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Comparative metagenomics reveals the diversity of glacier Cyanobacteria

Research Project

Project/Area Number 19K23766
Research Category

Grant-in-Aid for Research Activity Start-up

Allocation TypeMulti-year Fund
Review Section 0703:Biology at organismal to population levels and anthropology, and related fields
Research InstitutionNational Institute of Genetics

Principal Investigator

Murakami Takumi  国立遺伝学研究所, 情報研究系, 特任研究員 (00806432)

Project Period (FY) 2019-08-30 – 2023-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2022)
Budget Amount *help
¥2,340,000 (Direct Cost: ¥1,800,000、Indirect Cost: ¥540,000)
Fiscal Year 2020: ¥1,170,000 (Direct Cost: ¥900,000、Indirect Cost: ¥270,000)
Fiscal Year 2019: ¥1,170,000 (Direct Cost: ¥900,000、Indirect Cost: ¥270,000)
Keywords氷河生態系 / メタゲノム / クリオコナイト / シアノバクテリア / 脱窒 / 環境微生物 / 氷河 / 細菌群集
Outline of Research at the Start

シアノバクテリアを核として形成される微生物群集構造物「クリオコナイト」は、氷河環境中における代表的な一次生産の場であり、氷河生態系の基盤的存在である。世界各地の氷河環境からこのクリオコナイトの存在は報告されているが、その地域的多様性についての知見は限られている。
本課題では、極域やアジア高山域など世界各地から収集したクリオコナイトのDNA断片配列を網羅的に取得する、いわゆるメタゲノム解析を駆使することで、クリオコナイトの中核種であるシアノバクテリアの系統や遺伝子機能の地域間差異を調査する。

Outline of Final Research Achievements

In glacier environments, cryoconite granules, which are aggregates of microbes and minerals, play fundamental roles in glacier ecosystems. In this study, we collected cryoconite samples around the world and conducted comparative metagenomics analyses to investigate the taxonomic and ecological diversities of cryoconite bacterial communities on a global scale. Our study revealed that compositions of bacterial taxa and functional genes of cryoconite bacterial consortia were distinctive among glaciers in different geographical areas, especially between Polar glaciers and Asian high mountain glaciers. These results highlight that microbial ecosystems on glacier vary across the different geographical areas, and imply that assembly of bacterial communities on glaciers were influenced by local glacier environments.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

氷河微生物の活動は流域の物質循環や氷河融解にも深く関与しているため、それら氷河微生物の総体である氷河生態系の構造を詳細に理解することは生物学・地球科学的に重要な課題である。本研究によって、様々な代謝能を有した多様な細菌種が世界各地の氷河に分布しており、地域ごとに特色を持った氷河生態系が構築されているということが初めて具体的に示された。これらの成果は、環境と氷河微生物群集の動態を紐づける重要な知見であり、「気候変動によって氷河生態系が今後どう変容し、物質循環や生物多様性がどのような影響を受けるのか」という問いをより詳細に解明していくことに大きく貢献する。

Report

(5 results)
  • 2022 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2021 Research-status Report
  • 2020 Research-status Report
  • 2019 Research-status Report
  • Research Products

    (6 results)

All 2022 2021 2020

All Journal Article (1 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 1 results,  Open Access: 1 results) Presentation (5 results) (of which Invited: 1 results)

  • [Journal Article] Metagenomics reveals global-scale contrasts in nitrogen cycling and cyanobacterial light-harvesting mechanisms in glacier cryoconite2022

    • Author(s)
      Takumi Murakami, Nozomu Takeuchi, Hiroshi Mori, Yuu Hirose, Arwyn Edwards, Tristram Irvine-Fynn, Zhongqin Li, Satoshi Ishii, Takahiro Segawa
    • Journal Title

      Microbiome

      Volume: 10 Issue: 1 Pages: 50-50

    • DOI

      10.1186/s40168-022-01238-7

    • Related Report
      2021 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Presentation] メタゲノムデータから見る氷河細菌群集構造の詳細2022

    • Author(s)
      村上匠、瀬川高弘、竹内望、森宙史
    • Organizer
      日本微生物生態学会 第35回大会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] メタゲノムデータから紐解く氷河シアノバクテリアの多様性2022

    • Author(s)
      村上匠
    • Organizer
      藍藻の分子生物学2022
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] メタゲノムを用いた氷河微生物群集「クリオコナイト」の広域間比較解析2022

    • Author(s)
      村上匠、瀬川高弘、広瀬侑、石井聡、森宙史、竹内望
    • Organizer
      第16回日本ゲノム微生物学会年会
    • Related Report
      2021 Research-status Report
  • [Presentation] メタゲノム解析で明らかにする氷河細菌叢のダイナミクス2021

    • Author(s)
      村上匠、瀬川高弘、竹内望、森宙史
    • Organizer
      日本微生物生態学会第34回大会
    • Related Report
      2021 Research-status Report
  • [Presentation] メタゲノムデータから解明する氷河細菌群集の地域的多様性2020

    • Author(s)
      村上匠、瀬川高弘、広瀬侑、森宙史、竹内望
    • Organizer
      第14回日本ゲノム微生物学会年会
    • Related Report
      2019 Research-status Report

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Published: 2019-09-03   Modified: 2024-01-30  

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