• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to previous page

X線結晶構造解析による26Sプロテアソーム蛋白質分解酵素複合体の構造及び機能解析

Research Project

Project/Area Number 20051010
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas

Allocation TypeSingle-year Grants
Review Section Biological Sciences
Research InstitutionNagoya City University

Principal Investigator

水島 恒裕  Nagoya City University, 大学院・薬学研究科, 准教授 (90362269)

Project Period (FY) 2008 – 2009
Project Status Completed (Fiscal Year 2009)
Budget Amount *help
¥6,100,000 (Direct Cost: ¥6,100,000)
Fiscal Year 2009: ¥3,000,000 (Direct Cost: ¥3,000,000)
Fiscal Year 2008: ¥3,100,000 (Direct Cost: ¥3,100,000)
Keywordsプロテアソーム / 超分子複合体 / X線結晶構造解析 / 蛋白質分解 / 制御因子PA700 / シャペロン / 四次構造形成
Research Abstract

26Sプロテアソームは分子量250万、総サブユニット約70(約35種類)の巨大なプロテアーゼ複合体である。本酵素はタンパク質分解活性を持つ20Sプロテアソームの両端に、ユビキチン鎖の認識、タンパク質のアンフォールディング、ユビキチン鎖の除去などの役割を有する19S制御タンパク質複合体(Rpt1-6, Rpn1-3, 5-13, 15)が2分子会合した状態で存在し高度な機能を獲得している。超分子複合体を形成することにより獲得されたプロテアソームの高度な機能の理解を目指し、プロテアソーム及び関与するタンパク質群のX線結晶構造解析および機能解析を行った。
26Sプロテアソームの結晶化では酵母を用いた発現系及び結晶化条件の検討により微結晶の作製に成功した。また、プロテアソーム四次構造形成において、特異的に働く専用シャペロンタンパク質の存在が報告されており、機能解明を目的としてシャペロンタンパク質のX線結晶構造解析を行った。解析は19S制御タンパク質複合体シャペロンであるRpn14の結晶化を行い単独状態の立体構造を決定した。その結果、Rpn14はβプロペラ構造を形成していた。また、決定した立体構造をもとにシャペロンタンパク質によるRptタンパク質認識機構の解析を行い、Rpn14の酸性表面とRpt6の塩基性表面の相補的な電荷分布が複合体の形成に重要であることを、変異体を作製した解析により明らかにした。

Report

(2 results)
  • 2009 Annual Research Report
  • 2008 Annual Research Report
  • Research Products

    (14 results)

All 2010 2009 2008

All Journal Article (7 results) (of which Peer Reviewed: 6 results) Presentation (7 results)

  • [Journal Article] Crystallization and preliminary X-ray characxterization of the SKp1-Fbg3 complex.2010

    • Author(s)
      Kumanomidou T, Nakagawa, T, Mizushima T, Suzuki A< Tokunaga F, Iwai K, Yoshida Y, Tanaka K, Yamane T
    • Journal Title

      Acta Crystallographica Section F 66

      Pages: 95-98

    • Related Report
      2009 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Crystal Stucture of Yeast Rpn14, a Chaperone of the 19S Regulatory Particle of the Proteasome.2010

    • Author(s)
      Kim S, Saeki Y, Fukunaga K, Suzuki A< Takagi K, Yamane T, Tanaka K, Mizushima T, Kato K
    • Journal Title

      J.Biol.Chem. (印刷中)

    • Related Report
      2009 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Crystal structure of the deubiquitinating enzyme UCH37 (human UCH-L5) catalytic domain.2009

    • Author(s)
      Nishio K, Kim SW, Kawai K, Mizushima T, Yamane T, Hamazaki J, Murata S, Tanaka K, Morimoto
    • Journal Title

      Biochem Biophys Res Commun. 390

      Pages: 855-860

    • Related Report
      2009 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Structure of D-amino-acid amidase complexed with L-phenylalanine with L-phenylalanine amide : insight into D-stereospecificity of D-amino-acid amidase from Ochrobacterum anthropi SV32008

    • Author(s)
      Okazaki S, Suzuki A, Mizushima T, Komeda H, Asano Y, Yamane T
    • Journal Title

