Did duplicated genes of enzymes promote adaptive speciation in polyploids?

• Project/Area Number: 20570096
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• Allocation Type: Single-year Grants
• Section: 一般
• Research Field: Biodiversity/Systematics
• Research Institution: Osaka Prefecture University
• Principal Investigator: NISHINO Takako 大阪府立大学, 大学院・理学系研究科, 助教 (20264822)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): NAKAYAMA Yuichirou 大阪府立大学, 大学院・生命環境科学研究科, 助教 (50322368)
• Project Period (FY): 2008 – 2011
• Project Status: Completed (Fiscal Year 2011)
• Budget Amount: ¥4,940,000 (Direct Cost: ¥3,800,000、Indirect Cost: ¥1,140,000); Fiscal Year 2011: ¥520,000 (Direct Cost: ¥400,000、Indirect Cost: ¥120,000); Fiscal Year 2010: ¥780,000 (Direct Cost: ¥600,000、Indirect Cost: ¥180,000); Fiscal Year 2009: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000); Fiscal Year 2008: ¥2,210,000 (Direct Cost: ¥1,700,000、Indirect Cost: ¥510,000)
• Keywords: 種分化 / 倍数体 / 適応 / アルコール脱水素酵素 / 遺伝子重複 / アイソザイム / 嫌気ストレス / 倍数性 / 環境ストレス / キク科 / 分子進化 / 適応的種分化 / 嫌気条件

Research Abstract

In Asteraceae, we determined and compared the sequence of cDNA of ADH between the taxa with a little number of ADH isozymes and with the many number. Homologous genes are shown more than 90% homology and most substitutions are synonymous. The important functional regions of ADH proteins are preserved without non-synonymous substitutions. Furthermore purifying selection would be rejected by predictive estimation of speed of molecular evolution.

Research Products

• [Presentation] キク科二倍体におけるアルコール脱水素酵素の重複遺伝子の配列比較 (2012)
  • Author(s): 西内美穂子、矢原徹一、西野貴子
  • Organizer: 日本植物分類学会第11回大会
  • Place of Presentation: 大阪学院大学
• [Presentation] サワシロギクと蛇紋岩性近縁種シブカワシロギクの繁殖様式～結実率やアロメトリーをもとに～ (2012)
  • Author(s): 大久保理子、西内美穂子、舩木拓也、藤井伸二中山祐一郎, 西野貴子
  • Organizer: 日本植物分類学会第11回大会
  • Place of Presentation: 大阪学院大学
• [Presentation] Genetic diversity of the endangered endemic species Aster rugulosus growing in two different habitats, acidic swamps and a serpentine area East Asian Botany (2011)
  • Author(s): 西野貴子, Riko Okubo, Mihoko Nishiuchi, Asako Matsuo, Yuichiro Nakayama, Shinji Fujii.
  • Organizer: International Symposium 2011.
  • Place of Presentation: 筑波大学
  • Year and Date: 2011-03-19
• [Presentation] Variation and functional differentiation of duplicated alcohol Dehydrogenase in diploid plants of Asteraceae (2011)
  • Author(s): Takako Nishino, et al.
  • Organizer: XVIII International Botanical congress
  • Place of Presentation: Melbourne, Australia
• [Presentation] アロザイム多型によるサワシロギク集団の遺伝的分化の解析 (2011)
  • Author(s): 大久保理子、西内美穂子、藤井伸二, 中山祐一郎、西野貴子
  • Organizer: 日本植物学会第75回大会
  • Place of Presentation: 東京大学
• [Presentation] Genetic diversity of the endangered endemic species Aster rugulosus growing in two different habitats, acidic swamps and a serpentine area (2011)
  • Author(s): Takako Nishino, et al.
  • Organizer: East Asian Botany : International Symposium 2011
  • Place of Presentation: Tsukuba Univ.
• [Presentation] Genetic diversity of the endangered endemic species Aster rugulosus growing in two different habitats, acidic swamps and a serpentine area (2011)
  • Author(s): Takako Nishino, et al.
  • Organizer: East Asian Botany : International Symposium 2011
  • Place of Presentation: 筑波大学
• [Presentation] カワラヨモギ集団における河川の氾濫による遺伝的多様性の維持機構 (2010)
  • Author(s): 西野貴子、銭谷美乃里、山崎奈津子
  • Organizer: 日本植物分類学会第9回大会
  • Place of Presentation: 愛知教育大学
  • Year and Date: 2010-03-26
• [Presentation] カワラヨモギ集団における河川の氾濫による遺伝的多様性の維持機構 (2010)
  • Author(s): 西野貴子、銭谷美乃里、山崎奈津子
  • Organizer: 日本植物分類学会
  • Place of Presentation: 愛知教育大学
  • Year and Date: 2010-03-26
• [Presentation] サワシロギクAster ruglosusとシブカワシロギクA. ruglosus var. shibukawaensis集団における遺伝的多型の解析 (2009)
  • Author(s): 松尾朝子、西野貴子、藤井伸二、中山祐一郎、副島顕子
  • Organizer: 日本植物分類学会第8回大会
  • Place of Presentation: 東京エレクトロンホール宮城(宮城県民会館)
  • Year and Date: 2009-03-14
• [Presentation] サワシロギクAster ruglosusとシブカワシロギクA. ruglosusvar. shibukawaensis集団における遺伝的多型の解析 (2009)
  • Author(s): 西野貴子, ほか4名
  • Organizer: 日本植物分類学会第8回大会
  • Place of Presentation: 東京エレクトロンホール宮城(宮城県民会館)
  • Year and Date: 2009-03-14
• [Presentation] カワラヨモギ集団における河川の氾濫による遺伝的多様性の維持機構
  • Author(s): 西野貴子, 山崎奈津子, 銭谷美乃里
  • Organizer: 日本植物分類学会 第9回大会
  • Place of Presentation: 愛知教育大学