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Sec膜透過・組込みシステムの制御

Research Project

Project/Area Number 20059019
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas

Allocation TypeSingle-year Grants
Review Section Biological Sciences
Research InstitutionKyoto Sangyo University (2009)
Kyoto University (2008)

Principal Investigator

伊藤 維昭  Kyoto Sangyo University, 工学部, 教授 (90027334)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 千葉 志信  京都大学, ウイルス研究所, 助教 (20523517)
Project Period (FY) 2008 – 2009
Project Status Completed (Fiscal Year 2009)
Budget Amount *help
¥7,000,000 (Direct Cost: ¥7,000,000)
Fiscal Year 2009: ¥3,500,000 (Direct Cost: ¥3,500,000)
Fiscal Year 2008: ¥3,500,000 (Direct Cost: ¥3,500,000)
Keywordsタンパク質膜透過 / 膜タンパク質 / SecM / SecA / SecY / YidC / SecDF
Research Abstract

1. 原核細胞に於けるタンパク質膜透過を促進する膜因子SecDFの立体構造を高度好熱菌を用いて結晶解析などにより決定した。その結果SecDFのペリプラズム領域が二つの異なる構造をとり得ること、変性タンパク質結合能をもつことを見いだした。また、SecDFの膜貫通領域の配置がプロトン駆動力により駆動される薬剤排出ポンプであるAcrBと相同であり、プロトンの流れに関与すると考えられている残基が保存されていること、その変異によりSecDFの膜透過促進能が損なわれるを見いだした。このような知見に基づき、SecDFはペリプラズムから基質を結合してプロトン駆動力によって膜透過を促進するとのモデルを提唱した。
2. SecMの分泌と翻訳アレストについてin vivoで解析するためpeptidyl-tRNAを検出する実験条件を確立した。パルスチェイス実験によりSecM自体の分泌と安定性を調べた結果、SecMは膜透過経路に乗ることによって速やかな分解を受けることを見いだした。
3. 膜タンパク質組込み装置の制御に関して、枯草菌を用いた解析により、組込み装置YidCの翻訳がSecMと類似の翻訳アレスト現象によって制御されていることを見いだした。枯草菌のMifMタンパク質は、カルボキシ末端付近に自身の翻訳を一時停止させるアミノ酸配列を持ち、そのアレストモチーフがリボソームのトンネルと相互作用することで翻訳アレストを起こす。一方、アミノ末端に膜組込配列を持ち、膜組込因子YidCの基質として振る舞う。そして、MifMが正しく局在化される過程と共役して翻訳アレストが解除されるが、局在化の過程に異常が生じると翻訳停止が継続し、mRNA上に停止したリボソームによるmRNAの二次構造破壊を介して、オペロン下流に存在するyidC2の翻訳を促進することを示した。

Report

(2 results)
  • 2009 Annual Research Report
  • 2008 Annual Research Report
  • Research Products

    (9 results)

All 2010 2009 2008

All Journal Article (7 results) (of which Peer Reviewed: 7 results) Presentation (1 results) Book (1 results)

  • [Journal Article] Divergent stalling sequences sense and control cellular physiology2010

    • Author(s)
      Ito, K.
    • Journal Title

      Biochemical Biophysical Research Communications 393

      Pages: 1-5

    • Related Report
      2009 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Dynamic nature of disulphide bond formation catalysts revealed by tryst al structures of DsbB.2009

    • Author(s)
      Inaba, K.
    • Journal Title

      The EMBO Journal 28

      Pages: 779-791

    • Related Report
      2009 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Editing disulphide bonds : error correction using redox currencies2009

    • Author(s)
      Ito, K.
    • Journal Title

      Molecular Microbiology 75

      Pages: 1-5

    • Related Report
      2009 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] A ribosome-nascent chain sensor of membrane protein biogenesis in Bacillus subtilis2009

    • Author(s)
      Chiba, S.
    • Journal Title

      The EMBO Journal 28

      Pages: 3461-3475

    • Related Report
      2009 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Peptidyl-prolyl-tRNA at the ribosomal P site reacts poorly with puromycin2008

    • Author(s)
      Muto, H. and Ito, K
    • Journal Title

      Biochemical Biophysical Research Communications 366

      Pages: 1043-1047

    • Related Report
      2008 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Conformational transition of Sec machinery inferred from bacterial SecYE structures2008

    • Author(s)
      Tadmald, T., Mod, H., Fukai, S., Ishitani, K. Mori. T., Dohmae, N., Perederina, A. Sugita, Y., Vassylyev, D.G., Ito, K. and Nureld. O
    • Journal Title

      Nature 455

      Pages: 988-991

    • Related Report
      2008 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] The disulfide bond formation (Dsb) system2008

    • Author(s)
      Ito, K. and Inaba, K
    • Journal Title

      Current Opinions in Structural Biology 18

      Pages: 450-458

    • Related Report
      2008 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Quality control pathways used to monitor membrane protein abnormalities and roles of translocon in the enrrent biogenesis of membrane proteins2008

    • Author(s)
      Ito, K
    • Organizer
      The 108th American Society for Microbiology General Meeting
    • Place of Presentation
      Boston, U. S. A
    • Year and Date
      2008-06-05
    • Related Report
      2008 Annual Research Report
  • [Book] Bacterial Secreted Proteins2009

    • Author(s)
      K.Wooldridge 編著
    • Publisher
      Caister Academic Press, Norfolk, UK
    • Related Report
      2009 Annual Research Report

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Published: 2008-04-01   Modified: 2018-03-28  

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