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Dynamical non-adiabatic theory of chemical bond with localized electron wave packet with valence-bond spin-coupling

Research Project

Project/Area Number 19K22173
Research Category

Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)

Allocation TypeMulti-year Fund
Review Section Medium-sized Section 32:Physical chemistry, functional solid state chemistry, and related fields
Research InstitutionTokyo Woman's Christian University

Principal Investigator

Ando Koji  東京女子大学, 現代教養学部, 教授 (90281641)

Project Period (FY) 2019-06-28 – 2023-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2022)
Budget Amount *help
¥6,370,000 (Direct Cost: ¥4,900,000、Indirect Cost: ¥1,470,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2020: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2019: ¥3,510,000 (Direct Cost: ¥2,700,000、Indirect Cost: ¥810,000)
Keywords電子ダイナミクス / 化学結合理論 / 凝縮系シミュレーション / 電子分極効果 / 強光子場 / 高次高調波発生 / 動的化学結合理論
Outline of Research at the Start

局在電子波束に立脚した新しい動的化学結合理論の確立を目指す。局在電子波束と原子価結合理論を組み合わせた独自の理論によって、分子内電子ダイナミクスを記述する手法の開発を進める。基礎理論の深化と共に、数値計算手法を効率化させて応用の可能性を広げる。原子核ダイナミクスの波束理論と組み合わせることにより、電子と原子核の非断熱結合と動的相関を記述する理論の構築を試みる。例えば、高強度レーザー場に誘起された電子ダイナミクス、金属クラスター中の水素拡散における電子とプロトンの非断熱的結合、液体水素などの量子液体における電子と軽原子の動的結合などへ応用する。

Outline of Final Research Achievements

A theory of localized electron wave packets with the valence-bond spin-coupling was developed and applied. Potential energy surfaces for electron dynamics were constructed, and high-harmonic generation spectra from LiH molecule and H and He atoms were calculated and analyzed. It was confirmed that a suitable potential surface for electron dynamics can be obtained by varying the center position and width of the wave packet, although it is a minimum basis of one wave packet per electron. New insights into the mechanism of high-harmonic generation were obtained by analyzing the wave function. As a basis for applying the localized electron wave packet method to condensed phase simulations, we developed analytical methods for molecular dynamics simulations of olfactory and taste receptor proteins and acid ionization in water.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

中心位置と幅が可変であるような局在電子波束を原子価結合法と組み合わせる理論は、本研究のオリジナルであり高度に挑戦的である。特に、波束中心位置の関数としてポテンシャルエネルギー曲面を構築することで電子ダイナミクスの解析を可能とした点は、標準的な分子軌道法では自明には得られない独創的な特徴である。原子価結合法は、PaulingやCoulsonの時代に静的な化学結合理論として定性的に見通しの良い描像を与えたが、基底関数の非直交性に由来する技術的な困難によって表舞台から退いていた。これに新たな光を当て、動的な化学結合理論として発展させることを試み、一定の成果を得たことが、本研究の学術的意義である。

Report

(5 results)
  • 2022 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2021 Research-status Report
  • 2020 Research-status Report
  • 2019 Research-status Report
  • Research Products

    (15 results)

All 2023 2022 2021 2020 2019

All Journal Article (7 results) (of which Peer Reviewed: 7 results,  Open Access: 1 results) Presentation (8 results)

  • [Journal Article] Potential energy surfaces for electron dynamics from a model of localized Gaussian wave packets with valence-bond spin-coupling: High-harmonic generation spectra from H and He atoms2023

    • Author(s)
      Ando Koji
    • Journal Title

      Chemical Physics

      Volume: 570 Pages: 111883-111883

    • DOI

      10.1016/j.chemphys.2023.111883

    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Molecular Dynamics Simulation of the Interaction between Taste Receptor Proteins and their Ligands2022

    • Author(s)
      ARAKI Kie、ANDO Koji
    • Journal Title

      Journal of Computer Chemistry, Japan

      Volume: 21 Issue: 4 Pages: 94-95

    • DOI

      10.2477/jccj.2023-0010

    • ISSN
      1347-1767, 1347-3824
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Efficient Free-Energy Calculation of Proton Transfer by Constrained Density Functional Theory and Geometrically Restrained Molecular Dynamics Simulation2021

    • Author(s)
      Joutsuka Tatsuya、Ando Koji
    • Journal Title

      Chemistry Letters

      Volume: - Issue: 7 Pages: 1325-1328

    • DOI

      10.1246/cl.210132

    • NAID

      130008065512

    • Related Report
      2021 Research-status Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Tunneling matrix element and tunneling pathways of protein electron transfer calculated with a fragment molecular orbital method2020

    • Author(s)
      Kitoh-Nishioka Hirotaka、Shigeta Yasuteru、Ando Koji
    • Journal Title

      The Journal of Chemical Physics

      Volume: 153 Issue: 10 Pages: 104104-104104

    • DOI

      10.1063/5.0018423

    • Related Report
      2020 Research-status Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Constrained Density Functional Theory Molecular Dynamics Simulation of Deprotonation in Aqueous Silicic Acid2020

    • Author(s)
      Joutsuka Tatsuya、Ando Koji
    • Journal Title

      The Journal of Physical Chemistry B

      Volume: 124 Issue: 38 Pages: 8323-8330

    • DOI

      10.1021/acs.jpcb.0c05096

    • Related Report
      2020 Research-status Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Molecular Dynamics Simulation and Binding Analysis of Olfactory Receptor Protein mOR-EG and Odorant Molecule Eugenol2020

    • Author(s)
      OKAMOTO Chisato、ANDO Koji
    • Journal Title

      Journal of Computer Chemistry, Japan

      Volume: 19 Issue: 4 Pages: 161-163

    • DOI

      10.2477/jccj.2021-0005

    • NAID

      130008024193

    • ISSN
      1347-1767, 1347-3824
    • Related Report
      2020 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Single-electron quantum dynamics in high-harmonic generation spectrum from LiH molecule: Analysis of potential energy surfaces for electrons constructed from a model of localized Gaussian wave packets with valence-bond spin-coupling2020

    • Author(s)
      Ando Koji
    • Journal Title

      The Journal of Chemical Physics

      Volume: 152 Issue: 8 Pages: 084306-084306

    • DOI

      10.1063/1.5139079

    • Related Report
      2019 Research-status Report
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  • [Presentation] 分子動力学計算による味覚受容体タンパク質とリガンドの相互作用の解析2023

    • Author(s)
      荒木貴絵, 安藤耕司
    • Organizer
      日本化学会第103春季年会2023
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      荒木貴絵, 安藤耕司
    • Organizer
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      荒木貴絵, 安藤耕司
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      荒木貴絵、安藤耕司
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      日本化学会春季年会
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      荒木貴絵、安藤耕司
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      日本コンピューター化学会秋季年会
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      岡本千怜、安藤耕司
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      日本化学会春季年会
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  • [Presentation] 分子動力学シミュレーションによるmOR-EGと香り分子の結合解析2020

    • Author(s)
      岡本千怜、安藤耕司
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      日本コンピューター化学会秋季年会
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      2020 Research-status Report
  • [Presentation] 分子動力学法を用いた嗅覚受容体タンパク質と香り分子の相互作用についての研究2019

    • Author(s)
      岡本千怜, 安藤耕司
    • Organizer
      日本コンピューター化学会秋季年会
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      2019 Research-status Report

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Published: 2019-07-04   Modified: 2024-01-30  

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