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共生開始シグナル・イソフラボンを感知するダイズ根粒菌NodDの活性化機構

Research Project

Project/Area Number 20658019
Research Category

Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research

Allocation TypeSingle-year Grants
Research Field Applied microbiology
Research InstitutionKobe University

Principal Investigator

吉田 健一  Kobe University, 農学研究科, 教授 (20230732)

Project Period (FY) 2008 – 2009
Project Status Completed (Fiscal Year 2009)
Budget Amount *help
¥3,200,000 (Direct Cost: ¥3,200,000)
Fiscal Year 2009: ¥1,500,000 (Direct Cost: ¥1,500,000)
Fiscal Year 2008: ¥1,700,000 (Direct Cost: ¥1,700,000)
Keywordsダイズ根粒菌 / イソフラボン / 共生窒素固定
Research Abstract

野生ダイズ根粒菌Sinorhizobium fredii USDA191 NodD1の大腸菌内発現系によって調製したタンパク抽出物を用いてin vitro再構成する技術改善に取り組み、GroELSシャペロンニン・システムを起動させて活性化したNodDのDNA結合を首尾よく検出することに成功した。但し、未だ再現性やデータの明確さに欠けるため論文発表や学会発表にまで至ることができなかった。この点は正に挑戦萌芽研究の宿命である。
NodD1の細胞内局在の観察についても、免疫電子顕微鏡による検討を続けているが未だ芳しい結果は得られていない。一方そ代案として、ウェスタンブロッティング法によりNodD1のタンパク質レベル変動を検討した結果、ダイゼイン存在下でのみ可溶性の細胞膜画分に含まれるNodD1が顕著に増加することが示唆された。しかし、ダイゼイン添加によるnodD1の転写量の変化はなかった。これらの結果から、ダイゼイン添加によって細胞膜に含まれるNodD1の増加には、mRNAの翻訳効率の上昇、あるいはNodD1の安定化が関与すると推測された。そこでNodD1活性化の途中でタンパク質の新規合成を停止しNodD1の安定性を比較したところ、ダイズイン存在下ではNodD1の分解抑制が観察された。これらの結果からNodD1活性化の過程でダイゼインが細胞膜に含まれるNodD1を安定化させその存在量を増加させることが示唆され、本年度はこの点さらに明確にすることができた。また、NodD1の多量体化をクロスリンクで検討した。NodD1が活性化した状態で結合する染色上の位置を定め、それによってNodD1の傘下にある遺伝子群を明らかにすべく、ゲルシフト・アッセイを応用したSELEX解析に挑戦した。この際は、USDA191のみならず栽培ダイズ根粒菌を代表するBradyrhizobium japonicum USDA110株についても同様の手法を適応すべく研究を進めてが、実験方法自体の設定が調わず結果を得るには至らなかった。

Report

(2 results)
  • 2009 Annual Research Report
  • 2008 Annual Research Report
  • Research Products

    (4 results)

All 2010 2008

All Presentation (4 results)

  • [Presentation] Daizdein transforms Sinorhizobium fredii USDA191 NodD1 into its activated mode : How a symbiont senses its host.2010

    • Author(s)
      吉田健一
    • Organizer
      Intergenomics研究会
    • Place of Presentation
      神戸大学(兵庫県)
    • Year and Date
      2010-03-10
    • Related Report
      2009 Annual Research Report
  • [Presentation] ダイズ根粒菌Sinorhizobium fredii USDA191 NodD1は共生開始シグナル物質ダイゼインによって安定化する2008

    • Author(s)
      高田洋平, Hari B Krishnan, 芦田均, 吉田健一
    • Organizer
      第81回日本生化学会大会・第31回日本分子生物学会年会合同大会
    • Place of Presentation
      神戸国際会議場
    • Year and Date
      2008-12-09
    • Related Report
      2008 Annual Research Report
  • [Presentation] Daizdein transforms Sinorhizobium fredii USDA191 NodD1 into itsactivated mode : How a symbiont senses its host2008

    • Author(s)
      Yoshida, K.
    • Organizer
      国際シンポジウム“Bacteria made Organelles made Eukaryotic Cells"
    • Place of Presentation
      東京大学 駒場キャンパス
    • Year and Date
      2008-11-29
    • Related Report
      2008 Annual Research Report
  • [Presentation] Daidzein transforms Sinorhizobium fredii USDA191 NodD1 into itsactivated mode with enhanced solubility and stability2008

    • Author(s)
      Yoshida, K., et al.
    • Organizer
      8th European Nitrogen Fixation Conference
    • Place of Presentation
      ゲント大学(ベルギー王国)
    • Year and Date
      2008-08-31
    • Related Report
      2008 Annual Research Report

URL: 

Published: 2008-04-01   Modified: 2016-04-21  

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