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細胞内情報伝達の再構成系における非線形反応の解析

Research Project

Project/Area Number 20016027
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas

Allocation TypeSingle-year Grants
Review Section Biological Sciences
Research InstitutionThe Institute of Physical and Chemical Research

Principal Investigator

佐甲 靖志  The Institute of Physical and Chemical Research, 佐甲細胞情報研究室, 主任研究員 (20215700)

Project Period (FY) 2008 – 2009
Project Status Completed (Fiscal Year 2009)
Budget Amount *help
¥8,400,000 (Direct Cost: ¥8,400,000)
Fiscal Year 2009: ¥4,200,000 (Direct Cost: ¥4,200,000)
Fiscal Year 2008: ¥4,200,000 (Direct Cost: ¥4,200,000)
Keywords上皮成長因子 / Ras / MAPK / 1分子計測 / セミインタクト細胞 / 過剰応答性 / 反応ゆらぎ
Research Abstract

細胞増殖・分化を司る上皮成長因子(epidermal growth fctor : EGF)-Ras-MAPKシステムにおいて、(1)EGF受容体の活性化増幅、(2)ERK(MAPK)活性化に見られる双安定性という2つの非線形応答現象を、それぞれセミ・インタクト細胞内および大腸菌内に再構成し、1分子計測、可視化計測によって非線形性の性質と、非線形性を生むメカニズムを解析することを目的として研究を行い、以下の結果を得た。
(1) EGF受容体(EGFR)の活性化反応の解析
EGFR-GFPを発現するCHO-K1細胞でEGFRの会合数分布と会合体の空間分布計測を行い、2量体を単位とする高次会合体が形成されていることを予想する結果を得た。分子間相互作用を直視するため、光感受性の蛍光蛋白質を融合したEGFRでPALM法により20nm程度の空間分解能で1分子検出を行う方法を開発した。
(2) ERKの活性化反応の解析
ERK,および活性化MEKとMKPを組み込んだ発現プラスミドを構築し大腸菌で発現を行った。3種の蛋白質の発現を10倍程度制御し、リン酸化ERK抗体によるWestern blotでMEK発現依存的にERKの2重リン酸化が亢進し、MKPの強発現によりリン酸化が阻害されることを確認した。決定論的および確率的な計算法によるERKリン酸化反応解析を行った。決定論的な連立微分方程式モデルにおいては、ERKリン酸化状態の双安定性が予測できた。確率的な反応シミュレータで、細胞サイズが0.2μm^3以下に減少すると双安定性は消失するが、哺乳類細胞レベルの大きさでは、リン酸化レベルは100時間を超えて安定に維持されることが予想された。

Report

(2 results)
  • 2009 Annual Research Report
  • 2008 Annual Research Report
  • Research Products

    (11 results)

All 2009 2008 Other

All Journal Article (6 results) (of which Peer Reviewed: 5 results) Presentation (2 results) Book (1 results) Remarks (2 results)

  • [Journal Article] Reduction-triggered fluorescent amplification probe for detection of endogenous RNAs in living human cells2009

    • Author(s)
      Furukawa, K., et al.
    • Journal Title

      Bioconj.Chem. 20

      Pages: 1026-1036

    • Related Report
      2009 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] A RasGTP-induced conformational change in C-RAF is essential for accurate molecular recognition2009

    • Author(s)
      Hibino K., et al.
    • Journal Title

      Biophys.J. 97

      Pages: 1227-1287

    • Related Report
      2009 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] 細胞内情報伝達反応の1分子キネティクス2009

    • Author(s)
      佐甲靖志
    • Journal Title

      生物物理 49

      Pages: 184-191

    • NAID

      10025975747

    • Related Report
      2009 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Multiple mechanisms for accumulation of myosin II filaments at the equator during cytokinesis.2008

    • Author(s)
      Yumura, S., et al.
    • Journal Title

      Traffic 9

      Pages: 2089-2099

    • Related Report
      2008 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Construction of two color semiconductor Quantum dots wire by utilizing the complementarity of DNA.2008

    • Author(s)
      Tanala, S.-i., et al.
    • Journal Title

      AIP Conference Proceedings 1062

      Pages: 116-122

    • Related Report
      2008 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] 細胞内シグナル伝達システムの1分子イメージング2008

    • Author(s)
      佐甲靖志
    • Journal Title

      実験医学増刊 26

      Pages: 2718-2723

    • Related Report
      2008 Annual Research Report
  • [Presentation] Single-molecule dynamics of cell signaling proteins2009

    • Author(s)
      Sako Y.
    • Organizer
      第61回日本細胞生物学会大会
    • Place of Presentation
      愛知県 名古屋市
    • Year and Date
      2009-06-02
    • Related Report
      2009 Annual Research Report
  • [Presentation] Single-molecule kinetic analysis of cell signaling reactions.2008

    • Author(s)
      Sako, Y.
    • Organizer
      Conference on Systems Biology of Mammalian Cells
    • Place of Presentation
      Dresden
    • Year and Date
      2008-05-22
    • Related Report
      2008 Annual Research Report
  • [Book] Single Molecule Dyanmics in Life Science. (Yanagida, T. and Ishii, Y. ed.)(分担執筆)2009

    • Author(s)
      Ueda, et al.
    • Total Pages
      17
    • Publisher
      WILEY-VCH
    • Related Report
      2008 Annual Research Report
  • [Remarks]

    • URL

      http://www.riken.go.jp/cell-info/

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  • [Remarks]

    • URL

      http://www.riken.go.jp/cell-info/

    • Related Report
      2008 Annual Research Report

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Published: 2008-04-01   Modified: 2018-03-28  

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