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Development and application of disease-specific protein targeting system

Research Project

Project/Area Number 19K22564
Research Category

Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)

Allocation TypeMulti-year Fund
Review Section Medium-sized Section 50:Oncology and related fields
Research InstitutionEhime University

Principal Investigator

Higashiyama Shigeki  愛媛大学, プロテオサイエンスセンター, 教授 (60202272)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 小川 敦司  愛媛大学, プロテオサイエンスセンター, 准教授 (30442940)
福田 信治  愛媛大学, プロテオサイエンスセンター, 講師 (70398238)
Project Period (FY) 2019-06-28 – 2021-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2020)
Budget Amount *help
¥6,500,000 (Direct Cost: ¥5,000,000、Indirect Cost: ¥1,500,000)
Fiscal Year 2020: ¥2,600,000 (Direct Cost: ¥2,000,000、Indirect Cost: ¥600,000)
Fiscal Year 2019: ¥3,900,000 (Direct Cost: ¥3,000,000、Indirect Cost: ¥900,000)
KeywordsDNA aptamer / protein targeting / SPOP / CUL3 / CBF1 / ユビキチン化 / DNA-アプタマー / cullin3 / DNAアプタマー / タンパク質分解 / ユビオキチンリガーゼ / ユビキチンリガーゼ / 標的タンパク質分解
Outline of Research at the Start

変異タンパク質の蓄積や異常化によって引き起こされる疾患は多く、その代表例に、がんや神経変性疾患等がある。通常、私たちの体には、タンパク質を一定量に保ったり、品質を管理したりするシステムとして、ユビキチン・プロテアソームによるタンパク質分解システムがある。このシステムの一つを任意に、変異タンパク質に指向性を持つようにすることができれば、変異タンパク質の蓄積や異常化を防ぐことができる。本研究では、CUL3-SPOPユビキチンE3リガーゼを基盤に、変異タンパク質を、任意に標的・分解する共通技術プラットホームを提案・創出し、その効果を実証し、その有用性を示すことを目的とする。

Outline of Final Research Achievements

Mutated proteins are promising therapeutic targets in various diseases including cancers. Bi-functional protein-targeting chimeric molecules PROTACs which cross-link ubiquitin (Ub) E3 ligases and non-substrate proteins have been developed. However, successfully developed PROTACs are quite limited, because they consist of chemical compounds. On the other hand, it has been shown that single strand DNA aptamers are able to recognize specifically even single amino-acid mutated proteins. In this study, we tried to develop disease specific protein targeting modulators based on CUL3-SPOP and DNA aptamers. We successfully identified a SPOP-binding chemical compound #14607 and isolated 15 kinds of DNA aptamers for CBF1 (a target protein) with high affinity (Kd: 10-300 nM), and developed CBF1 targeting modulators, #14607-CBF1-DNA aptamers. We tested them in an in vitro Ub-lation assay system. Unfortunately, we have not detected CBF1 Ub-lation in this system yet.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

遺伝子解析技術の進歩は、様々な疾患特異的遺伝子変異を明らかにしてきているが、治療目的の個体内で遺伝子修復は極めて遠い道のりである。では、「遺伝子変異によって産生される変異タンパク質を標的とする治療薬開発は可能か?」というと、個々の変異タンパク質に対して個別に創薬を進める必要があることから、 極めて困難な道筋である。しかし、個々の変異タンパク質に対する創薬に、一つの共通技術プラットホームができれば、この戦略は飛躍的に前進する。本研究の成果は、その共通技術プラットホームの創出を可能にするものであり、従来法より作成時間と労力を大幅に短縮でき、その社会的意義は極めて大きい。

Report

(3 results)
  • 2020 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2019 Research-status Report
  • Research Products

    (3 results)

All 2020

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results,  Open Access: 1 results) Patent(Industrial Property Rights) (2 results)

  • [Journal Article] Development of Human CBF1-Targeting Single-Stranded DNA Aptamers with Antiangiogenic Activity In Vitro2020

    • Author(s)
      Tezuka-Kagajo Mari、Maekawa Masashi、Ogawa Atsushi、Hatta Yoshiko、Ishii Eiichi、Eguchi Mariko、Higashiyama Shigeki
    • Journal Title

      Nucleic Acid Therapeutics

      Volume: 30 Issue: 6 Pages: 365-378

    • DOI

      10.1089/nat.2020.0875

    • Related Report
      2020 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Patent(Industrial Property Rights)] CBF1結合核酸分子およびその用途2020

    • Inventor(s)
      前川大志, 東山繁樹, 小川敦司, 八田佳子, 加賀城真理
    • Industrial Property Rights Holder
      前川大志, 東山繁樹, 小川敦司, 八田佳子, 加賀城真理
    • Industrial Property Rights Type
      特許
    • Industrial Property Number
      2020-059546
    • Filing Date
      2020
    • Related Report
      2020 Annual Research Report
  • [Patent(Industrial Property Rights)] CBF1結合核酸分子およびその用途2020

    • Inventor(s)
      東山繁樹、小川敦、前川大志、八田佳子、加賀城真理
    • Industrial Property Rights Holder
      東山繁樹、小川敦、前川大志、八田佳子、加賀城真理
    • Industrial Property Rights Type
      特許
    • Industrial Property Number
      2020-059546
    • Filing Date
      2020
    • Related Report
      2019 Research-status Report

URL: 

Published: 2019-07-04   Modified: 2022-01-27  

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