Photoreaction mechanisms in photoreceptor proteins

• Project/Area Number: 20870010
• Research Category: Grant-in-Aid for Young Scientists (Start-up)
• Allocation Type: Single-year Grants
• Research Field: Biophysics
• Research Institution: Kyoto University
• Principal Investigator: ISHIKITA Hiroshi 京大, 医学(系)研究科(研究院), 助教 (00508111)
• Project Period (FY): 2007 – 2008
• Project Status: Completed (Fiscal Year 2009)
• Budget Amount: ¥3,276,000 (Direct Cost: ¥2,520,000、Indirect Cost: ¥756,000); Fiscal Year 2009: ¥1,547,000 (Direct Cost: ¥1,190,000、Indirect Cost: ¥357,000); Fiscal Year 2008: ¥1,729,000 (Direct Cost: ¥1,330,000、Indirect Cost: ¥399,000)
• Keywords: 生物物理 / 蛋白質 / 酵素反応 / 生体生命情報学 / コンピューターシミュレーション / 計算化学

Research Abstract

光受容体蛋白質BLUF (blue light sensing using FAD, FAD : flavin adenine dinucleotide)の光反応機構を理論計算的手法で解析した。BLUFの蛋白質立体構造データに基づき、静電ポテンシャル計算によってBLUF活性部位であるflavin, Tyr-21及びTrp-104の酸化還元電位を計算し、BLUFの電子移動反応の駆動力を求めた。その結果、活性時の蛋白質コンフォメーションを反映している立体構造を同定できた。

Research Products

• [Journal Article] 光合成反応中心蛋白質における電子移動・プロトン移動と蛋白質の分子制御 (2009)
  • Author(s): 石北 央
  • Journal Title: 分子シミュレーション研究会会誌 11 Pages: 7-12
  • NAID: 130004566625
• [Journal Article] 光合成反応中心蛋白質における電子移動・プロトン移動と蛋白質の分子制御 (2009)
  • Author(s): 石北央
  • Journal Title: アンサンブル (分子シミュレーション研究会会誌) 11 Pages: 7-12
  • NAID: 130004566625
• [Journal Article] Light-induced hydrogen bonding pattern and driving force of electron transfer in AppA BLUF domain photoreceptor (2008)
  • Author(s): H. Ishikita
  • Journal Title: J.Biol.Chem 283 Pages: 30618-30623
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Light-induced hydrogen bonding pattern and driving force of electron transfer in AppA BLUF domain photoreceptor (2008)
  • Author(s): Hiroshi Ishikita
  • Journal Title: J. Biol. Chem. 283 Pages: 30618-30623
  • Peer Reviewed
• [Presentation] 静電ポテンシャル計算による光合成反応中心蛋白質の電子移動現象の解明 (2008)
  • Author(s): 石北 央
  • Organizer: 日本生物物理学会第46回年会
  • Place of Presentation: 福岡
• [Remarks]
  • URL: http://userpage.chemie.fu-berlin.de/~hiro/en.htm