| Project/Area Number |
20017013
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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| Allocation Type | Single-year Grants |
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| Review Section |
Biological Sciences
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| Research Institution | Kanazawa University |
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Principal Investigator |
西山 智明 Kanazawa University, 学際科学実験センター, 助教 (50390688)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
関本 弘之 日本女子大学, 理学部, 准教授 (20281652)
坂山 英俊 神戸大学, 大学院・理学研究科, 講師 (60391108)
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| Project Period (FY) |
2008 – 2009
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| Project Status |
Completed (Fiscal Year 2009)
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| Budget Amount *help |
¥8,400,000 (Direct Cost: ¥8,400,000)
Fiscal Year 2009: ¥4,200,000 (Direct Cost: ¥4,200,000)
Fiscal Year 2008: ¥4,200,000 (Direct Cost: ¥4,200,000)
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| Keywords | EST / シャジクモ / ヒメミカヅキモ / 多細胞 / 性分化誘導 / シャジクモ藻類 / 世代交代 / イヌカタヒバ / 完全長cDNA |
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| Research Abstract |
ヒメミカヅキモ、シャジクモは、陸上植物に近縁な藻類であり、ヒメミカヅキモは生活環を通じて単細胞性であるが、シャジクモはn世代だけが多細胞体制を作る。n, 2n両世代で多細胞体制を作る陸上植物への進化を解明するため、この2種でEST解析を進めた。
昨年度決定したヒメミカヅキモNIES-67&68株 栄養増殖ステージに加え、A2 ヒメミカヅキモNIES-67株(接合型プラス)性分化誘導ステージ;A3 ヒメミカヅキモNIES-68株(接合型マイナス)性分化誘導ステージ;の完全長cDNAライブラリーを作製し各1万9200クローンについて両端からのESTシークエンスを行った。これにより合計116, 694配列のESTが得られた。この配列を以前から得られていたESTとともにアセンブルし10 620個のcontigを得た。シャジクモについては、B2 シャジクモ生殖器官形成直前ステージ;B3 シャジクモ受精直前ステージの完全長cDNAライブラリーを作製し合計73, 388配列のESTが得られた。
また、ヒメツリガネゴケの受精卵の第一分裂に必要なPpLFY転写因子は陸上植物の2倍体の多細胞体制獲得に関与しているかもしれないのでその相同遺伝子をシャジクモから単離した。
さらにヒメミカヅキモの形質転換の条件を検討し、安定な株を単離できるようにし、ESTから得られた候補遺伝子の機能解析を進めている。
これらの結果は、今後、さらに新型シーケンサーを用いたdeepシーケンシング、ゲノム配列の決定を行い、多細胞体制獲得の鍵が何であったかを解明する基盤となる。
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Report
(2 results)
Research Products
(16 results)
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[Journal Article] Sexual processes and phylogenetic relationships of a homothallic strain in the Closterium peracerosum-strigosum-littorale complex(Zygnematales, Charophyceae).2010
Author(s)
Tsuchikane, Y., Sato, M., Ootaki, T., Kokubun, Y., Nozaki, H., Ito, M., Sekimoto, H
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Journal Title
J.PHYCOLOGY 46
Pages: 278-284
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Peer Reviewed
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[Journal Article] Intracellular localization of an endogenous cellulose synthase of Micrasterias denticulata(Desmidiales, Chlorophyta)by means of transient genetic transformation.2010
Author(s)
Vannerum, K., Abe, J., Sekimoto, H., Inze, D., Vyverman, W.
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Journal Title
Related Report
Peer Reviewed
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[Journal Article] A polycomb repressive complex 2 gene regulates apogamy and gives evolutionary insights into early land plant evolutiion2009
Author(s)
Okano, Y., Aono, N., Hiwatashi, Y., Murata, T., Nishiyama, T., Ishikawa, T., Kubo, M., Hasebe, M.
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Journal Title
Proc.Natl.Acad.Sci.USA 106
Pages: 16321-16326
Related Report
Peer Reviewed
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[Presentation] Characterization of a novel receptor-like protein kinase relating to the sexual reproduction of a unicellular charophycean alga, Closterium peracerosum-strigosum-littorale complex2010
Author(s)
Hashiba, S., Marukawa, Y., Ichikawa, M., Nishii, I., Akatsuka, S., Tsuchikane, Y., Abe, J., Sekimoto, H.
Organizer
International symposium of cell-cell communication in plant reproduction-from pollination to fertilization
Place of Presentation
奈良県新公会堂(奈良県)
Year and Date
2010-03-11
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