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Development of the fluorescent probe technology for live-cell super-resolution imaging

Research Project

Project/Area Number 19K22247
Research Category

Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)

Allocation TypeMulti-year Fund
Review Section Medium-sized Section 37:Biomolecular chemistry and related fields
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

Hirose Kenzo  東京大学, 大学院医学系研究科(医学部), 教授 (00292730)

Project Period (FY) 2019-06-28 – 2021-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2020)
Budget Amount *help
¥6,500,000 (Direct Cost: ¥5,000,000、Indirect Cost: ¥1,500,000)
Fiscal Year 2020: ¥2,860,000 (Direct Cost: ¥2,200,000、Indirect Cost: ¥660,000)
Fiscal Year 2019: ¥3,640,000 (Direct Cost: ¥2,800,000、Indirect Cost: ¥840,000)
Keywords超解像顕微鏡 / 蛍光プローブ / 生細胞超解像イメージング
Outline of Research at the Start

STORM(StochasticOpticalReconstructionMicroscopy)法は高い空間分解能を有する超解像顕微鏡法であるが、生体親和性が低く、生細胞標本へは適用できない。本研究では、生細胞でSTORM法を可能にする蛍光プローブの開発を目的とする。ここでは、消光団と蛍光分子からなる非蛍光性の化合物(蛍光明滅プローブ)が、抗消光団一本鎖抗体と結合することで蛍光性となる現象を利用し、高速の蛍光明滅を実現し、生細胞でのSTORM法を実現する。次に、この系を用いて神経細胞でのライブセルSTORMイメージングを実施し、本研究で開発した技術の有用性を実証する。

Outline of Final Research Achievements

Super-resolution microscopy enables visualization of the fine arrangement of intracellular molecules and the structure of intracellular organelles with a high spatial resolution (<200 nm). However, since it is difficult to induce the blinking of fluorescent molecules required for the STORM method in living cells, applying the STORM method to living cells has been delayed. In order to measure nanoscale-molecular arrangement in living cells, we developed a super-resolution microscopy technology based on the single-molecule localization method. For fast blinking of fluorescent molecules labeled on target molecules, required for single-molecule localization methods, we developed a turn-on type fluorescence tagging technique named the DeQODE system. We achieved super-resolution imaging of organelles and functional molecules using the DeQODE system in living cells.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

細胞機能を制御する分子メカニズムをナノメートルスケールの細胞内の構造体や分子複合体に着目して理解する必要性が高まってきたが、それに叶う生細胞に適用できる超解像イメージング技術は未整備である。特に、蛍光プローブ技術については、既存の技術の改変では生細胞での超解像イメージングには全く対応できない。本研究の成果によって、抗体を用いた低分子蛍光分子の蛍光ON/OFFスイッチングを利用して生細胞での分子のナノレベルの配置を経時的に観察できる技術をベースとしたライブセル超解像イメージング技術をが可能になり、今後の生物学研究で求められるナノスケールの精密計測に貢献することができる。

Report

(3 results)
  • 2020 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2019 Research-status Report
  • Research Products

    (13 results)

All 2021 2020 2019 Other

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 2 results,  Open Access: 2 results) Presentation (10 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Invited: 2 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Real-time in vivo imaging of extracellular ATP in the brain with a hybrid-type fluorescent sensor2020

    • Author(s)
      Kitajima N, Takikawa K, Sekiya H, Satoh K, Asanuma D, Sakamoto H, Takahashi S, Hanaoka K, Urano Y, Namiki S, Iino M, Hirose K
    • Journal Title

      eLife

      Volume: 9 Pages: 1-18

    • DOI

      10.7554/elife.57544

    • Related Report
      2020 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Single-Molecule Localization by Voxel-Wise Regression Using Convolutional Neural Network.2020

    • Author(s)
      Aritake T, Hino H, Namiki S, Asanuma D, Hirose K, Murata N
    • Journal Title

      Results in Optics

      Volume: 1 Pages: 100019-100019

    • DOI

      10.1016/j.rio.2020.100019

    • Related Report
      2020 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] 再生可能な蛍光ラベリングを導入した長時間一分子トラッキング技術の開発2021

    • Author(s)
      小林新九郎、並木繁行、浅沼大祐、廣瀬謙造
    • Organizer
      第94回日本薬理学会年会
    • Related Report
      2020 Annual Research Report
  • [Presentation] 脳虚血における細胞外ATP動態の生体内蛍光イメージング2021

    • Author(s)
      北島奈美、瀧川健司、関谷敬、浅沼大祐、坂本寛和、並木繁行、飯野正光、廣瀬謙造
    • Organizer
      第94回日本薬理学会年会
    • Related Report
      2020 Annual Research Report
  • [Presentation] 消光団を利用したケミカルタグ技術の開発とライブセル超解像イメージングへの応用2021

    • Author(s)
      浅沼大祐、並木繁行、廣瀬謙造
    • Organizer
      第94回日本薬理学会年会
    • Related Report
      2020 Annual Research Report
  • [Presentation] Quantal glutamate release organized by supramolecular assembly at presynaptic terminals2020

    • Author(s)
      Kenzo Hirose
    • Organizer
      第97回日本生理学会大会
    • Related Report
      2019 Research-status Report
  • [Presentation] Optical measurement of glutamate release from multiple ribbon-type synapses at the terminal of goldfish retinal bipolar cell2020

    • Author(s)
      大島知子、坂本寛和 、並木繁行 、廣瀬謙造 、立花政夫 、鷹合秀輝
    • Organizer
      第97回日本生理学会大会
    • Related Report
      2019 Research-status Report
  • [Presentation] Visualization of Ca2+ release and filling mechanisms in the endoplasmic reticulum of astrocytes2020

    • Author(s)
      大久保洋平、飯野 正光、廣瀬 謙造
    • Organizer
      第93回日本薬理学会年会
    • Related Report
      2019 Research-status Report
  • [Presentation] Establishment of a new method for long-term single-molecule fluorescence imaging and its application to synaptic molecules2020

    • Author(s)
      小林新九郎、大久保洋平、並木繁行、浅沼大祐、廣瀬謙造
    • Organizer
      第93回日本薬理学会年会
    • Related Report
      2019 Research-status Report
  • [Presentation] Development of a novel chemical tag tool for caicium imaging by near-infrared fluorescence2020

    • Author(s)
      磯野有希、浅沼大祐、大久保洋平、並木繁行、廣瀬謙造
    • Organizer
      第93回日本薬理学会年会
    • Related Report
      2019 Research-status Report
  • [Presentation] Molecular organization underlying presynaptic function2019

    • Author(s)
      Kenzo Hirose
    • Organizer
      Core-to-Core Program "Understanding Synapses-from molecules to function"
    • Related Report
      2019 Research-status Report
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Synaptic release sites studied by g;utamate imaging techniques and supreresolution microscopy2019

    • Author(s)
      Kenzo Hirose
    • Organizer
      Ribbon Synapses Symposium 2019
    • Related Report
      2019 Research-status Report
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Remarks] 東京大学大学院医学系研究科機能生物学専攻細胞分子薬理学分野

    • URL

      http://www.pharmacol.m.u-tokyo.ac.jp/

    • Related Report
      2019 Research-status Report

URL: 

Published: 2019-07-04   Modified: 2022-01-27  

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