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RNA新大陸で発見されたRNAiサーモメーターによる熱・生命システム制御系の開発

Research Project

Project/Area Number 20658079
Research Category

Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research

Allocation TypeSingle-year Grants
Research Field Applied molecular and cellular biology
Research InstitutionIwate University

Principal Investigator

斎藤 靖史  Iwate University, 農学部, 准教授 (70287100)

Project Period (FY) 2008 – 2009
Project Status Completed (Fiscal Year 2009)
Budget Amount *help
¥3,300,000 (Direct Cost: ¥3,300,000)
Fiscal Year 2009: ¥900,000 (Direct Cost: ¥900,000)
Fiscal Year 2008: ¥2,400,000 (Direct Cost: ¥2,400,000)
KeywordsノンコーディングRNA / RNAi / ta-siRNA / 温度センサー / ダイサー / DCL / ロバスト性 / siRNA / 植物 / ストレス / 発現制御 / 温度
Research Abstract

一定の環境条件下で栽培されるモデル植物とは異なり、野外で生育する植物は環境温度変動に曝されながらも生命活動を営んでいる。よって植物は環境温度変動に対応できる遺伝子発現制御系を持っていると考えられる。我々は、植物ゲノムにコードされる内在性siRNAの1種であるTAS1 tasiRNA量が低温により減少し、これとともにTAS1 tasiRNAターゲットmRNAの発現が上昇することを見いだした。tasiRNA産生に関わるDicer-like enzyme4の変異体(dcl4-2)におけるTAS1 tasiRNAターゲットmRNAの低温における発現を調べた結果、野生型植物とは異なり、低温処理によっても発現上昇しない遺伝子が存在した。このターゲットmRNAのTAS1 tasiRNAによる切断は低温によって減少していたことから、この遺伝子はTAS1 tasiRNAを介して低温における発現誘導がおこなわれているものと考えられた。一方、dcl4-2変異体においても野生型植物と同様に低温処理によって発現上昇するTAS1 tasiRNAターゲット遺伝子が見つかり、この遺伝子はTAS1 tasiRNAサイレンシング以外の何らかの機構によって低温で発現誘導されているものと考えられた。そこで次に、植物体を24時間低温処理後、室温に戻しさらに24時間培養後、このターゲットmRNAの発現変動について野生型植物とdcl4-2変異体とで比較した。その結果、野生型植物では常温に戻して24時間後、ターゲットmRNA量が低温処理前のレベルまで減少したが、dcl4-2変異体ではmRNAレベルの減少は僅かであった。これらの結果から、TAS1 tasiRNAは、低温を関知して遺伝子発現を誘導するだけではなく、環境温度変動条件下において、低温で発現誘導されたmRNAの常温における速やかな分解に関する機能を有している可能性が考えられた。

Report

(2 results)
  • 2009 Annual Research Report
  • 2008 Annual Research Report
  • Research Products

    (6 results)

All 2010 2009 2008

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results) Presentation (5 results)

  • [Journal Article] TAS1 trans-acting siRNA targets are differentially regulated at low temperature : TAS1 trans-acting siRNA mediates temperature-controlled Atlg51670 expression2010

    • Author(s)
      Kume, K., Tsutsumi, K., Saitoh, Y.
    • Journal Title

      Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry (印刷中)

    • Related Report
      2009 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 環境温度変動に対するtasiRNAの機能解析2010

    • Author(s)
      久米浩平, 堤賢一, 斎藤靖史
    • Organizer
      日本育種学会第117回講演会
    • Place of Presentation
      京都、京都大学
    • Year and Date
      2010-03-27
    • Related Report
      2009 Annual Research Report
  • [Presentation] ta-siRNAターゲット遺伝子の低温における発現誘導機構の解析2009

    • Author(s)
      久米浩平, 堤賢一, 斎藤靖史
    • Organizer
      第82回日本生化学会大会
    • Place of Presentation
      神戸、神戸国際会議場
    • Year and Date
      2009-10-23
    • Related Report
      2009 Annual Research Report
  • [Presentation] trans-acting siRNAによるノックダウン効果の低温感受性2008

    • Author(s)
      久米浩平、関菜月、堤賢一、斎藤靖史
    • Organizer
      第31回日本分子生物学会・第81回日本生化学会大会合同大会BMB2008
    • Place of Presentation
      国際会議場・神戸
    • Year and Date
      2008-12-09
    • Related Report
      2008 Annual Research Report
  • [Presentation] Low temperature induced gene exprestion mediated by non-coding RNA2008

    • Author(s)
      Kunie, K., Seki N., Tsutsumi, K., and Saitoh, Y.
    • Organizer
      2008 IU-UGAS/IU-gsa/IU-COE Joint Symposium(寒冷圏農学国際シンポジウム)-The Effect of Climate Change on Biological Systems in cold Regions-
    • Place of Presentation
      アイーナホール・盛岡
    • Year and Date
      2008-10-27
    • Related Report
      2008 Annual Research Report
  • [Presentation] 低温条件下におけるRNAiノックダウン効果の検証2008

    • Author(s)
      久米浩平、小松晃、若狭暁、堤賢一、斎藤靖史
    • Organizer
      日本生化学会東北支部会74回例会・シンポジウム
    • Place of Presentation
      アイーナホール・盛岡
    • Year and Date
      2008-05-17
    • Related Report
      2008 Annual Research Report

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Published: 2008-04-01   Modified: 2016-04-21  

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