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Aiming for a comprehensive search for genes that regulate the mechanical properties of plant organs

Research Project

Project/Area Number 19K23753
Research Category

Grant-in-Aid for Research Activity Start-up

Allocation TypeMulti-year Fund
Review Section 0702:Biology at cellular to organismal levels, and related fields
Research InstitutionNara Institute of Science and Technology

Principal Investigator

Nakata Miyuki  奈良先端科学技術大学院大学, 先端科学技術研究科, 助教 (60707579)

Project Period (FY) 2019-08-30 – 2022-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2021)
Budget Amount *help
¥2,860,000 (Direct Cost: ¥2,200,000、Indirect Cost: ¥660,000)
Fiscal Year 2020: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2019: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Keywords力学特性 / 曲げ剛性 / ヤング率 / 木質配置 / 断面二次モーメント / マイクロフォーカスX線CT / シロイヌナズナ花茎 / 木質組織配置の定量化 / X線CT / 植物器官 / 網羅的な探索 / 植物 / 力学的特性 / 屈曲 / 圧縮 / 分子メカニズム / 網羅的探索 / ハイスループット定量評価
Outline of Research at the Start

植物器官の力学的特性を調節する分子メカニズム解明の糸口を掴むため、力学的特性の調節に関わる遺伝子群の網羅的な探索を行う。植物器官の力学的特性のうち、屈曲・引張・圧縮粘弾性をハイスループットに定量評価する技術の開発を行い、遺伝的多型を含むシロイヌナズナ集団を材料に力学的特性の網羅的な定量評価を実施する。本研究が完成した場合、植物器官の力学的特性を調節する分子メカニズムの解明に止まらず、生理的意義の理解や産業応用にもつながる可能性がある。

Outline of Final Research Achievements

Increase of the throughput of the quantitative evaluation technique for the mechanical properties of plant organs was achieved and by using the same method, we found one natural variation accession with a different Young's modulus and wood tissue arrangement compared to the standard accession Col-0. It was also suggested that the variation in Young's modulus within a strain may affect the detection accuracy of the difference between strains. Therefore, we analyzed the mutant of genes that affect the formation of known secondary cell walls, and verified the degree of variation in flexural rigidity and Young's modulus and whether or not they could be detected. Unexpectedly, there was no change in flexural rigidity or Young's modulus in the analyzed stems of the mutant. From analyses of the internal structure, it was found that the influence on the moment of inertia of the xylem is small despite the significant increase in the area of the xylem.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

本研究で得た力学特性が変化するシロイヌナズナ自然多型系統を標準系統であるCol-0と遺伝子多型解析することにより、力学特性および木質配置に関わる遺伝子同定につながることが期待される。また、十分な検出感度を得るためには力学特性のみではなく内部構造も同時に調べる必要性を見出したことは、今後の改良に向けた指針となるだろう。さらに、花茎の木質配置やその定量化にマイクロフォーカスX線CTを用いた方法を確立したこと、同方法がユーカリにも適用可能であることを見出したことは、今後の力学特性と木質配置を組み合わせたスクリーニング法の確立につながるとともに、将来的に様々な植物種への展開が期待できる成果である。

Report

(4 results)
  • 2021 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2020 Research-status Report
  • 2019 Research-status Report
  • Research Products

    (6 results)

All 2022 2020 2019

All Journal Article (3 results) (of which Open Access: 3 results,  Peer Reviewed: 2 results) Presentation (3 results)

  • [Journal Article] Pulvinar Slits: Cellulose-deficient and De-esterified Homogalacturonan-rich Structures in a Legume Motor Cell2022

    • Author(s)
      Takahara Masahiro、Tsugawa Satoru、Sakamoto Shingo、Demura Taku、Nakata Miyuki T
    • Journal Title

      bioRxiv

      Volume: -

    • DOI

      10.1101/2022.03.10.483846

    • Related Report
      2021 Annual Research Report
    • Open Access
  • [Journal Article] Estimating the flexural rigidity of Arabidopsis inflorescence stems: Free-vibration test vs. three-point bending test2020

    • Author(s)
      Nakata Miyuki T.、Nakao Mao、Denda Asuka、Onoda Yusuke、Ueda Haruko、Demura Taku
    • Journal Title

      Plant Biotechnology

      Volume: 37 Issue: 4 Pages: 471-474

    • DOI

      10.5511/plantbiotechnology.20.1214a

    • NAID

      130007960256

    • ISSN
      1342-4580, 1347-6114
    • Year and Date
      2020-12-25
    • Related Report
      2020 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] DIY生物研究のすすめ2019

    • Author(s)
      中田 未友希
    • Journal Title

      生物工学会誌

      Volume: 97 Pages: 281-281

    • Related Report
      2019 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] マイクロX線CTを用いたシロイヌナズナ花茎の内部構造の観察と断面二次モーメントの算出2022

    • Author(s)
      中田未友希、仲尾真男、佐野亮輔、出村拓
    • Organizer
      第63回日本植物生理学会年会
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Presentation] シロイヌナズナ花茎における細胞壁の変化がヤング率に与える影響2020

    • Author(s)
      仲尾真男, 中田未友希, 出村拓
    • Organizer
      日本植物学会第84回大会
    • Related Report
      2020 Research-status Report
  • [Presentation] シロイヌナズナの茎における曲げ剛性と固有振動数の解析2019

    • Author(s)
      仲尾真男、中田未友希、出村拓
    • Organizer
      植物構造オプト若手の会
    • Related Report
      2019 Research-status Report

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Published: 2019-09-03   Modified: 2023-01-30  

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