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NMRによる蛋白質構造の協調的内部運動と機能制御相関解析

Research Project

Project/Area Number 20050022
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas

Allocation TypeSingle-year Grants
Review Section Science and Engineering
Research InstitutionHiroshima University

Principal Investigator

楯 真一  Hiroshima University, 理学研究科, 教授 (20216998)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 大前 英司  広島大学, 理学研究科, 助教 (30284152)
Project Period (FY) 2008 – 2009
Project Status Completed (Fiscal Year 2009)
Budget Amount *help
¥3,200,000 (Direct Cost: ¥3,200,000)
Fiscal Year 2009: ¥1,600,000 (Direct Cost: ¥1,600,000)
Fiscal Year 2008: ¥1,600,000 (Direct Cost: ¥1,600,000)
Keywords生物物理 / 生体分子 / 蛋白質 / NMR / 酵素反応 / スピン緩和 / 安定同位体 / 構造揺らぎ
Research Abstract

本年度は,以下の研究成果を得た.
1. DHFRループ変異体の内部運動性解析
初年度に引き続いてG67A,G67V変異体の内部運動性の解析をすすめた.本年度は,野生体とG67V,G67A変異体により誘導される内部運動性変化の再現性を含めた実験精度の検証を行うと同時に,内部運動速度の分布を精密に解析した.その結果,活性変調が観測されたG67Vでは,内部運動速度は750sec^<-1>を中心に分布しているが,活性変化の小さいG67Aと野生体は500sec^<-1>を中心とした速度分布を持っている.また,揺らぎを持つ構造部も,G67VはG67Aおよび野生体と異なっていることが分かった.構造揺らぎの速度・構造上の分布の違いが活性変調と関係することが示唆された.
2. ストップドフローを用いたDHFR変異体の反応速度変化
G67V変異体のkcatの低下がどのような反応ステップの変調によるかを解析した.その結果,hydride transfer速度は約20%低下していることが分かった,観測されたkcat変化の全てがhydride transfer過程の低下により説明されるものではないが,構造揺らぎの変化がhydride transfer過程にも影響を与えることを明らかにした.

Report

(2 results)
  • 2009 Annual Research Report
  • 2008 Annual Research Report
  • Research Products

    (27 results)

All 2010 2009 2008

All Journal Article (7 results) (of which Peer Reviewed: 7 results) Presentation (18 results) Book (2 results)

  • [Journal Article] Prorine cis/trans isomerase Pinl regulates peroxisome proliferator-activated receptor g activity through the direct binding to the AF-1 domain.2010

    • Author(s)
      Fujimoto, Y., Shiraki, T., Horiuchi, Y., Waku, T., Shigenaga, A., Otaka, A., Ikura, T., Igarashi, K., Aimoto, S., Tate, S., ^*Morikawa, K.
    • Journal Title

      J.Biol. Chem. 285

      Pages: 3126-3132

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      Horiuchi, Y., Ohmae, E., ^*Tate, S., ^*Gekko, K
    • Journal Title

      Biochimica et Biophysica Acta 1804

      Pages: 846-855

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      Matsuo, K., Watanabe, H., Tate, S., Tachibana, H., ^*Gekko, K
    • Journal Title

      Proteins 77

      Pages: 191-201

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      Tsunaka, Y., Toga, J., Yamaguchi, H., Tate, S., Hirose, S., ^*Morikawa, K.
    • Journal Title

      J.Biol. Chem. 284

      Pages: 24610-24621

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    • Author(s)
      Murakami, C., ^*Ohmae, E., Tate, S., Gekko, K., Nakasako, K., Kato, C.
    • Journal Title

      J.Biochem. (Tokyo) 147

      Pages: 591-599

    • NAID

      10027875351

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      K. Matsuo, H. Watanabe, S. Tate, H. Tachibana, and K. Gekko
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      E. Ohmae, M. Tatsuta, F. Abe, C. Kato, N. Tanaka, S, Kunugi, and K. Gekko
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      Boichem. Biophys. Acta-proteins and proteomic 1784

      Pages: 1115-1121

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      上脇準一, 森内寛, 楯直子, 楯真一
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      愛媛
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      上脇準一, 森内寛, 楯直子, 楯真一
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      第82回日本生化学会大会 シンポジウム
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      徳島
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      2009-10-29
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      楯真一
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      第82回日本生化学会大会 シンポジウム
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      神戸
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      2009-10-21
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      2009-07-31
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      大阪大学蛋白質研究所セミナー「溶液NMRの方法論的の新展開と生体分子への応用」
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      2009-03-05
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      長崎
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      2008-11-15
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      楯真一
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      岸本浩一, 楯真一
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      日本生物物理学会第1回中国四国支部大会
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      高知
    • Year and Date
      2008-05-10
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  • [Presentation] タンパク質の内部運動による機能制御機構の実験的解明2008

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      大前英司, 堀内祐司, 月向邦彦, 楯真一
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      第46回日本生物物理学会
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  • [Book] 高圧バイオサイエンスとバイオテクノロジー2巻2008

    • Author(s)
      大前英司、村上千穂、楯真一、月向邦彦、加藤千明
    • Publisher
      さんえい出版
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  • [Book] Protein adaptation to high-pressure environments. in Protein Adaptation in Extremophiles., in : Protein Adaptation in Extremophiles. Molecular Anatomy and Physiology of proteins series (Eds. Thomas, T. and Siddiqui, K. S.)2008

    • Author(s)
      C. Kato, T. Sato, F. Abe, E. Ohmae, H. Tamegai, K. Nakasone, K. Siddiqui, and T. Thomas
    • Publisher
      Nova Science Publisher
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URL: 

Published: 2008-04-01   Modified: 2018-03-28  

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