Identification and characterization of G-quadruplex DNA binding protein

• Project/Area Number: 20750130
• Research Category: Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
• Allocation Type: Single-year Grants
• Research Field: Chemistry related to living body
• Research Institution: Shizuoka University
• Principal Investigator: OYOSHI Takanori Shizuoka University, 理学部, 助教 (80406529)
• Project Period (FY): 2008 – 2009
• Project Status: Completed (Fiscal Year 2009)
• Budget Amount: ¥4,420,000 (Direct Cost: ¥3,400,000、Indirect Cost: ¥1,020,000); Fiscal Year 2009: ¥1,690,000 (Direct Cost: ¥1,300,000、Indirect Cost: ¥390,000); Fiscal Year 2008: ¥2,730,000 (Direct Cost: ¥2,100,000、Indirect Cost: ¥630,000)
• Keywords: 核酸化学 / 核酸結合タンパク質 / グアニン四重鎖構造 / 生物化学 / 核酸結合タンパク / グアニン四重鎖 / タンパク質化学

Research Abstract

We report that Arg-Gly-Gly domain (RGG) in EWS binds G-rich single strand DNA fold in G-quadruplex DNA while it cannot bind G-rich double and single stranded DNA. Inhibition of DNA polymerase on a template containing G-quadruplex in the presence of RGG occurred in an RGG concentration-manner by forming a stabilized G-quadruplex-RGG complex. Moreover,」 specific binding of RGG to G-quadruplex DNA is dictated by hydrogen bonding of arginine in RGG.

