Development of single crystal structure analysis system for humidity-and temperature-induced phase transition

• Project/Area Number: 20560015
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• Allocation Type: Single-year Grants
• Section: 一般
• Research Field: Applied materials science/Crystal engineering
• Research Institution: Kitasato University
• Principal Investigator: YAMAMURA Shigefumi Kitasato University, 理学部, 講師 (40286373)
• Project Period (FY): 2008 – 2010
• Project Status: Completed (Fiscal Year 2010)
• Budget Amount: ¥4,810,000 (Direct Cost: ¥3,700,000、Indirect Cost: ¥1,110,000); Fiscal Year 2010: ¥390,000 (Direct Cost: ¥300,000、Indirect Cost: ¥90,000); Fiscal Year 2009: ¥1,170,000 (Direct Cost: ¥900,000、Indirect Cost: ¥270,000); Fiscal Year 2008: ¥3,250,000 (Direct Cost: ¥2,500,000、Indirect Cost: ¥750,000)
• Keywords: 湿度・温度 / 構造転移 / 水和物 / 結晶構造解析 / 生体分子 / ヌクレオチド / タンパク質

Research Abstract

Temperature and humidity control device for single crystal structure analysis was newly designed. Temperature-and humidity-dependence of crystal structure for several biomolecules such as nucleotide hydrates which are components of nucleic acid and proteins was revealed using an X-ray diffractometer equipped with the newly developed temperature and humidity controlled air flow device.

