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Functional analyses of endogenous retroviruses expressed in melanoma and their application in veterinary clinical practice.

Research Project

Project/Area Number 19K22365
Research Category

Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)

Allocation TypeMulti-year Fund
Review Section Medium-sized Section 42:Veterinary medical science, animal science, and related fields
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

Miyazawa Takayuki  京都大学, ウイルス・再生医科学研究所, 准教授 (80282705)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 水野 拓也  山口大学, 共同獣医学部, 教授 (90398826)
中川 草  東海大学, 医学部, 講師 (70510014)
Project Period (FY) 2019-06-28 – 2022-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2021)
Budget Amount *help
¥6,240,000 (Direct Cost: ¥4,800,000、Indirect Cost: ¥1,440,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,950,000 (Direct Cost: ¥1,500,000、Indirect Cost: ¥450,000)
Fiscal Year 2020: ¥2,210,000 (Direct Cost: ¥1,700,000、Indirect Cost: ¥510,000)
Fiscal Year 2019: ¥2,080,000 (Direct Cost: ¥1,600,000、Indirect Cost: ¥480,000)
Keywords内在性レトロウイルス / イヌ / 口腔悪性黒色腫 / 腫瘍マーカー / メラノーマ / がん治療 / 診断マーカー / RNA-seq
Outline of Research at the Start

メラノーマは転移性が高く、早期診断系や抗がん治療の開発が求められている。ヒトやマウスのメラノーマでは、内在性レトロウイルス(ERV)が活性化し、ウイルス様粒子を放出していることが明らかとなっている。このようなERV粒子は診断マーカーや治療ターゲットとしても有望である。本研究課題では、独自の先進的ERVデータベースを使用することで、ERVの網羅的解析を実施し、ERVを標的とした新規診断法の開発とその獣医臨床への応用検討を行う。また本研究では、メラノーマの腫瘍免疫におけるERV粒子の機能解明を行い、治療ターゲットとしての検証を実施する。

Outline of Final Research Achievements

Endogenous retroviruses (ERVs) are remnants of ancestral retroviruses that infected host germ cells in the past. Most ERVs are thought to be non-functional elements, but some ERVs retain open reading frames (ORFs) capable of expressing proteins. The proteins encoded by ERV-ORFs have potential roles in oncogenesis; however, studies on mammals other than humans and mice are limited. Here, we identified ERV-derived genes expressed in canine oral malignant melanoma (OMM). We identified 11 ERV-derived genes in our OMM samples. Differential expression gene analysis revealed that four ERV-derived genes (PEG10, LOC102155597, and two newly identified genes) were upregulated in OMM compared to healthy tissues.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

今回の研究では、サンプル数が少ないことと、十分にデザインされた対照群がないことで、いくつかの限界がある。これらは、サンプル収集が飼い犬の病院での手術に依存するという避けられない状況に一部起因している。さらに、RNA-seq解析で同定された転写産物およびタンパク質の発現は、免疫組織学的に検証されていない。しかし、4つのERV由来遺伝子(PEG10、LOC111094052、2つのfragmented-ORF遺伝子)がイヌのOMMで発現していることが明確に示された。これらの結果は、ERVのコピー数が比較的少ないイヌにおいても、ヒトやマウスと同様のERV由来遺伝子が発現していることを示している。

Report

(4 results)
  • 2021 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2020 Research-status Report
  • 2019 Research-status Report
  • Research Products

    (9 results)

All 2021 2020 2019

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 3 results,  Open Access: 1 results) Presentation (5 results) Book (1 results)

  • [Journal Article] Systematic Identification of Endogenous Retroviral Protein-Coding Genes Expressed in Canine Oral Malignant Melanoma2021

    • Author(s)
      Kitao Koichi、Sumiyoshi Aoi、Nakagawa So、Matsumoto Yuki、Mizuno Takuya、Miyazawa Takayuki
    • Journal Title

      Frontiers in Virology

      Volume: 1 Pages: 1-11

    • DOI

      10.3389/fviro.2021.785678

    • Related Report
      2021 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Persistent Infection of Simian Foamy Virus Derived from the Japanese Macaque Leads to the High-Level Expression of microRNA that Resembles the miR-1 microRNA Precursor Family2020

    • Author(s)
      Hashimoto-Gotoh Akira、Kitao Koichi、Miyazawa Takayuki
    • Journal Title

      Microbes and Environments

      Volume: 35 Issue: 1 Pages: n/a

    • DOI

      10.1264/jsme2.ME19130

    • NAID

      130007789193

    • ISSN
      1342-6311, 1347-4405
    • Related Report
      2019 Research-status Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Identification of a post-transcriptional regulatory element in the human endogenous retroviral syncytin-12019

    • Author(s)
      Kitao Koichi、Tanikaga Takamasa、Miyazawa Takayuki
    • Journal Title

      Journal of General Virology

      Volume: 100 Issue: 4 Pages: 662-668

    • DOI

      10.1099/jgv.0.001238

    • Related Report
      2019 Research-status Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] イヌメラノーマで高発現する内在性レトロウイルス由来遺伝子の探索2019

    • Author(s)
      北尾晃一、水野拓也、中川草、宮沢孝幸
    • Organizer
      第42回日本分子生物学会
    • Related Report
      2019 Research-status Report
  • [Presentation] Complex retrovirus-like splicing pattern in human endogenous retrovirus W and its regulation by a cis-acting element.2019

    • Author(s)
      Kitao, K., and Miyazawa, T.
    • Organizer
      31st International Workshop on Retroviral Pathogenesis
    • Related Report
      2019 Research-status Report
  • [Presentation] Analysis of a post-transcriptional regulatory element that is necessary for endogenous retroviral envolope gene expression2019

    • Author(s)
      北尾晃一、宮沢孝幸
    • Organizer
      第67回日本ウイルス学会学術集会
    • Related Report
      2019 Research-status Report
  • [Presentation] 非病原性レトロウイルス由来のmiRNAの多様性の解析2019

    • Author(s)
      後藤暁、北尾晃一、宮沢孝幸
    • Organizer
      2019年環境ウイルス研究集会プログラム
    • Related Report
      2019 Research-status Report
  • [Presentation] Endogenous retroviral syncytin-1 retains a post-transcriptional regulatory element.2019

    • Author(s)
      Kitao, K., and Miyazawa
    • Organizer
      The 17th International Student Seminar. Kyoto
    • Related Report
      2019 Research-status Report
  • [Book] 京大 おどろきのウイルス学講義2021

    • Author(s)
      宮沢 孝幸
    • Total Pages
      224
    • Publisher
      PHP研究所
    • ISBN
      4569849342
    • Related Report
      2021 Annual Research Report

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Published: 2019-07-04   Modified: 2023-01-30  

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