Research Products

• [Journal Article] Identification of DNA Binding Specificity of TLS. (2009)
  • Author(s): Takahama, K., Kino, K., Arai, S., Kurokawa, R., Oyoshi, T.
  • Journal Title: Nucleic Acids Symp. 53 Pages: 247-248
• [Journal Article] Identification of DNA Binding Specificity of TLS. (2009)
  • Author(s): 高濱謙太郎、荒井重紀、黒川理樹、大吉崇文
  • Journal Title: Nucleic Acids Symp. VOL.53 Pages: 247-248
• [Journal Article] Identification of RNA Binding Specificity for the TET-family Proteins. (2008)
  • Author(s): Takahama, K., Arai, S., Kurokawa, R., Oyoshi, T.
  • Journal Title: Nucleic Acids Symp. 52 Pages: 213-214
• [Journal Article] Identification of RNA Binding Specificity for the TET-family Proteins (2008)
  • Author(s): 高濱謙太朗
  • Journal Title: Nucleic Acids Symp. Ser 52 Pages: 213-214
• [Presentation] 核酸結合タンパク質EWSのグアニン四重鎖構造認識機構の解明 (2010)
  • Author(s): 高濱謙太郎, 荒井重紀, 黒川理樹, 大吉崇文
  • Organizer: 日本化学会第90春季年会
  • Place of Presentation: 近畿大学(大阪府)
  • Year and Date: 2010-03-26
• [Presentation] 細胞内における核酸結合タンパク質EWSの機能解析 (2010)
  • Author(s): 渡辺裕美、高濱謙太郎、茶山和敏、大吉崇文
  • Organizer: 日本化学会第90春季年会
  • Place of Presentation: 近畿大学(大阪府)
  • Year and Date: 2010-03-26
• [Presentation] 核酸結合タンパク質TLSによる翻訳制御機構の解明 (2010)
  • Author(s): 内山裕美子、高田麻美、高濱謙太郎、大吉崇文
  • Organizer: 日本化学会第90春季年会
  • Place of Presentation: 近畿大学(大阪府)
  • Year and Date: 2010-03-26
• [Presentation] RGG夕ンパク質が結合したグアニン四重鎖構造の解析 (2010)
  • Author(s): 杉本知恵莉、高濱謙太郎、大吉崇文
  • Organizer: 日本化学会第90春季年会
  • Place of Presentation: 近畿大学(大阪府)
  • Year and Date: 2010-03-26
• [Presentation] 核酸結合タンパク質TLSの核酸結合性の解析 (2010)
  • Author(s): 高田麻美、高濱謙太郎、大吉崇文
  • Organizer: 日本化学会第90春季年会
  • Place of Presentation: 近畿大学(大阪府)
  • Year and Date: 2010-03-26
• [Presentation] グアニン四重鎖に結合するペプチドの開発 (2010)
  • Author(s): 田出朋也、高濱謙太郎、杉本知恵莉、道羅英夫、大吉崇文
  • Organizer: 日本化学会第90春季年会
  • Place of Presentation: 近畿大学(大阪府)
  • Year and Date: 2010-03-26
• [Presentation] RNAオリゴマーによる細胞内の転写活性化機構 (2010)
  • Author(s): 齋藤悠、高濱謙太郎、丑丸敬史、大吉崇文
  • Organizer: 日本化学会第90春季年会
  • Place of Presentation: 近畿大学(大阪府)
  • Year and Date: 2010-03-26
• [Presentation] 核酸結合タンパク質EWSのグアニン四重鎖構造認識機構の解明 (2010)
  • Author(s): 高濱謙太郎, 荒井重紀, 黒川理樹, 大吉崇文
  • Organizer: 日本化学会第90春季年会
  • Place of Presentation: 大阪
• [Presentation] 細胞内における核酸結合タンパク質EWSの機能解析 (2010)
  • Author(s): 渡辺裕美, 高濱謙太郎, 茶山和敏, 大吉崇文
  • Organizer: 日本化学会第90春季年会
  • Place of Presentation: 大阪
• [Presentation] RGGタンパク質が結合したグアニン四重鎖構造の解析 (2010)
  • Author(s): 杉本知恵莉, 高濱謙太郎, 大吉崇文
  • Organizer: 日本化学会第90春季年会
  • Place of Presentation: 大阪
• [Presentation] 核酸結合タンパク質TLSの核酸結合性の解析 (2010)
  • Author(s): 高田麻美, 高濱謙太郎, 大吉崇文
  • Organizer: 日本化学会第90春季年会
  • Place of Presentation: 大阪
• [Presentation] グアニン四重鎖に結合するペプチドの開発 (2010)
  • Author(s): 田出朋也, 高濱謙太郎, 杉本知恵莉, 道羅英夫, 大吉崇文
  • Organizer: 日本化学会第90春季年会
  • Place of Presentation: 大阪
• [Presentation] RNAオリゴマーによる細胞内の転写活性化機構 (2010)
  • Author(s): 齋藤悠, 高濱謙太郎, 丑丸敬史, 大吉崇文
  • Organizer: 日本化学会第90春季年会
  • Place of Presentation: 大阪
• [Presentation] Identification of DNA Binding Specificity of TLS. (2009)
  • Author(s): 高濱謙太郎、荒井重紀、黒川理樹、大吉崇文
  • Organizer: 第6回国際核酸化学シンポジウム
  • Place of Presentation: 高山市民文化会館(岐阜県)
  • Year and Date: 2009-09-27
• [Presentation] EWSタンパク質の核酸結合性の解析 (2009)
  • Author(s): 大吉崇文、高濱謙太郎、喜納克仁、荒井重紀、黒川理樹
  • Organizer: 第24回生体機能関連化学シンポジウム
  • Place of Presentation: 九州大学(福岡県)
  • Year and Date: 2009-09-13
• [Presentation] 核酸結合タンパク質EWSのDNA結合性の解析 (2009)
  • Author(s): 大吉崇文
  • Organizer: 日本化学会第89春季年会
  • Place of Presentation: 日本大学理工学部船橋キャンパス
  • Year and Date: 2009-03-27
• [Presentation] RNA結合タンパク質EWSによる翻訳制御機構の解明 (2009)
  • Author(s): 大吉崇文
  • Organizer: 日本化学会第89春季年会
  • Place of Presentation: 日本大学理工学部船橋キャンパス
  • Year and Date: 2009-03-27
• [Presentation] Identification of DNA Binding Specificity of TLS. (2009)
  • Author(s): 高濱謙太郎, 荒井重紀, 黒川理樹, 大吉崇文
  • Organizer: 第6回国際核酸化学シンポジウム
  • Place of Presentation: 高山
• [Presentation] EWSタンパク質の核酸結合性の解析 (2009)
  • Author(s): 大吉崇文, 高濱謙太郎, 喜納克仁, 荒井重紀, 黒川理樹
  • Organizer: 第24回生体機能関連化学シンポジウム
  • Place of Presentation: 福岡
• [Presentation] TETタンパク質によるDNA結合認識機構の解明 (2009)
  • Author(s): 高濱謙太郎, 喜納克仁, 荒井重紀, 黒川理樹, 大吉崇文
  • Organizer: 日本化学会第89回春季年会
  • Place of Presentation: 船橋
• [Presentation] RNA結合タンパク質EWSによる翻訳制御機構の解明 (2009)
  • Author(s): 内山裕美子, 高濱謙太郎, 黒川理樹, 大吉崇文
  • Organizer: 日本化学会第89回春季年会
  • Place of Presentation: 船橋
• [Presentation] 核酸結合タンパク質EWSのDNA結合性の解析 (2008)
  • Author(s): 大吉崇文
  • Organizer: 第3回バイオ関連化学合同シンポジウム
  • Place of Presentation: 東京工業大学すずかけ台キャンパス
  • Year and Date: 2008-09-18
• [Presentation] Identification of RNA Binding Specificity for the TET-family Proteins (2008)
  • Author(s): 大吉崇文
  • Organizer: 35th International Symposium on Nucleic Acids Chemistry
  • Place of Presentation: 京都大学
  • Year and Date: 2008-09-08
• [Presentation] Identification of RNA Binding Specificity for the TET-family Proteins. (2008)
  • Author(s): 高濱謙太郎, 喜納克仁, 荒井重紀, 黒川理樹, 大吉崇文
  • Organizer: 第35回核酸化学国際シンポジウム合同シンポジウム
  • Place of Presentation: 京都
• [Presentation] 核酸結合タンパク質EWSのDNA結合性の解析 (2008)
  • Author(s): 高濱謙太郎, 喜納克仁, 荒井重紀, 黒川理樹, 大吉崇文
  • Organizer: 第3回バイオ関連化学合同シンポジウム
  • Place of Presentation: 横浜
• [Presentation]
  • Author(s): 内山裕美子, 高田麻美, 高濱謙太郎, 大吉崇文