修飾や局在、結合分子を可視化・同定することで、関連する分子システムの解明に貢献し、創薬標的の探索にも有効であると期待される。

Report

(3 results)
  • 2021 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2019 Research-status Report
  • Research Products

    (15 results)

All 2022 2021 2019

All Journal Article (5 results) (of which Peer Reviewed: 3 results) Presentation (9 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results,  Invited: 3 results) Patent(Industrial Property Rights) (1 results)

  • [Journal Article] Photo‐Degradable Protein‐Polymer Hybrid Shells for Caging Living Cells2022

    • Author(s)
      Yamaguchi Satoshi、Chujo Kazuki、Ohashi Noriyuki、Minamihata Kosuke、Nagamune Teruyuki
    • Journal Title

      Chemistry ? A European Journal

      Volume: 28 Issue: 12

    • DOI

      10.1002/chem.202103941

    • Related Report
      2021 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Sterically Bulky Caging of Transferrin for Photoactivatable Intracellular Delivery2021

    • Author(s)
      Yamaguchi, S.; Takamori, S.; Yamamoto, K.; Ishiwatari, A.; Minamihata, K.; Yamada, E.; Okamoto, A.; Nagamune, T.
    • Journal Title

      Bioconjugate Chem.

      Volume: 32 Issue: 8 Pages: 1535-1540

    • DOI

      10.1021/acs.bioconjchem.1c00159

    • Related Report
      2021 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] 光応答性PEG 脂質を用いた1 細胞精密分離2021

    • Author(s)
      山平真也, 山口哲志, 長棟輝行
    • Journal Title

      分離技術

      Volume: 51 Pages: 5-5

    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Journal Article] 細胞の付着と脱離を光制御できる細胞培養基板2021

    • Author(s)
      山口哲志
    • Journal Title

      バイオインダストリー

      Volume: 38 Pages: 26-36

    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Journal Article] Photo-responsive materials with strong cell trapping ability for light-guided manipulation of nonadherent cells2019

    • Author(s)
      Jarzebska, N. A.; Yamaguchi, S.; Izuta, S.; Kosaka, T.; Yamahira, S.; Nagamune, T.; Okamoto, A.
    • Journal Title

      Biomater. Sci.

      Volume: 7 Issue: 11 Pages: 4514-4518

    • DOI

      10.1039/c9bm01200a

    • Related Report
      2019 Research-status Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 細胞膜のマイクロ流体剥離技術を用いた細胞内1細胞解析2022

    • Author(s)
      山口哲志, 梅田侑生, 山平真也, 岡本晃充
    • Organizer
      化学工学会第87年会
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Presentation] 細胞の接着と脱離を光制御できる細胞培養基材2021

    • Author(s)
      山口哲志
    • Organizer
      JST新技術説明会
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] 細胞内動的分子標識を志向したケージド直鎖アルキンの開発2021

    • Author(s)
      山口哲志, 中村聖, 梅田侑生, 岡本晃充
    • Organizer
      第31回バイオ高分子シンポジウム
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Presentation] 光応答性細胞固定表面を用いた免疫細胞とがん細胞の単一細胞間相互作用観察2021

    • Author(s)
      小阪高広, 山口哲志, 山平真也, 岡本晃充
    • Organizer
      第70回高分子討論会
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Presentation] Photo-activatable poly(ethylene glycol)-lipid surface for single-cell manipulation2021

    • Author(s)
      Shinya Yamahira, Satoshi Yamaguchi, Yuji Heike, Teruyuki Nagamune
    • Organizer
      Pacifichem 2021
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Photo-reactive surface for the single cell analysis of intercellular communication2021

    • Author(s)
      Takahiro Kosaka, Satoshi Yamaguchi, Shin Izuta, Shinya Yamahira, Akimitsu Okamoto
    • Organizer
      Pacifichem 2021
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Photo-responsive cell immobilization reagents for cell manipulation on solid phase2019

    • Author(s)
      Yamaguchi Satoshi
    • Organizer
      The 18th Asian Pacific Confederation of Chemical Engineering Congress (APCChE 2019)
    • Related Report
      2019 Research-status Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Photo-responsive cell immobilization tools for single-cell manipulation2019

    • Author(s)
      Yamaguchi Satoshi
    • Organizer
      第57回日本生物物理学会年会
    • Related Report
      2019 Research-status Report
    • Invited
  • [Presentation] 光応答性細胞固定化剤の設計と創出2019

    • Author(s)
      山口哲志
    • Organizer
      日本化学会第100春季年会
    • Related Report
      2019 Research-status Report
    • Invited
  • [Patent(Industrial Property Rights)] 生体物質固定化材料2019

    • Inventor(s)
      山口哲志, 上原廉二朗, 岡本晃充
    • Industrial Property Rights Holder
      国立大学法人東京大学
    • Industrial Property Rights Type
      特許
    • Filing Date
      2019
    • Related Report
      2019 Research-status Report

URL: 

Published: 2019-07-04   Modified: 2024-12-25  

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