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3D single molecule imaging for elucidating traffic rules of translocation through nuclear pore

Research Project

Project/Area Number 19K22520
Research Category

Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)

Allocation TypeMulti-year Fund
Review Section Medium-sized Section 48:Biomedical structure and function and related fields
Research InstitutionInstitute of Physical and Chemical Research

Principal Investigator

Mouri Kazunari  国立研究開発法人理化学研究所, 生命機能科学研究センター, 研究員 (00567513)

Project Period (FY) 2019-06-28 – 2022-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2021)
Budget Amount *help
¥6,500,000 (Direct Cost: ¥5,000,000、Indirect Cost: ¥1,500,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Fiscal Year 2020: ¥1,950,000 (Direct Cost: ¥1,500,000、Indirect Cost: ¥450,000)
Fiscal Year 2019: ¥3,250,000 (Direct Cost: ¥2,500,000、Indirect Cost: ¥750,000)
KeywordsFCS / 1分子計測 / ERK / 核膜孔通過 / ERK核移行 / 細胞内1分子計測 / 蛍光相関分光法 / 細胞内分子の交通ルール / 3次元1分子計測 / 核膜孔 / ERKシグナル伝達
Outline of Research at the Start

既存の共焦点顕微鏡に新規画像解析法を適用し高精度の多点FCSを実現し、全反射顕微鏡により核付近のような細胞深部での1msの高速1分子計測・超解像イメージングの実現に至った。これら独創的な装置を用いて、ERKシグナル伝達の律速段階である核膜孔通過のキネティクスを解明し、さらにセミインタクト細胞による核膜孔個別の履歴現象の直接観察を目指すことで、核膜孔通過の交通ルール解明のための基盤技術を開発する。

Outline of Final Research Achievements

We have previously found that the existence of stochasticity in cell fate decision may arise from an analog-digital switch mechanism in ERK nuclear translocation. The above switch mechanism is thought to originate from the cooperativity in ERK transports. The accurate quantification of intracellular molecular concentrations is essential to prove the mechanism. Since the limitations of existing methods were found, we developed a method that enables simultaneous measurement inside and outside of cell organelles by a multi-point FCS method which can be used for simple and accurate measurements, and could apply this method to some situations. In order to elucidate the actual ERK transport mechanism, we constructed a microscope capable of single-molecule measurement at the inner and outer nuclear membranes in the deep part of the cell, and succeeded in observing ERK staying on the nuclear membrane for about 100 milliseconds.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

細胞運命決定におけるERKの制御機構に異常が生じた場合、細胞はがんなどの疾患に影響を及ぼすことが知られており、非常に重要なタンパク質である。細胞内の分子の制御機構の解明には生細胞での定量化技術が不可欠であるが、これまでは高価な装置が必要であった。本研究により計測精度に問題があった簡易な装置の手法を改善することで、新たに高精度な手法の提案に至った。全反射顕微鏡は従来細胞膜の1平面のみを観察する手法であったが、本研究で核膜の内膜外膜の2平面の同時観察が実現したため、核膜孔通過のみならずエンドサイトーシスなどの局所的な3次元動態観察など、複数の用途に応用できると期待される。

Report

(4 results)
  • 2021 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2020 Research-status Report
  • 2019 Research-status Report
  • Research Products

    (9 results)

All 2022 2021 2020 2019

All Journal Article (1 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 1 results) Presentation (8 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Invited: 2 results)

  • [Journal Article] Phase separation organizes the site of autophagosome formation2020

    • Author(s)
      Fujioka Yuko、Alam Jahangir Md.、Noshiro Daisuke、Mouri Kazunari、Ando Toshio、Okada Yasushi、May Alexander I.、Knorr Roland L.、Suzuki Kuninori、Ohsumi Yoshinori、Noda Nobuo N.
    • Journal Title

      Nature

      Volume: 578 Issue: 7794 Pages: 301-305

    • DOI

      10.1038/s41586-020-1977-6

    • Related Report
      2019 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Presentation] 走査型共焦点顕微鏡を用いたFCS法によるストレス顆粒内外の分子動態観察2022

    • Author(s)
      毛利一成
    • Organizer
      第127回日本解剖学会総会・全国学術集会(オンライン)
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Presentation] 走査型共焦点顕微鏡を用いたFCS法によるストレス顆粒内外の分子動態観察2021

    • Author(s)
      毛利一成
    • Organizer
      光塾(オンライン)
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] FCSによる相分離液滴内外の分子動態観察2021

    • Author(s)
      毛利一成
    • Organizer
      第73回日本細胞生物学会大会(オンライン)
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Presentation] 走査型共焦点顕微鏡による1分子計測法とその応用2020

    • Author(s)
      毛利 一成
    • Organizer
      第72回 日本細胞生物学会大会
    • Related Report
      2020 Research-status Report
  • [Presentation] 分子モーター1分子動態追跡を目指したRevFCSの開発と応用2020

    • Author(s)
      毛利 一成
    • Organizer
      第10回分子モーター討論会
    • Related Report
      2020 Research-status Report
    • Invited
  • [Presentation] Single particle motions of axonal proteins captured by a confocal laser scanning microscopy2019

    • Author(s)
      Mouri Kazunari, Okada Yasushi
    • Organizer
      ASCB|EMBO 2019 meeting
    • Related Report
      2019 Research-status Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] A new FCS method for characterizing protein functions in living cells using a confocal laser scanning microscopy2019

    • Author(s)
      毛利 一成、岡田 康志
    • Organizer
      第19回日本蛋白質科学会年会 第71回日本細胞生物学会大会 合同年次大会
    • Related Report
      2019 Research-status Report
  • [Presentation] 共焦点レーザー走査型顕微鏡で捉えた軸索タンパクのブラウン運動2019

    • Author(s)
      毛利 一成、岡田 康志
    • Organizer
      第57回 日本生物物理学会 年会
    • Related Report
      2019 Research-status Report

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Published: 2019-07-04   Modified: 2023-01-30  

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