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転写と染色体領域の視点から見たゲノムDNA損傷位置情報の解析

Research Project

Project/Area Number 20012026
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas

Allocation TypeSingle-year Grants
Review Section Biological Sciences
Research InstitutionNagoya University

Principal Investigator

豊國 伸哉  Nagoya University, 大学院・医学系研究科, 教授 (90252460)

Project Period (FY) 2008 – 2009
Project Status Completed (Fiscal Year 2009)
Budget Amount *help
¥11,200,000 (Direct Cost: ¥11,200,000)
Fiscal Year 2009: ¥5,600,000 (Direct Cost: ¥5,600,000)
Fiscal Year 2008: ¥5,600,000 (Direct Cost: ¥5,600,000)
Keywords酸化ストレス / 鉄 / DNA修飾塩基 / モノクロナール抗体 / モノクローナル抗体
Research Abstract

ゲノム情報の変化は発がん過程で重要な役割を果たしている。本研究においては、培養細胞や個体各臓器の細胞のゲノム配列において、紫外線・放射線あるいは鉄を介した酸化ストレスによってDNA塩基への傷害が起こりやすい部位をアレイ技術の応用により網羅的に同定し、その法則性を見いだすことを目的とした。これまでに、私たちは鉄ニトリロ三酢酸(Fe-NTA)腹腔内投与による腎発がんモデルを開発し、その病態に酸化ストレスが関与すること、主要な標的遺伝子にCDKN2Aがん抑制遺伝子やptprz1遺伝子などがあることを示し、ゲノムに酸化ストレスに対して欠損・増幅しやすい領域があることを報告した。今年度は遺伝解析より新たにalninoacylase-1にがん抑制遺伝子としての作用があることを見いだした。昨年度に引き続き、モノクローナル抗体で修飾塩基を含むDNA断片を免疫沈降する技術とマイクロアレイ技術を組み合わせることにより、ゲノム内の酸化ストレスに対する脆弱部位を網羅的に解析した。Fe-NTA腹腔内投与による腎癌モデル初期において代表的な酸化修飾塩基である8-hydroxy-2'-deoxyguanosine(8-OHdG)に対するモノクローナル抗体を使用した実験を反復した。対照のラット腎臓ならびにFe-NTA投与3時間後の腎臓からゲノムDNAを抽出し、制限酵素BmgT120Iで切断後,DNA断片の免疫沈降を行い,8-OHdGを含むDNA断片を回収した。DNA断片を蛍光色素でラベルした後CCGHのアレイにハイブリダイゼーションし解析を行った。すると、8-OHdGは非遺伝子領域に高密度に分布し、遺伝子領域には相対的に低密度に分布することが判明した。ゲノムの遺伝子密度と8-OHdGの存在頻度に有意な負の相関を認めた。分布のパターンそのものは対照と酸化ストレスのかかった状態でほとんど差が見られなかった。CDKN2A部位では酸化ストレス時に8-OHdGの増加を認めた。

Report

(2 results)
  • 2009 Annual Research Report
  • 2008 Annual Research Report
  • Research Products

    (8 results)

All 2010 2009 2008 Other

All Journal Article (5 results) (of which Peer Reviewed: 5 results) Presentation (2 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Homozygous deletion of CDKN2A/2B is a hallmark of iron-induced rat high-grade mesohtelioma.2010

    • Author(s)
      Hu Q., et al.
    • Journal Title

      Laboratory Investigation 90

      Pages: 360-373

    • Related Report
      2009 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Genome-wide analysis identifies a tumor suppressor role for aminoacylase 1 in iton-induced rat renal cell carcinoma.2009

    • Author(s)
      Zhong Y., et al.
    • Journal Title

      Carcinogenesis 30

      Pages: 158-164

    • Related Report
      2009 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Role of iron in carcinogenesis : Cancer as a ferrotoxic disease2009

    • Author(s)
      Toyokuni S.
    • Journal Title

      Cancer Sci 100

      Pages: 6-16

    • NAID

      10025140908

    • Related Report
      2008 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Genome-wide analysis identifies a tumor suppressor role for aminoacylase 1 in iron-induced rat renal cell carcinoma2009

    • Author(s)
      Zhong Y., et.al.
    • Journal Title

      Carcinogenesis 30

      Pages: 158-164

    • Related Report
      2008 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Molecular mechanisms of oxidative stress-induced carcinogenesis : from epidemiology to oxygenomics2008

    • Author(s)
      Toyokuni S.
    • Journal Title

      IUBMB Life 60

      Pages: 441-447

    • Related Report
      2008 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Asbestos-induced carcinogenesis is oxidative stress-dependent.2009

    • Author(s)
      Toyokuni S.
    • Organizer
      5^<th> Joint Meeting of the Society for Free Radical Research Australasia and Japan
    • Place of Presentation
      Sydney, Australia
    • Related Report
      2009 Annual Research Report
  • [Presentation] Oxygenomics approach to understand chronic oxidative stress as acause of genomics amplification and deletion2008

    • Author(s)
      Toyokuni S.
    • Organizer
      The 7^<th> China-Japan Joint Conference for Cancer Research "Infection, inflammation and cancer"
    • Place of Presentation
      White Swan Hotel, Guangzhou, China
    • Related Report
      2008 Annual Research Report
  • [Remarks]

    • URL

      http://www.med.nagoya-u.ac.jp/pathol/

    • Related Report
      2009 Annual Research Report

URL: 

Published: 2008-04-01   Modified: 2018-03-28  

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