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The elucidation of ALS pathogenesis focused on the effects of DNA methylation on TDP-43 autoregulation

Research Project

Project/Area Number 19K23961
Research Category

Grant-in-Aid for Research Activity Start-up

Allocation TypeMulti-year Fund
Review Section 0902:General internal medicine and related fields
Research InstitutionNiigata University

Principal Investigator

Koike Yuka  新潟大学, 脳研究所, 助教 (60844488)

Project Period (FY) 2023-02-26 – 2024-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2023)
Budget Amount *help
¥2,860,000 (Direct Cost: ¥2,200,000、Indirect Cost: ¥660,000)
Fiscal Year 2020: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2019: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Keywords筋萎縮性側索硬化症 / TDP-43 / DNAメチル化 / 加齢 / 運動野 / スプライシング / DNAメチル化修飾 / 自己調節機構 / 選択的スプライシング / TARDBP
Outline of Research at the Start

孤発性筋萎縮性側索硬化症 (SALS) 患者の運動神経細胞では、核蛋白であるTDP-43が細胞質に蓄積する。TDP-43の発現量は、TDP-43をコードするTARDBP 3’UTRの選択的スプライシングにより、厳密に自己調節される。申請者は、TARDBP 3’UTRのDNAメチル化状態の変化が、選択的スプライシングを介し、TARDBPの発現量を規定する、と仮説を立てた。これを立証するために、ヒト培養細胞を用いた選択的メチル化状態操作によるスプライシング変動の検討、SALSを含むヒト剖検脳組織を用いたDNAメチル化状態の詳細な解析を行い、SALSの分子病態へのDNAメチル化の寄与を明らかにする。

Outline of Final Research Achievements

In amyotrophic lateral sclerosis (ALS), abnormalities in the amount and distribution of the nuclear protein TDP-43 contribute to the pathogenesis of the disease. This study found that: 1) Selective demethylation of TDP-43 autoregulatory regions increases TDP-43 levels. 2) Demethylation of TDP-43 autoregulatory regions in the human motor cortex increases TDP-43 levels with age. 3) The methylation status of TDP-43 autoregulatory regions in the motor cortex correlates with the age of onset of ALS. This study revealed the mechanism of self-regulation of TDP-43 levels by age-related DNA demethylation. We reported these findings in Commun Biol (Koike et al. 2021).

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

筋萎縮性側索硬化症(ALS)をはじめとする神経変性疾患は、慢性進行性の経過をたどり、患者の生活の質を著しく低下させる。そのため、早期診断のためのバイオマーカーや根本的治療戦略の開発が強く望まれる。加えて、神経変性疾患の最大の発症リスクは、加齢であり、高齢化社会において、その制御は重要な課題である。しかし、加齢がALSや神経変性疾患の発症に寄与する機序は明らかでない。この機序の解明は、ALSや神経変性疾患発症のリスク制御、治療標的の開発に繋がる。本研究では、TDP-43の量調節の観点から、加齢と孤発性ALS発症を結ぶ分子機序の一端を明らかにし、今後のALS病態研究を展開していく上での土台となる。

Report

(3 results)
  • 2023 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2019 Annual Research Report
  • Research Products

    (5 results)

All 2024 2023 2019

All Presentation (5 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Invited: 1 results)

  • [Presentation] Perturbation of DNA methylation in the TDP-43 autoregulatory region links to aging2024

    • Author(s)
      小池佑佳
    • Organizer
      The 14th BRI International Symposium, Niigata University
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] DNA demethylation in the TDP-43 autoregulatory region links to aging2023

    • Author(s)
      小池佑佳
    • Organizer
      UK-Japan Neuroscience Symposium 2023
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Alteration of TDP-43 autoregulation-relevant splicing by DNA methylation status of TARDBP DNA2019

    • Author(s)
      Yuka Koike, Akihiro Sugai, Akio Yokoseki, Tomohiko Ishihara, Norikazu Hara, Junko Ito, Takeshi Ikeuchi, Akiyoshi Kakita, Osamu Onodera
    • Organizer
      分子生物学会
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
  • [Presentation] Yuka Koike,Taisuke Kato,Sachiko Hirokawa,Kenta Kobayashi,shoji Tsuji, Osamu Onodera2019

    • Author(s)
      Therapeutic strategy based on genome editing for dentatorubral-pallidoluysian atrophy.
    • Organizer
      日本てんかん学会
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
  • [Presentation] 小池 佑佳,加藤 泰介,廣川 祥子,小林 憲太,辻 省次,小野寺 理2019

    • Author(s)
      歯状核赤核・淡蒼球ルイ体萎縮症モデルマウスに対するゲノム編集効果
    • Organizer
      日本神経治療学会
    • Related Report
      2019 Annual Research Report

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Published: 2019-09-03   Modified: 2025-01-30  

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