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転写制御における基本転写因子TFIIDサブユニット(TAFs)の分子機能

Research Project

Project/Area Number 20052024
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas

Allocation TypeSingle-year Grants
Review Section Biological Sciences
Research InstitutionYokohama City University

Principal Investigator

古久保 哲朗  Yokohama City University, 生命ナノシステム科学研究科, 教授 (10271587)

Project Period (FY) 2008 – 2009
Project Status Completed (Fiscal Year 2009)
Budget Amount *help
¥7,200,000 (Direct Cost: ¥7,200,000)
Fiscal Year 2009: ¥3,600,000 (Direct Cost: ¥3,600,000)
Fiscal Year 2008: ¥3,600,000 (Direct Cost: ¥3,600,000)
Keywords転写調節機構 / 転写因子 / 基本転写因子 / 転写制御 / 出芽酵母 / TFIID / TAF / TBP
Research Abstract

コアプロモーター構造を認識する基本転写因子TFIIDは、TATAボックス結合タンパク質(TBP)と14種類のTBP随伴因子(TAF1-14)から構成される巨大なタンパク質複合体であり、転写調節因子から受け取った信号を転写量の増減へと変換する上で中心的な役割を果たす。一方、5種類のサブユニット(TAF5,6,9,10,12)をTFIIDと共有するSAGAはヒストンをアセチル化するとともにTBPのTATA配列への結合を補助する働きを有する。コアプロモーター中にTATA配列を含むストレス誘導性遺伝子ならびにTATA配列を含まないハウスキーピング遺伝子はそれぞれ主にSAGA, TFIIDによって転写されると考えられているが、その詳細については不明な点が多い。
今回我々は、TFIIDとSAGAの機能分担について新たな知見を得るべくChIP on chip解析を行った。具体的にはTFIIDの全サブユニット(TAF1-14, TBP)、SAGA(GCN5)、基本転写因子群(TFIIB(SUA7), TFIIE(TFA2), TFIIF(TFG1), TFIIH(TFB3)), NC2(BUR6, NCB2),RNAポリメラーゼII(RPB1)のC末端にエピトープタグを付加し、野生株及びtaf1変異株において、これらの因子がゲノム上(第III, IV, V染色体)のどの領域に結合するかを詳細に調べた。その結果、(1)TFIIBとNC2の機能連関、(2)TFIIDとSAGAのリボソーム遺伝子(RPG)プロモーターへの共結合、(3)RPGプロモーター上におけるtaf1変異による転写異常の分子機序、(4)TAF2の結合特異性、(5)コアプロモーターごとにTFIIDの高次構造が異なる可能性、等々複数の興味深い知見が得られた。

Report

(2 results)
  • 2009 Annual Research Report
  • 2008 Annual Research Report
  • Research Products

    (9 results)

All 2010 2009 2008

All Journal Article (4 results) (of which Peer Reviewed: 4 results) Presentation (5 results)

  • [Journal Article] Genome-wide localization analysis of a complete set of Tafs revealsa specific effect of the taf1 mutation on Taf2 occupancy and provides indirect evidence for different TFIID conformations at different promoters.2010

    • Author(s)
      Ohtsuki K, Kasahara K, Shirahige K, Kokubo T.
    • Journal Title

      Nucleic Acids Research Vol.38

      Pages: 1805-1820

    • Related Report
      2009 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Structure-function correlation of microl for micromere specification insea urchin embryos.2009

    • Author(s)
      Yamazaki A, Ki S, Kokubo T, Yamaguchi M.
    • Journal Title

      Mechanisms of Development Vol.126

      Pages: 611-623

    • Related Report
      2009 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Saccharomyces cerevisiae Med9 comprises two functionally distinct domains that play different roles in transcriptional regulation2009

    • Author(s)
      Takahashi H, et.al.
    • Journal Title

      Genes to Cells 14・1

      Pages: 53-67

    • Related Report
      2008 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Molecular basis for SUMOylation-dependent regulation of DNA bindi ng activity of heat shock factor 22009

    • Author(s)
      Tateishi Y, et.al.
    • Journal Title

      Journal of Biological Chemistry 284・4

      Pages: 2435-2447

    • Related Report
      2008 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Deletion of the N-terminal domain of TAF1 (taf1-△TAND) exhibits synthetic lethality with mutations of the RAM signaling network in budding yeast2009

    • Author(s)
      Ohyama Y, Kasahara K, Kokubo T.
    • Organizer
      第32回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      横浜
    • Year and Date
      2009-12-09
    • Related Report
      2009 Annual Research Report
  • [Presentation] TFIIDサブユニットのゲノムワイドなプロモーター結合解析2008

    • Author(s)
      大槻和重, ら
    • Organizer
      BMB2008(第31回日本分子生物学会年会&第81回日本生化学会大会)
    • Place of Presentation
      神戸
    • Year and Date
      2008-12-10
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      2008 Annual Research Report
  • [Presentation] 出芽酵母のHMGBファミリータンパク質HMO1によるリボソームタンパク質遺伝子の転写開始点決定機構2008

    • Author(s)
      笠原浩司, ら
    • Organizer
      BMB2008(第31回日本分子生物学会年会&第81回日本生化学会大会)
    • Place of Presentation
      神戸
    • Year and Date
      2008-12-09
    • Related Report
      2008 Annual Research Report
  • [Presentation] 出芽酵母BEM4に見出された転写因子としての新たな機能2008

    • Author(s)
      小林晶子, ら
    • Organizer
      BMB2008(第31回日本分子生物学会年会&第81回日本生化学会大会)
    • Place of Presentation
      神戸
    • Year and Date
      2008-12-09
    • Related Report
      2008 Annual Research Report
  • [Presentation] Molecular function of HM01 at ribosomal protein gene promoters2008

    • Author(s)
      笠原浩司, ら
    • Organizer
      内藤コンファレンス/Nuclear Damics and RNA[I]
    • Place of Presentation
      八ヶ岳
    • Year and Date
      2008-06-25
    • Related Report
      2008 Annual Research Report

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Published: 2008-04-01   Modified: 2018-03-28  

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