Collaboration and comparison on twin analysis of genomic/epigenomic information and common diseases: Hungary and Japan
| Project/Area Number |
19KK0244
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| Research Category |
Fund for the Promotion of Joint International Research (Fostering Joint International Research (B))
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| Allocation Type | Multi-year Fund |
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| Review Section |
Medium-sized Section 58:Society medicine, nursing, and related fields
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| Research Institution | Shiga University of Medical Science (2020-2022)
Osaka University (2019) |
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Principal Investigator |
本多 智佳 滋賀医科大学, 医学部, 客員准教授 (40625498)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
冨澤 理恵 大阪大学, 大学院医学系研究科, 招へい教員 (20584551)
酒井 規夫 大阪大学, 大学院医学系研究科, 教授 (30314313)
渡邉 幹夫 大阪大学, 大学院医学系研究科, 教授 (50294088)
矢野 裕一朗 滋賀医科大学, 医学部, 教授 (10586241)
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| Project Period (FY) |
2019-10-07 – 2024-03-31
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| Project Status |
Granted (Fiscal Year 2022)
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| Budget Amount *help |
¥17,550,000 (Direct Cost: ¥13,500,000、Indirect Cost: ¥4,050,000)
Fiscal Year 2022: ¥650,000 (Direct Cost: ¥500,000、Indirect Cost: ¥150,000)
Fiscal Year 2021: ¥4,290,000 (Direct Cost: ¥3,300,000、Indirect Cost: ¥990,000)
Fiscal Year 2020: ¥10,270,000 (Direct Cost: ¥7,900,000、Indirect Cost: ¥2,370,000)
Fiscal Year 2019: ¥2,340,000 (Direct Cost: ¥1,800,000、Indirect Cost: ¥540,000)
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| Keywords | 双生児研究 / 公衆衛生 / 疫学 / 生活習慣病 / 地域保健 |
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| Outline of Research at the Start |
本研究では期間中に、ハンガリーの一卵性双生児から得られたゲノム・エピゲノムデータ（遺伝子多型やメチル化）を解析し、対象とする生活習慣病や腸内細菌叢との関連解析を行うとともに、その結果を日本人双生児のものと比較し、人種間で差異があるかを明らかにするための比較を行う。
ハンガリアンツインレジストリ登録者から研究同意が得られ、冷凍保存されている末梢血液検体からDNA抽出を行い、ゲノム、エピゲノム情報の解析を行う。その際は、日本で実際に運用しているプロトコールに揃えて実施する。
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| Outline of Annual Research Achievements |
本研究は、ゲノムエピゲノム情報と、骨粗しょう症をはじめとした様々な生活習慣病の関連について双生児研究法を用いて環境因子の影響に関する解析を行う計画である。
全ての疾病や健康状態は遺伝と環境の両方の影響を受けるが、双生児研究は、遺伝背景の統制された双生児を対象とすることで環境の影響をより正確に見ることを可能とするという優位性を持つ。ハンガリー双生児レジストリに登録されて同意取得後に採取された成人双生児の血液検体についてSNPとメチル化の解析を試みること、生理学的検査や生化学検査、疫学調査、腸内細菌叢解析などの結果との関連について検討することを目的としているが、すでに日本で実施され、大阪大学ツインリサーチセンターが所有する成人双生児のSNP、メチル化データ及び生理学的検査や生化学検査、疫学調査データ、腸内細菌叢解析データを用いた研究の結果などとも比較を行い、人種による差異についても検討することで新たな知見を得ることを目指している。
当該年度においては、ハンガリーに赴いて既存検体のゲノム解析を行い、データベース化を進める計画であったが、継続する世界的なCOVIDの流行や、新株による感染拡大、まん延の影響が強かったこと、繰り返される緊急事態宣言やまん延防止等重点措置により、渡航を中心とした種々の研究活動が制限された。このことにより、既存収集データを用いた作業で完結する解析や遠隔的に海外の共同研究者と実施可能な研究活動を中心として実施し、結果を論文として投稿した。
研究者の派遣が困難であった一方で、来日研究者の受け入れをすることが出来た。2022年9月には、これまでの共同研究、連携について議論する国際シンポジウムを滋賀医科大学において開催した。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
COVIDの継続的蔓延や、それによる渡航制限、新株出現の影響ならびに研究関連資材の不足など、当初計画していた通りには人的交流やハンガリー側の血液検体解析を実施するに至っていない。一方で、既存データを用いた、渡航を伴わずに実施できる形での共同研究は継続して行っており論文としても投稿している。また、当該年度後半の渡航制限緩和の流れを受けて、ハンガリー側からの研究者受け入れが行われ、国際シンポジウムにおいて、これまで成果を広く知ってもらう機会を作ることができた。前年度までの遅れを回復してきれおり、今後は日本側からも渡航、検体解析の準備を進めており、概ね順調な進行状態であると考える。
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| Strategy for Future Research Activity |
本研究の特性でもあるが、海外の共同研究機関を有すること、現地においての検体解析が不可欠な研究であることから、この3年間におよぶ世界的なCOVID流行、渡航制限、それに関連した人的交流制限ならびに研究消耗品の供給不足の影響を大きく受けている。そのため生じていた若干の遅れも、ハンガリー側の研究者を迎えて日本で国際シンポジウムを開催、遠隔でも実施可能な研究実施、論文の投稿など、ハンガリー側の研究者と継続した既存データ解析や議論は継続的かつ活発に行なっている。
今後の計画として、本研究の当初計画としての流れである検体解析、データ分析、データベース化という点に変更はなく、渡航制限などの緩和を経て、予定通りに進捗を進める計画である。
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Report
(4 results)
Research Products
(9 results)