Research Products

• [Journal Article] New monoclinic form of bovine pancreatic ribonuclease A from a salt solution and comparison of intermolecular interactions in ribonucleases A (2011)
  • Author(s): H. Takusagawa, S. Yamamura, S. Endo, Y. Sugawara, T. Inagaki, M. Nakasako
  • Journal Title: J.Cryst.Growth 31319 Pages: 49-56
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] New monoclinic form of bovine pancreatic ribonuclease A from a salt solution and comparison of intermolecular interactions in ribonucleases A (2011)
  • Author(s): H.Takusagawa, S.Yamamura, S.Endo, Y.Sugawara, T.Inagaki, M.Nakasako
  • Journal Title: J.Cryst.Growth Volume: 319 Pages: 49-56
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Influence of magnetic field upon the conductance of a unicomponent crystal of tetrathiafulvalene-based nitronyl nitroxide (2010)
  • Author(s): H. Komatsu, M.M. Matsushita, S. Yamamura, Y. Sugawara, T. Sugawara
  • Journal Title: J.Am.Chem.Soc. 132 Pages: 4528-4529
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Influence of magnetic field upon the conductance of a unicomponent crystal of a tetrathiafulvalene-based nitronyl nitroxide (2010)
  • Author(s): H.Komatsu, M.M.Matsushita, S.Yamamura, Y.Sugawara, K.Suzuki, T.Sugawara
  • Journal Title: J.Am.Chem.Soc. 132(in press)
  • Peer Reviewed
• [Presentation] ウリジンヌクレオチド水和物結晶における疑似多形の解析 (2011)
  • Author(s): 穴井佑弥、山村滋典、菅原洋子
  • Organizer: 日本化学会第91回春季年会
  • Place of Presentation: 神奈川大学(神奈川県)
  • Year and Date: 2011-03-27
• [Presentation] タンパク質結晶多形における分子間相互作用の解析 (2011)
  • Author(s): 奥田悠介、田草川英昇、山村滋典、猿渡茂、菅原洋子
  • Organizer: 日本物理学会第66回年次大会
  • Place of Presentation: 新潟大学(新潟県)
  • Year and Date: 2011-03-26
• [Presentation] ウリジンヌクレオチド水和物結晶における疑似多形の解析 (2011)
  • Author(s): 穴井佑弥、山村滋典、菅原洋子
  • Organizer: 日本化学会第91回春季年会(2011)講演予稿集
  • Year and Date: 2011-03-11
• [Presentation] 茨城県生命物質構造解析装置iBIXによるウリジン5'-一リン酸二ナトリウム七水和物の中性子結晶構造解析 (2010)
  • Author(s): 山村滋典、菅原洋子、日下勝弘、山田太郎、大原高志、田中伊知朗
  • Organizer: 日本中性子科学会第10回年会
  • Place of Presentation: 東北大学(宮城県)
  • Year and Date: 2010-12-11
• [Presentation] 茨城県生命物質構造解析装置iBIXによるウリジン5'-一リン酸ニナトリウム七水和物の中性子結晶構造解析 (2010)
  • Author(s): 山村滋典、菅原洋子、日下勝弘、山田太郎、大原高志、田中伊知朗
  • Organizer: 日本中性子科学会第10回年会
  • Place of Presentation: 東北大学(宮城県)
  • Year and Date: 2010-12-11
• [Presentation] SPring-8/BL19B2に導入された湿度可変粉末回折装置によるグアノシン水和物の構造転移の観測 (2010)
  • Author(s): 山村滋典、三浦圭子、菅原洋子
  • Organizer: 日本結晶学会平成22年度年会
  • Place of Presentation: 大阪大学(大阪府)
  • Year and Date: 2010-12-05
• [Presentation] SPring-8/BL19B2に導入した粉末回折その場脱水・水和転移実験のための湿度可変装置 (2010)
  • Author(s): 三浦圭子、大坂恵一、山村滋典、菅原洋子
  • Organizer: 日本結晶学会平成22年度年会
  • Place of Presentation: 大阪大学(大阪府)
  • Year and Date: 2010-12-03
• [Presentation] RNaseA新規三斜晶の構造と分子間相互作用の解析 (2010)
  • Author(s): 田草川英昇、山村滋典、猿渡茂、菅原洋子、中迫雅由
  • Organizer: 日本結晶学会平成22年度年会
  • Place of Presentation: 大阪大学(大阪府)
  • Year and Date: 2010-12-03
• [Presentation] アデノシン5'-一リン酸ナトリウム塩の水和物結晶にみられる結晶多形と相対湿度依存相転移 (2010)
  • Author(s): 高柳敬介、山村滋典、菅原洋子
  • Organizer: 日本結晶学会平成22年度年会
  • Place of Presentation: 大阪大学(大阪府)
  • Year and Date: 2010-12-03
• [Presentation] Water-mediated crystal transformations of D-xylose isomerase and thaumatin (2010)
  • Author(s): S.Yamamura, A.Ishiguro, M.Ootaki, S.Endo, Y.Sugawara, T.Inagaki, M.Nakasako
  • Organizer: The 3rd International Symposium on Diffraction Structural Biology
  • Place of Presentation: パリ(フランス)
  • Year and Date: 2010-05-27
• [Presentation] DNA・RNA構成分子の水和結晶中での水分子のゆらぎの解析 (2010)
  • Author(s): 菅原洋子、山村滋典
  • Organizer: 第1回MLFシンポジウム
  • Place of Presentation: いばらき量子ビーム研究センター(茨城県)(依頼講演)
  • Year and Date: 2010-03-30
• [Presentation] DNA・RNA構成分子の水和結晶中での水分子のゆらぎの解析 (2010)
  • Author(s): 菅原洋子、山村滋典
  • Organizer: 第1回MLFシンポジウム(依頼講演)
  • Place of Presentation: いばらき量子ビーム研究センター(茨城県)
  • Year and Date: 2010-03-30
• [Presentation] DNA・RNA構成分子の水和結晶中で水分子の動きを中性構造解析で見る (2010)
  • Author(s): 山村滋典、菅原洋子
  • Organizer: 茨城県中性子ビームライン成果報告会
  • Place of Presentation: 東京国際展示場(東京都)(依頼講演)
  • Year and Date: 2010-02-18
• [Presentation] DNA・RNA構成分子の水和結晶中で水分子の動きを中性構造解析で見る (2010)
  • Author(s): 山村滋典、菅原洋子
  • Organizer: 茨城県中性子ビームライン成果報告会(依頼講演)
  • Place of Presentation: 東京国際展示場(東京都)
  • Year and Date: 2010-02-18
• [Presentation] Water-mediated crystal transformations of D-xylose isomerase and thaumatin (2010)
  • Author(s): S.Yamamura, A.Ishiguro, M.Ootaki, S.Endo, Y.Sugawara, T.Inagaki, M.Nakasako
