Identification of de novo DNA methylation signal by comparative genomics
| Project/Area Number |
20870008
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Young Scientists (Start-up)
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| Allocation Type | Single-year Grants |
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| Research Field |
Genetics/Genome dynamics
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| Research Institution | The University of Tokyo |
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Principal Investigator |
OKAMURA Kohji The University of Tokyo, 生命情報学教育研究センター, 特任講師 (80456194)
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| Project Period (FY) |
2008 – 2009
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| Project Status |
Completed (Fiscal Year 2009)
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| Budget Amount *help |
¥3,302,000 (Direct Cost: ¥2,540,000、Indirect Cost: ¥762,000)
Fiscal Year 2009: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000)
Fiscal Year 2008: ¥1,742,000 (Direct Cost: ¥1,340,000、Indirect Cost: ¥402,000)
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| Keywords | ゲノムインプリンティング / DNAメチル化 / CpGアイランド / 齧歯目 / 重歯目 / 脊椎動物 / 新口動物 / エピジェネティクス / 進化 / 遺伝子 / 遺伝学 / 核酸 / ゲノム / インプリンティング / メチル化 / アレル |
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| Research Abstract |
ネズミ目およびウサギ目特異的インプリンティングを受ける遺伝子Impactに着目し、卵形成で新規メチル化を受けるDNA配列を、ビーバー、リスなど約30種の動物で決定し、メチル化シグナル同定を目指してインプリンティングを受けない哺乳類ゲノムと比較解析を行った。その結果、これまで重要と考えられてきたリピート配列や、CpGおよびG+C含量ではなく、CpGサイト間の間隔がアレル別メチル化の確立に関わっていることが示唆された。
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Report
(3 results)
Research Products
(20 results)
