| Project/Area Number |
20810020
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Young Scientists (Start-up)
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| Allocation Type | Single-year Grants |
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| Research Field |
Risk sciences of radiation/Chemicals
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| Research Institution | Nagasaki University |
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Principal Investigator |
霜川 修 長崎大, 医歯(薬)学総合研究科, 研究員 (50513321)
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| Project Period (FY) |
2008 – 2009
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| Project Status |
Completed (Fiscal Year 2009)
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| Budget Amount *help |
¥3,302,000 (Direct Cost: ¥2,540,000、Indirect Cost: ¥762,000)
Fiscal Year 2009: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000)
Fiscal Year 2008: ¥1,742,000 (Direct Cost: ¥1,340,000、Indirect Cost: ¥402,000)
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| Keywords | ゲノム不安定性 / 放射線 / 変異 / 定量化 |
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| Research Abstract |
本研究は,正常線維芽細胞のγ-線照射を行った後に細胞をクローニングして,個々の細胞のゲノム変化を定量化することを目的とした。正常男性ヒト線維芽細胞に4グレイのγ-線照射を行い限外希釈して再培養して,細胞クローン10個を得た。また,対照としてγ-線照射を行わないでクローニングした細胞クローン10個を得た。ゲノムコピー数の解析を行うためにaffymetrix社製のGeneChipシステムを用いて,γ-線非照射細胞クローンとγ-線照射細胞クローンを解析してゲノムの大きな構造変化数を比較した。結果,γ-線非照射細胞とγ-線照射細胞クローンの両方にコピー数変化をともなった大きな部位(>1Mb)を検出できたが,γ-線非照射細胞において明らかにコピー数変化部位数が増加している傾向は認められなかった。理由としては,実験に用いたクロンーン化細胞数が少ないことが挙げられるが,明瞭な差異を検出できないのであれば解析細胞数を増やすことは,研究費用内では無理であったので,次の実施計画に移った。
DNAの塩基変異を検出して定量化することを試みた。方法は,正常男性ヒト線維芽細胞に4グレイのγ-線照射を行いそのまま10万個の細胞を1日培養して,DNAを抽出してPCR後にプラスミドヘクローニング後シークエンス解析を行い変異部位の数を数えてγ-線非照射群と比較するのである。現在,xxx遺伝子,yyy遺伝子,zzz遺伝子をhigh-fiedility Taq polymeraseで増幅しクローニング後のシーケンス解析を行っている。一遺伝子当たり,500bp/clone x800clone=400,000,のべ400kbを解析している最中である。
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Report
(1 results)
Research Products
(7 results)
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[Journal Article] Microarray comparative genomic hybridization analysis of 59 patients with schizophrenia.2008
Author(s)
Mizuguchi T, Hashimoto R, ltokawa M, Sano A, Shimokawa O. Yoshimura Y, Harada N, Miyake N, Nishimura A, Saitsu H, Sosonkina N, Niikawa N, Kunugi H, Matsumoto N.
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Journal Title
Journal of Human Genetics 53
Pages: 914-919
NAID
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[Journal Article] A girl with Down syndrome and partial trisomy for 21 pter-q22.13 : a clue to narrow the Down syndrome critical region.2008
Author(s)
Sato D, Kawara H, Shimokawa O, Harada N, Tonoki H, Takahashi N, lmai Y, Kimura H, Matsumoto N, Ariga T, Niikawa N, Yoshiura K.
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Journal Title
American Journal of Medical Genetics 146A
Pages: 124-127
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