  • Organizer: The 3rd International Symposium on Diffraction Structural Biology
  • Place of Presentation: Paris(France)
• [Presentation] 新規なRNaseA単斜晶の構造決定と結晶多形の解析 (2009)
  • Author(s): 田草川英昇、山村滋典、猿渡茂、菅原洋子、中迫雅由
  • Organizer: 日本結晶学会平成21年度年会
  • Place of Presentation: 関西学院大学(兵庫県)
  • Year and Date: 2009-12-06
• [Presentation] ウリジン5'-一リン酸二ナトリウム水和物にみられる構造の乱れと相対湿度に依存した構造転移 (2009)
  • Author(s): 長谷川啓太、山村滋典、菅原洋子
  • Organizer: 日本結晶学会平成21年度年会
  • Place of Presentation: 関西学院大学(兵庫県)
  • Year and Date: 2009-12-06
• [Presentation] グアノシン5'-一リン酸二ナトリウム水和物における湿度に依存した結晶構造変化 (2009)
  • Author(s): 山村滋典、室伏晃空、菅原洋子
  • Organizer: 第18回有機結晶シンポジウム
  • Place of Presentation: 東京大学(東京都)
  • Year and Date: 2009-11-09
• [Presentation] ウシ膵臓由来β-トリプシンの新規菱面体晶の結晶構造解析 (2009)
  • Author(s): 奥田悠介、山村滋典、菅原洋子
  • Organizer: 日本結晶学会平成21年度年会
  • Place of Presentation: 関西学院大学(兵庫県)
• [Presentation] アデノシン5'-一リン酸二ナトリウム水和物における温度-湿度依存相転移 (2009)
  • Author(s): 高柳敬介、山村滋典、菅原洋子
  • Organizer: 日本結晶学会平成21年度年会
  • Place of Presentation: 関西学院大学(兵庫県)
• [Presentation] アデノシン5'-ニリン酸一カリウム塩における二水和物-無水物間の相対湿度に依存した可逆的結晶構造転移 (2009)
  • Author(s): 穴井佑弥、山村滋典、菅原洋子
  • Organizer: 日本結晶学会平成21年度年会
  • Place of Presentation: 関西学院大学(兵庫県)
• [Presentation] アデノシン5'-二リン酸一カリウム塩における二水和物-無水物間の相対湿度に依存した可逆的結晶構造転移 (2009)
  • Author(s): 穴井佑弥、山村滋典、菅原洋子
  • Organizer: 日本結晶学会平成21年度年会
  • Place of Presentation: 関西学院大学(兵庫県)
• [Presentation] Polymorphs and humidity-induced transition of a serotonin receptor antagonist, C_29H_33N_3O_2・HCl・xH_2O (2008)
  • Author(s): S.Yamamura, A.Yamamoto, T.Maruyama, R.Nishi, A.Sugiyama, Y.Sugawara
  • Organizer: XXI Congress of the International Union of Crystallography
  • Place of Presentation: Osaka(Japan)
• [Presentation] Temperature-dependent disordered structure of (BEDT-TTF)_3Cl_2・5H_2O (2008)
  • Author(s): S. Nishikawa, S. Yamamura, Y.Sugawara, M.M.Matsushita, T.Sugawara
  • Organizer: XXI Congress of the International Union of Crystallography
  • Place of Presentation: Osaka(Japan)
• [Presentation] Genuine organic crystal exhibiting giant negative Magnetoresistance (2008)
  • Author(s): T.Sugawara, M.M.Matsushita, H.Komatsu, S.Yamamura, Y.Sugawara
  • Organizer: XXI Congress of the International Union of Crystallography
  • Place of Presentation: Osaka(Japan)
• [Presentation] Analysis of crystal growth of trigonal ribonuclease A from bovine pancreas (2008)
  • Author(s): H.Takusagawa, S.Yamamura, S.Endo, K.Ida, Y.Sugawara
  • Organizer: XXI Congress of the International Union of Crystallography
  • Place of Presentation: Osaka(Japan)
• [Presentation] Crystal morphology and surface microtopograph of disodium inosine 5'-monophosphate octahydrate (2008)
  • Author(s): K.Hasegawa, M.Ootaki, S.Yamamura, Y.Sugawara
  • Organizer: XXI Congress of the International Union of Crystallography
  • Place of Presentation: Osaka(Japan)
• [Presentation] Polymorphs and humidity-induced transition of a serotonin receptor antagonist, C_<29>H_<33>N_3O_2・HCl・xH_2O (2008)
  • Author(s): S. Yamamura. A. Yamamoto, T. Maruyama, R, Nishi, A. Sugiyama, Y. Sugawara
  • Organizer: XXI Congress of the International Union of Crystallography
  • Place of Presentation: Osaka, Japan
• [Presentation] Temperature-dependent disordered structure of (BEDT-TTF)_3Cl_2・5H_2O (2008)
  • Author(s): S. Nishikawa. S. Yamamura, Y. Sugawara, M. M. Matsushita, T. Sugawara
  • Organizer: XXI Congress of the International Union of Crystallography
  • Place of Presentation: Osaka, Japan
• [Presentation] Genuine organic crystal exhibiting giant negative magnetoresistance (2008)
  • Author(s): T. Sugawara, M. M. Matsushita, H. Komatsu, S. Yamamura. Y. Sugawara
  • Organizer: XXI Congress of the International Union of Crystallography
  • Place of Presentation: Osaka, Japan
• [Presentation] Analysis of crystal growth of trigonal ribonuclease A from bovine pancreas (2008)
  • Author(s): H. Takusagawa, s. Yamamura, S. Endo, K. Ida, Y. Sugawara
  • Organizer: XXI Congress of the International Union of Crystallography
  • Place of Presentation: Osaka, Japan
• [Presentation] Crystal morphology and surface microtopograph of disodium inosine 5'-monophosphate octahydrate (2008)
  • Author(s): K. Hasegawa, M. Ootaki, S. Yamamura. Y. Sugawara
  • Organizer: XXI Congress of the International Union of Crystallography
  • Place of Presentation: Osaka, Japan