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Whole genome screening of plant membrane transporter for inorganic elements

Research Project

Project/Area Number 20200031
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research a proposed research project)

Allocation TypeSingle-year Grants
Research Field Functional biochemistry
Applied genomics
Research InstitutionNagoya University

Principal Investigator

NAKANISHI Yoichi  名古屋大学, 生命農学研究科, 助教 (60362290)

Co-Investigator(Renkei-kenkyūsha) MAESHIMA Masayoshi  名古屋大学, 大学院・生命農学研究科, 教授 (80181577)
FUJIWARA Toru  東京大学, 農学生命科学研究科, 教授 (80242163)
NIIMI Tomoaki  名古屋大学, 大学院・生命農学研究科, 助教 (30377791)
Research Collaborator NAKANISHI Hanayo  名古屋大学, 学術振興会RPD
瀬上 紹嗣  名古屋大学, 大学院・生命農学研究科, 大学院生
三上 俊之  名古屋大学, 大学院・生命農学研究科, 大学院生
佐古 建志  名古屋大学, 大学院・生命農学研究科, 大学院生
前田 道子  名古屋大学, 大学院・生命農学研究科, 大学院生
幡谷 恵莉子  名古屋大学, 農学部, 学部学生
今井 悠  名古屋大学, 農学部, 学部学生
飯田 俊太郎  名古屋大学, 農学部, 学部学生
川嶋 輝美  名古屋大学, 農学部, 学部学生
佐藤 世理  名古屋大学, 技術補佐員
Project Period (FY) 2008 – 2010
Project Status Completed (Fiscal Year 2010)
Budget Amount *help
¥31,460,000 (Direct Cost: ¥24,200,000、Indirect Cost: ¥7,260,000)
Fiscal Year 2010: ¥10,270,000 (Direct Cost: ¥7,900,000、Indirect Cost: ¥2,370,000)
Fiscal Year 2009: ¥10,270,000 (Direct Cost: ¥7,900,000、Indirect Cost: ¥2,370,000)
Fiscal Year 2008: ¥10,920,000 (Direct Cost: ¥8,400,000、Indirect Cost: ¥2,520,000)
Keywords膜輸送と輸送タンパク質 / 機能ゲノミクス / 微量元素 / 膜輸送
Research Abstract

Plant cells contain all elements of the universe. Transporters that import/export inorganic elements have been poorly identified yet. In Arabidopsis genome, about 1,400 transporter-related genes were fond in silico, of which function is almost unknown. To overcome whole genome screening from possible candidates, we constructed an expression library consisted of the transporter gene(s). We cloned 1,380 genes (98% of candidates). Expression screening by use of the library has been shown to be powerful tool for identification of novel transporters. We screened five candidate genes that posed tolerance of heavy metal elements (Mn, Ni, Zn, Cd) to host organisms. We also developed research tools that can analyze level(s) of element(s) in living organisms.

Report

(4 results)
  • 2010 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2009 Annual Research Report
  • 2008 Annual Research Report
  • Research Products

    (22 results)

All 2012 2011 2010 2009 2008

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 2 results) Presentation (18 results) Patent(Industrial Property Rights) (2 results)

  • [Journal Article] Quantification, organ-specific accumulation and intracellular localization of type II H(+)-pyrophosphatase in Arabidopsis thaliana2010

    • Author(s)
      Segami S, Nakanishi Y, Sato MH, Maeshima M.
    • Journal Title

      Plant & Cell Physiology

      Volume: 51 Pages: 1350-1360

    • NAID

      10027351678

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      中西洋一
    • Industrial Property Rights Holder
      名古屋大学
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      2010-152448
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      2010-152448
    • Filing Date
      2010-07-02
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Published: 2008-04-01   Modified: 2018-03-28  

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