      Acta Cryst : D 64

      Pages: 331-334

    • Related Report
      2008 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Structural basis for sorting mechanism of p62 in selective autophagy2008

    • Author(s)
      Ichimura Y, Kumanomidou T, Sou Y, Mizushima, T, Ezaki, J, Ueno T, Kominami F Yamane T Tanaka K. Komatsu M
    • Journal Title

      J. Biol. Chem 283

      Pages: 22847-22857

    • Related Report
      2008 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] The novel structure of a pyridoxal 5'-phosphate-dependent fold-type Iracemase, alpha-amino-epsilon-caprolactam racemase from Achromobacter obae2008

    • Author(s)
      Okazaki S, Suzuki A, Mizushima T, Kawano T, Komeda H, Asano Y, Yamane T
    • Journal Title

      Biochemistry 48

      Pages: 941-950

    • Related Report
      2008 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] 出芽酵母20Sプロテアソーム形成に関わるシャペロン複合体Dmp1/Dmp2の立体構造解析2008

    • Author(s)
      八代田英樹、水島恒裕
    • Journal Title

      細胞工学 27

      Pages: 474-475

    • Related Report
      2008 Annual Research Report
  • [Presentation] コビキチンリガーゼによる糖タンパク質品質管理における糖鎖認識機構の解析2009

    • Author(s)
      水島恒裕、熊埜御堂太一、鈴木淳巨、山根隆、加藤晃
    • Organizer
      糖鎖科学名古屋拠点 第7回「若手の力」フォーラムおよび拠点共同研究報告会
    • Place of Presentation
      名古屋
    • Year and Date
      2009-09-30
    • Related Report
      2009 Annual Research Report
  • [Presentation] 鎖認識ユビキチンリガーゼFbsファミリーの構造と反応機構2009

    • Author(s)
      水島恒裕
    • Organizer
      第4回プロテオミクス・構造生物学講演会
    • Place of Presentation
      岡崎
    • Year and Date
      2009-01-30
    • Related Report
      2008 Annual Research Report
  • [Presentation] プロテアソーム制御因子複合体形成シャペロンのX線結晶構造解析2009

    • Author(s)
      水島恒裕、金相佑、佐伯泰、田中啓二、加藤晃一
    • Organizer
      特定領域研究 超分子構造 第6回公開シンポジウム
    • Place of Presentation
      大阪
    • Related Report
      2009 Annual Research Report
  • [Presentation] STRUCTURE BASIS FOR RECOGNITION OF GLYCOSYLAT ED SUBSTRATES BY SCFFbsi UBIQUITIN LIGASE2008

    • Author(s)
      T. Mizushima, Y. Yoshida, T. Kumanomidou, Y. Yamaguchi, T. Yamane, K. Tanaka, K. Kato
    • Organizer
      ZOMES V
    • Place of Presentation
      Yokohama, Japan
    • Year and Date
      2008-11-13
    • Related Report
      2008 Annual Research Report
  • [Presentation] X-ray Structure of the Skpl-Fbsi glycoprotein complex2008

    • Author(s)
      T. Mizushima, Y. Yoshida, T. Kumanomidou, Y. Hasegawa, A. Suzuki, T. Yamane, K. Tanaka
    • Organizer
      FEBS Congress & IUBMB Conference
    • Place of Presentation
      Athens, Greece
    • Year and Date
      2008-06-30
    • Related Report
      2008 Annual Research Report
  • [Presentation] プロテアソームシャペロンDmp1-Dmp2複合体による20Sプロテアソーム分子集合機構2008

    • Author(s)
      水島恒裕、八代田英樹、田中啓二
    • Organizer
      日本蛋白質科学会
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      2008-06-12
    • Related Report
      2008 Annual Research Report
  • [Presentation] 酵母20Sプロテアソーム構造形成に関与するシャペロンDmp1-Dmp2の役割2008

    • Author(s)
      水島恒裕、高木賢治、八代田英樹、栗本英治、田中啓二、加藤晃一
    • Organizer
      特定領域研究「生体超分子構造」第5回公開シンポジウム
    • Place of Presentation
      つくば
    • Related Report
      2008 Annual Research Report

URL: 

Published: 2008-04-01   Modified: 2018-03-28  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi