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Principles of promoter acquisition mechanism in symbiogenesis

Research Project

Project/Area Number 20017015
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas

Allocation TypeSingle-year Grants
Review Section Biological Sciences
Research InstitutionNagoya University

Principal Investigator

OBOKATA Junichi  Nagoya University, 遺伝子実験施設, 招へい教員 (50185667)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) YAMAMOTO Yoshiharu  岐阜大学, 応用生物科学部, 准教授 (50301784)
Project Period (FY) 2008 – 2009
Project Status Completed (Fiscal Year 2009)
Budget Amount *help
¥16,000,000 (Direct Cost: ¥16,000,000)
Fiscal Year 2009: ¥8,000,000 (Direct Cost: ¥8,000,000)
Fiscal Year 2008: ¥8,000,000 (Direct Cost: ¥8,000,000)
Keywordsシンビオジェネシス / プロモーター獲得 / クロマチンリモデリング / エピゲノム / H2A.Z / H3K4me3 / 植物ゲノム / ChIP-on-chip解析 / ChIP-on-chip / 遺伝子移動 / プロモーター / コアプロモーター / 転写開始点 / クリプティックプロモーター / 転写開始複合体 / クロマチン免疫沈降
Research Abstract

In endosymbiotic evolution, genes of the endosymbionts are gradually transferred to the host nucleus whereby they obtained new promoters to become functional host genes. We analyzed the molecular process of this promoter acquisition, using promoter trap lines of Arabidopsis as a model system. As a result, we found that the promoter acquisition occurs in three types ; namely de novo origination type, trapping preexisting promoter type, and the combination type of the former two. Further analyses of these subtypes revealed that the de novo origination of new promoters is closely related with chromatin remodeling that occurs at the insertion sites of the coding sequences.

Report

(3 results)
  • 2009 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2008 Annual Research Report
  • Research Products

    (56 results)

All 2010 2009 2008 Other

All Journal Article (15 results) (of which Peer Reviewed: 13 results) Presentation (28 results) Book (9 results) Remarks (4 results)

  • [Journal Article] 高等植物におけるpol-II依存性プロモーター2010

    • Author(s)
      山本義治
    • Journal Title

      横浜市立大学論叢 60

      Pages: 133-142

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    • Journal Title

      Plant Cell Physiol 50

      Pages: 1116-1126

    • NAID

      130006995093

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Published: 2008-04-01   Modified: 2018-03-28  

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