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Photoreaction mechanisms in photoreceptor proteins

Research Project

Project/Area Number 20870010
Research Category

Grant-in-Aid for Young Scientists (Start-up)

Allocation TypeSingle-year Grants
Research Field Biophysics
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

ISHIKITA Hiroshi  京大, 医学(系)研究科(研究院), 助教 (00508111)

Project Period (FY) 2007 – 2008
Project Status Completed (Fiscal Year 2009)
Budget Amount *help
¥3,276,000 (Direct Cost: ¥2,520,000、Indirect Cost: ¥756,000)
Fiscal Year 2009: ¥1,547,000 (Direct Cost: ¥1,190,000、Indirect Cost: ¥357,000)
Fiscal Year 2008: ¥1,729,000 (Direct Cost: ¥1,330,000、Indirect Cost: ¥399,000)
Keywords生物物理 / 蛋白質 / 酵素反応 / 生体生命情報学 / コンピューターシミュレーション / 計算化学
Research Abstract

光受容体蛋白質BLUF (blue light sensing using FAD, FAD : flavin adenine dinucleotide)の光反応機構を理論計算的手法で解析した。BLUFの蛋白質立体構造データに基づき、静電ポテンシャル計算によってBLUF活性部位であるflavin, Tyr-21及びTrp-104の酸化還元電位を計算し、BLUFの電子移動反応の駆動力を求めた。その結果、活性時の蛋白質コンフォメーションを反映している立体構造を同定できた。

Report

(2 results)
  • 2008 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • Research Products

    (6 results)

All 2009 2008 Other

All Journal Article (4 results) (of which Peer Reviewed: 2 results) Presentation (1 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] 光合成反応中心蛋白質における電子移動・プロトン移動と蛋白質の分子制御2009

    • Author(s)
      石北 央
    • Journal Title

      分子シミュレーション研究会会誌 11

      Pages: 7-12

    • NAID

      130004566625

    • Related Report
      2008 Final Research Report
  • [Journal Article] 光合成反応中心蛋白質における電子移動・プロトン移動と蛋白質の分子制御2009

    • Author(s)
      石北央
    • Journal Title

      アンサンブル (分子シミュレーション研究会会誌) 11

      Pages: 7-12

    • NAID

      130004566625

    • Related Report
      2008 Annual Research Report
  • [Journal Article] Light-induced hydrogen bonding pattern and driving force of electron transfer in AppA BLUF domain photoreceptor2008

    • Author(s)
      H. Ishikita
    • Journal Title

      J.Biol.Chem 283

      Pages: 30618-30623

    • Related Report
      2008 Final Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Light-induced hydrogen bonding pattern and driving force of electron transfer in AppA BLUF domain photoreceptor2008

    • Author(s)
      Hiroshi Ishikita
    • Journal Title

      J. Biol. Chem. 283

      Pages: 30618-30623

    • Related Report
      2008 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 静電ポテンシャル計算による光合成反応中心蛋白質の電子移動現象の解明2008

    • Author(s)
      石北 央
    • Organizer
      日本生物物理学会第46回年会
    • Place of Presentation
      福岡
    • Related Report
      2008 Annual Research Report 2008 Final Research Report
  • [Remarks]

    • URL

      http://userpage.chemie.fu-berlin.de/~hiro/en.htm

    • Related Report
      2008 Final Research Report

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Published: 2008-04-01   Modified: 2017-05-19  

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