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Elucidation of the functional evolution of mitochondrion-related organelles in fornicates

Research Project

Project/Area Number 19KK0185
Research Category

Fund for the Promotion of Joint International Research (Fostering Joint International Research (B))

Allocation TypeMulti-year Fund
Review Section Medium-sized Section 45:Biology at organismal to population levels and anthropology, and related fields
Research InstitutionUniversity of Tsukuba

Principal Investigator

Tetsuo Hashimoto  筑波大学, 生命環境系, 名誉教授 (50208451)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 久米 慶太郎  筑波大学, 医学医療系, 助教 (70853191)
千葉 洋子  国立研究開発法人理化学研究所, 環境資源科学研究センター, 上級研究員 (70638981)
神川 龍馬  京都大学, 農学研究科, 准教授 (40627634)
Project Period (FY) 2019-10-07 – 2024-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2023)
Budget Amount *help
¥18,330,000 (Direct Cost: ¥14,100,000、Indirect Cost: ¥4,230,000)
Fiscal Year 2022: ¥2,860,000 (Direct Cost: ¥2,200,000、Indirect Cost: ¥660,000)
Fiscal Year 2021: ¥5,070,000 (Direct Cost: ¥3,900,000、Indirect Cost: ¥1,170,000)
Fiscal Year 2020: ¥6,110,000 (Direct Cost: ¥4,700,000、Indirect Cost: ¥1,410,000)
Fiscal Year 2019: ¥4,290,000 (Direct Cost: ¥3,300,000、Indirect Cost: ¥990,000)
Keywordsミトコンドリア関連オルガネラ(MRO) / プロテオミクス / フォルニカータ / 嫌気環境適応 / 機能進化 / ミトコンドリア関連オルガネラ
Outline of Research at the Start

フォルニカータ生物群はミトコンドリア(Mt)およびミトコンドリア関連オルガネラ(MRO)の進化・多様性の解明のために最適な研究対象である。本研究では、嫌気真核生物研究のトップを走るRoger教授の研究と我々のプロテオミクス研究を共同研究として発展させることにより、フォルニカータの進化史におけるMRO局在タンパク質の喪失と獲得の過程を明らかにする。その知見を生息環境や生活様式、生理動態などの違いとともに総合的に考察して、MRO機能の進化の原動力とメカニズムを理解する。さらに、フォルニカータ以外の真核生物も視野に入れた比較解析により、Mt/MROの縮退進化と嫌気適応進化のメカニズムの解明に迫る。

Outline of Final Research Achievements

Fornicates (Fornicata) are a group of organisms adapted to the microaerobic environment and consists of a variety of flagellates, including free-living, commensal, and parasitic species. All of them have degenerate mitochondria, mitochondrion-related organelles (MROs), that lack the ability of oxidative phosphorylation. In this project, we purified MROs and performed proteomic analysis of two free-living species, Kipferlia bialata and Dysnectes brevis, which have only been studied based on sequence data. The results were compared with existing data in the human parasite Trichomonas vaginalis, which is a phylogenetical relative to fornicates, to provide suggestions for the functional evolution of MROs.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

フォルニカータ生物群は、退化型のミトコンドリアであるMROを保持するもののみから構成されるため、微好気嫌気環境に適応した真核生物の代謝とその進化を探るうえでのモデル系となりうる。しかし、一部の寄生虫に関するものを除くと、フォルニカータ生物に関する研究のほとんどは配列データに基づくものであった。今回、MROのプロテオミクス解析により、自由生活種2種において真のMRO局在タンパク質のリストを提示したことにより、MROの機能進化の解明に大きく貢献できた。また、バクテリアとの混合培養系からのMROタンパク質の精製方法論を確立したことは、今後、他の非モデル生物での同様の研究に対して大きな波及効果をもつ。

Report

(6 results)
  • 2023 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2022 Research-status Report
  • 2021 Research-status Report
  • 2020 Research-status Report
  • 2019 Research-status Report
  • Research Products

    (7 results)

All 2024 2023 2020 Other

All Int'l Joint Research (1 results) Journal Article (3 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 3 results,  Open Access: 3 results) Presentation (3 results)

  • [Int'l Joint Research] Dalhousie University(カナダ)

    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Journal Article] Draft Genome Sequence of Aduncisulcus paluster, a Free-Living Microaerophilic Eukaryote Belonging to the Fornicata2023

    • Author(s)
      Yuyama Ikuko、Kume Keitaro、Tamura Takumi、Inagaki Yuji、Hashimoto Tetsuo
    • Journal Title

      Microbiology Resource Announcements

      Volume: 12 Issue: 2

    • DOI

      10.1128/mra.00539-22

    • Related Report
      2023 Annual Research Report 2022 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Transcriptome data sets of free-living diplomonads, <i>Trepomonas</i> sp. and <i>Hexamita</i> sp.2023

    • Author(s)
      Kume Keitaro、Gen Tsubasa、Abe Kazutaka、Komatsuzaki Hiroshi、Yazaki Euki、Tanifuji Goro、Kamikawa Ryoma、Inagaki Yuji、Hashimoto Tetsuo
    • Journal Title

      Microbiology Resource Announcements

      Volume: 12 Issue: 12

    • DOI

      10.1128/mra.00506-23

    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Barthelonids represent a deep-branching metamonad clade with mitochondrion-related organelles predicted to generate no ATP2020

    • Author(s)
      Yazaki Euki、Kume Keitaro、Shiratori Takashi、Eglit Yana、Tanifuji Goro、Harada Ryo、Simpson Alastair G. B.、Ishida Ken-ichiro、Hashimoto Tetsuo、Inagaki Yuji
    • Journal Title

      Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences

      Volume: 287 Issue: 1934 Pages: 20201538-20201538

    • DOI

      10.1098/rspb.2020.1538

    • NAID

      120007132513

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    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Presentation] ディプロモナス類の寄生虫化に伴う遺伝子レパートリーの変化:近縁自由生活種とのオルソログ比較解析2024

    • Author(s)
      久米 慶太郎, 若島 朋幸, 厳 翼, 岩本 亮介, 井上 貴史, 谷藤 吾朗, 神川 龍馬, 稲垣 祐司, 橋本 哲男
    • Organizer
      第93回日本寄生虫学会大会
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      小金丸 利隆, 田村 嘉孝, 星 康貴, 久米 慶太郎, 橋本 哲男, 奈良 武司
    • Organizer
      第93回日本寄生虫学会大会
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    • Author(s)
      厳 翼, 久米 慶太郎, 阿部 一貴, 矢﨑 裕規, 小松崎 洋志, 谷藤 吾朗, 神川 龍馬, 稲垣 祐司, 橋本 哲男
    • Organizer
      第92回日本寄生虫学会大会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report

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Published: 2019-10-10   Modified: 2025-01-30  

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