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Identification of novel microbes using cocultivation with Acanthamoeba

Research Project

Project/Area Number 19K22451
Research Category

Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)

Allocation TypeMulti-year Fund
Review Section Medium-sized Section 45:Biology at organismal to population levels and anthropology, and related fields
Research InstitutionGifu University

Principal Investigator

Hiroki Nagai  岐阜大学, 大学院医学系研究科, 教授 (80222173)

Project Period (FY) 2019-06-28 – 2024-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2023)
Budget Amount *help
¥6,240,000 (Direct Cost: ¥4,800,000、Indirect Cost: ¥1,440,000)
Fiscal Year 2021: ¥2,080,000 (Direct Cost: ¥1,600,000、Indirect Cost: ¥480,000)
Fiscal Year 2020: ¥2,080,000 (Direct Cost: ¥1,600,000、Indirect Cost: ¥480,000)
Fiscal Year 2019: ¥2,080,000 (Direct Cost: ¥1,600,000、Indirect Cost: ¥480,000)
Keywordsアカントアメーバ / 寄生 / 共生 / 寄生・共生
Outline of Research at the Start

本研究は、共生菌研究や巨大ウイルス研究において宿主として利用されているアカントアメーバをモデル宿主として利用し、環境中より新たなアメーバ寄生・共生微生物を探索し、CPR細菌に代表される新規ダークマター微生物を単離・培養・解析することより「新たな生命樹観」を確立することを目的とする。本研究で発見を期待しているアメーバ寄生・共生微生物は、これまで培養不能であることなどから記載されることがなかった新規微生物である。本研究の成果は、アメーバ寄生性の病原微生物や巨大ウイルスの進化の理解を新たに方向づける可能性があるだけでなく、地球上の生命の起源や進化について一石を投じるものになると確信している。

Outline of Final Research Achievements

This study utilized Acanthamoeba, which is commonly used as a host in symbiotic microorganism and giant virus research, as a model host to explore new amoeba-parasitic and symbiotic microorganisms from the environment. Unfortunately, we were unable to isolate novel phylum "dark matter" microorganisms such as CPR bacteria. However, we were able to isolate and analyze several Actinobacteria and giant viruses that have novelty at the level of new species/genera or higher.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

本研究で単離したアメーバ寄生・共生微生物は、これまで培養不能であることなどから記載されることがなかった新規微生物である。本研究の成果は、アメーバ寄生性の病原微生物や巨大ウイルスの進化の理解を新たに方向づけるだけでなく、地球上の生命の起源や進化について新たな光明を照らすものになると期待できる。

Report

(6 results)
  • 2023 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2022 Research-status Report
  • 2021 Research-status Report
  • 2020 Research-status Report
  • 2019 Research-status Report
  • Research Products

    (14 results)

All 2022 2021 2020 2019 Other

All Int'l Joint Research (1 results) Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results) Presentation (9 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Invited: 6 results) Remarks (3 results)

  • [Int'l Joint Research] Kyungpook National University(韓国)

    • Related Report
      2019 Research-status Report
  • [Journal Article] Complete genome and bimodal genomic structure of the amoebal symbiont Neochlamydia strain S13 revealed by ultra-long reads obtained from MinION2019

    • Author(s)
      Yamagishi Junya、Hayashida Kyoko、Matsuo Junji、Okubo Torahiko、Kuroda Makoto、Nagai Hiroki、Sekizuka Tsuyoshi、Yamaguchi Hiroyuki、Sugimoto Chihiro
    • Journal Title

      Journal of Human Genetics

      Volume: 65 Issue: 1 Pages: 41-48

    • DOI

      10.1038/s10038-019-0684-3

    • Related Report
      2019 Research-status Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Identification of novel microbes using cocultivation with Acanthamoeba2022

    • Author(s)
      Hiroki Nagai
    • Organizer
      第35回日本微生物生態学会札幌大会
    • Related Report
      2022 Research-status Report
  • [Presentation] 病原菌の細胞内寄生の分子基盤とその進化2022

    • Author(s)
      永井宏樹
    • Organizer
      第50回東海乳酸菌研究会研究報告会
    • Related Report
      2021 Research-status Report
    • Invited
  • [Presentation] Identification of novel microbes using cocultivation with Acanthamoeba2022

    • Author(s)
      永井宏樹
    • Organizer
      日本農芸化学会2022年度年会
    • Related Report
      2021 Research-status Report
    • Invited
  • [Presentation] Identification of novel microbes using cocultivation with Acanthamoeba2022

    • Author(s)
      永井宏樹
    • Organizer
      日本細菌学会第95回総会
    • Related Report
      2021 Research-status Report
    • Invited
  • [Presentation] 病原菌の細胞内寄生の分子基盤とその進化2021

    • Author(s)
      永井宏樹
    • Organizer
      第49回東海乳酸菌研究会研究報告会
    • Related Report
      2020 Research-status Report
    • Invited
  • [Presentation] Vacuole manipulation by Legionella deubiqutinases2020

    • Author(s)
      久堀智子、北尾公英、永井宏樹
    • Organizer
      第93回日本細菌学会総会シンポジウム
    • Related Report
      2019 Research-status Report
    • Invited
  • [Presentation] 細菌の病原性制御システム2020

    • Author(s)
      北尾公英、久堀智子、永井宏樹
    • Organizer
      第93回日本細菌学会総会シンポジウム
    • Related Report
      2019 Research-status Report
    • Invited
  • [Presentation] 宿主SNARE pairing を操作するレジオネラエフェクターの解析2019

    • Author(s)
      北尾公英、田口馨一郎、瀬戸真太郎、新崎恒平、安藤弘樹、永井宏樹、久堀智子
    • Organizer
      第56回日本細菌学会中部支部総会
    • Related Report
      2019 Research-status Report
  • [Presentation] Legionella manipulates non-canonical SNARE pairing by the function of a bacterial deubiquitinase2019

    • Author(s)
      Tomoe Kitao, Kohei Arasaki, Shintaro Seto, Kyoichiro Taguchi, Hiroki Nagai, Tomoko Kubori
    • Organizer
      Microbial Adhesion and Signal Transduction, Gordon Research Conference
    • Related Report
      2019 Research-status Report
    • Int'l Joint Research
  • [Remarks] 研究室ウェブサイト

    • URL

      https://sites.google.com/view/nagai-lab/home

    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Remarks] 研究室webベージ

    • URL

      https://sites.google.com/view/nagai-lab/home

    • Related Report
      2022 Research-status Report 2019 Research-status Report
  • [Remarks] 研究室webページ

    • URL

      https://sites.google.com/view/nagai-lab/home

    • Related Report
      2021 Research-status Report 2020 Research-status Report

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Published: 2019-07-04   Modified: 2025-01-30  

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