Mechanism of Radiation damage of protein structure studied by X-ray diffraction and UV-Visible spectroscopy.

• Project/Area Number: 20710050
• Research Category: Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
• Allocation Type: Single-year Grants
• Research Field: Risk sciences of radiation/Chemicals
• Research Institution: Japan Synchrotron Radiation Research Institute
• Principal Investigator: SHIMIZU Nobutaka Japan Synchrotron Radiation Research Institute, 利用研究促進部門, 研究員 (20450934)
• Project Period (FY): 2008 – 2009
• Project Status: Completed (Fiscal Year 2009)
• Budget Amount: ¥4,420,000 (Direct Cost: ¥3,400,000、Indirect Cost: ¥1,020,000); Fiscal Year 2009: ¥1,040,000 (Direct Cost: ¥800,000、Indirect Cost: ¥240,000); Fiscal Year 2008: ¥3,380,000 (Direct Cost: ¥2,600,000、Indirect Cost: ¥780,000)
• Keywords: 損傷 / X線結晶解析 / 放射線損傷 / タンパク質 / タンパク質結晶 / 紫外可視分光法 / 放射光 / SPring-8 / 顕微分光装置

Research Abstract

タンパク質X線結晶構造解析において深刻な問題となるX線によるタンパク質の放射線損傷現象を解析する為に、結晶試料を測定可能な紫外可視分光光度計を開発し、その制御系の改変によって測定の高速化を実現した。この分光光度計を利用してX線損傷による紫外波長領域での吸収スペクトル変化を世界で初めて観測し、タンパク質分子の損傷による変化を同定した。さらに、放射線損傷の効果が結晶を100Kの低温で測定する為に必要な抗凍結溶剤の種類によって異なることを明らかにした。

Research Products

• [Journal Article] SPring-8構造生物ビームライン (2010)
  • Author(s): 熊坂崇、清水伸隆、馬場清喜、長谷川和也、上野剛、山本雅貴
  • Journal Title: 薬学雑誌 130(5) Pages: 649-655
  • NAID: 130000259450
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] 蛋白質微小結晶構造解析:その極限で目指すもの (2009)
  • Author(s): 平田邦生、清水伸隆、上野剛、熊坂崇、山本雅貴
  • Journal Title: 蛋白質・核酸・酵素 54(12) Pages: 1477-1483
• [Presentation] SPring-8構造生物学IビームラインBL41XUの現状 (2010)
  • Author(s): 清水伸隆、河野能顕、牧野正知、長谷川和也、村上博則、上野剛、馬場清喜、伊藤廉、二澤宏司、山本雅貴、熊坂崇
  • Organizer: 第23回日本放射光学会年会
  • Place of Presentation: 兵庫県(ポスター)
  • Year and Date: 2010-01-08
• [Presentation] SPring-8構造生物学IIIビームラインBL38B1の現状 (2010)
  • Author(s): 馬場清喜、水野伸宏、星野武司、牧野正知、長谷川和也、清水伸隆、上野剛、引間孝明、村上博則、山本雅貴、熊坂崇
  • Organizer: 第23回日本放射光学会年会
  • Place of Presentation: 兵庫県(ポスター)
  • Year and Date: 2010-01-08
• [Presentation] 紫外可視分光法によるタンパク質結晶の放射線損傷の評価 (2009)
  • Author(s): 清水伸隆、清水哲哉、馬場清喜、長谷川和也、山本雅貴、熊坂崇
  • Organizer: 日本結晶学会2009年年会
  • Place of Presentation: 兵庫県(ポスター)
  • Year and Date: 2009-12-05
• [Presentation] 紫外可視分光法によるタンパク質結晶の放射線損傷の評価 (2009)
  • Author(s): 清水伸隆
  • Organizer: 本結晶学会
  • Place of Presentation: 関西学院大学西宮上ケ原キャンパス(兵庫県)
  • Year and Date: 2009-12-05
• [Presentation] SPring-8構造生物学IビームラインBL41XUの現状 (2009)
  • Author(s): 清水伸隆、河野能顕、河本正秀、長谷川和也、上野剛、平田邦生、大端通、古川行人、工藤統吾、馬場清喜、清水哲哉、二澤宏司、山本雅貴、熊坂崇
  • Organizer: 第22回日本放射光学会年会
  • Place of Presentation: 東京都(ポスター)
  • Year and Date: 2009-01-11
• [Presentation] SPring-8構造生物学IIIビームラインBL38B1の現状 (2009)
  • Author(s): 馬場清喜、牧野正知、長谷川和也、清水伸隆、上野剛、村上博則、山本雅貴、熊坂崇
  • Organizer: 第22回日本放射光学会年会
  • Place of Presentation: 東京都(ポスター)
  • Year and Date: 2009-01-11
• [Presentation] タンパク質結晶の放射線損傷とその定量的評価に基づく測定法 (2008)
  • Author(s): 清水伸隆
  • Organizer: 第46回日本生物物理学会年会
  • Place of Presentation: 福岡県(シンポジウム、口頭)
  • Year and Date: 2008-12-03
• [Presentation] タンパク質結晶の放射線損傷とその定量的評価に基づく測定法 (2008)
  • Author(s): 清水伸隆
  • Organizer: 日本生物物理学会
  • Place of Presentation: 福岡国際会議場
  • Year and Date: 2008-12-03
• [Remarks] SPring-8 JASRI構造生物グループビームラインのページ
  • URL: http://bioxtal.spring8.or.jp