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Construction of a Structural and/or Functional Model of New Light-harvesting System Using Artificial Hemoprotein Assembly

Research Project

Project/Area Number 20H00403
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (A)

Allocation TypeSingle-year Grants
Section一般
Review Section Medium-sized Section 37:Biomolecular chemistry and related fields
Research InstitutionOsaka University

Principal Investigator

林 高史  大阪大学, 大学院工学研究科, 教授 (20222226)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 小野田 晃  北海道大学, 地球環境科学研究院, 教授 (60366424)
Project Period (FY) 2020-04-01 – 2024-03-31
Project Status Granted (Fiscal Year 2023)
Budget Amount *help
¥44,980,000 (Direct Cost: ¥34,600,000、Indirect Cost: ¥10,380,000)
Fiscal Year 2023: ¥10,790,000 (Direct Cost: ¥8,300,000、Indirect Cost: ¥2,490,000)
Fiscal Year 2022: ¥11,440,000 (Direct Cost: ¥8,800,000、Indirect Cost: ¥2,640,000)
Fiscal Year 2021: ¥9,490,000 (Direct Cost: ¥7,300,000、Indirect Cost: ¥2,190,000)
Fiscal Year 2020: ¥13,260,000 (Direct Cost: ¥10,200,000、Indirect Cost: ¥3,060,000)
Keywordsヘムタンパク質 / 光捕集系 / エネルギー移動 / 人工光合成 / 亜鉛ポルフィリノイド / 光補修系 / GFP
Outline of Research at the Start

本研究では、以下に示す項目を順次推進する。まず環状ヘムタンパク質6量体HTHPを用いて、ヘムを亜鉛ポルフィリノイドやクロリン類縁体に置換し、光捕集系の構造を模倣した人工アンテナ集積体を構築する。次に、様々な立体構造の集積体を構築し色素間のエネルギーマイグレーションの観測を実施し、光捕集能力を評価する。さらに、HTHPの中心空孔に金属錯体(触媒)を導入し、効率的に捕集した光エネルギーを利用して、金属錯体を介した物質変換(ヒドロゲナーゼモデルとしての水素発生や水の酸化等)を試み、光駆動型触媒反応への応用に挑戦する。つづいて、HTHPの集積体を金基板上に固定化し、デバイスとしての利用の準備を進める。

Outline of Annual Research Achievements

近年、植物の光合成に関する作用機序が次々と明らかとなり、光合成の活性中心を模倣・応用する研究も盛んに実施されている。そのモデル研究の多くは低分子の色素を合成化学的・超分子化学的に集積させるアプローチである。本研究では、光合成初期過程の光捕集アンテナ組織に学び、これまで我々が精力的に実施しているヘムタンパク質人工集積化手法を駆使して、多数の色素をタンパク質マトリクス内に環状に配置した人工光捕集系の構築を実施している。当該年度は令和3年度に引き続き、green fluorescent protein (GFP)とチトクロムb562の人工的な集合化と、得られた色素タンパク質を用いた光駆動型エネルギー移動について研究を進めた。特にタンパク質間を収率良く安定なジスルフィド結合で集合化させるための手法開拓を確立し、光照射下によってGFPからシトクロムb562のヘムに効率的なエネルギー移動が生じ、GFPの蛍光が消光する系を構築した。またGFPの多量体の調製も達成し、集合体がゲル電気泳動と原子間力顕微鏡により、繊維状の構造体を形成していることを明らかにした。さらに時間分解偏向蛍光解消測定により、光捕集能として重要と考えられている同一色素間でのエネルギー移動が効率的に起こっていることも判明した。このように当該年度は、色素タンパク質の安定な組織化・集合化の手法を確立し、その構造体を用いたタンパク質間の光駆動型エネルギー移動を追跡し、人工的な光捕集系としての評価を行った。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

当該年度は、昨年度に引き続き、安定なタンパク質複合体の構造を得るために、表面にシステイン残基を有する電子伝達ヘムタンパク質であるチトクロムb562変異体と緑色の強い蛍光を発するgreen fluorescent protein (GFP)を幾つか調製した。それぞれのタンパク質の表面の特定のアミノ酸残基をシステインに置換した変異体を調製し、2,2’-ジピリジルジスルフィドをシステイン末端のチオールの活性剤として用いることにより、様々な両タンパク質のジスルフィド結合を介した2量体を得た。次にGFPの色素部位への光照射によるチトクロムb562の補因子ヘムへのエネルギー移動を、蛍光スペクトルおよび蛍光寿命測定によって、詳細に検討し、距離とエネルギー移動効率の関係を考察した。一方、同様な手法でGFPのオリゴマーの合成も試みた。GFPのK25C/S174C二重変異体を用いてジスルフィド結合を介した集合体を調製した結果、ゲル電気泳動測定と、サイズ排除クロマトグラフィーのデータから、最大で平均7量体程度のGFPオリゴマーが得られることが判明し、その繊維状構造体を高速原子間力顕微鏡で直接観測することができた。さらに、得られたオリゴマーについて時間分解偏向蛍光解消測定を実施した結果、GFPの単量体や2量体に対して、GFPオリゴマーは顕著なアニソトロピーの二相減衰曲線が得られ、同一色素間での効率的なhomo-FRET(エネルギー移動)が起こっていることが明らかとなった。

Strategy for Future Research Activity

令和5年度は最終年度であるため、人工的な光捕集系の完成をめざし、次の2項目を中心に研究を展開する。
これまで、1次元(線維状)の色素含有タンパク質の集合化を行い、得られたタンパク質集合体での光励起エネルギー移動の観測を行った。したがって、次に2次元にタンパク質を集合化させるために、ヘムタンパク質6量体として知られているHTHP(hexameric tyrosine-coordinated heme protein) を用い、新しい光捕集系モデルの構築を図る。具体的には基板上にHTHPを集積化させるか、あるいは、HTHPを基点に放射状に色素タンパク質を直線的に伸長させる手法をとる。もう一つの光捕集系としては、以前、本研究代表者らが報告したHTHPの3次元ミセル状(球状)構造体をさらに改良する手法である。いずれも、HTHPに結合しているヘム(鉄ポルフィリン)を亜鉛ポルフィリンに置換することにより、同一色素間(タンパク質集合体内)での効率的なエネルギー移動を分光学的に観測する。さらにHTHPの表面に呈示したシステインのチオール基を反応点として金属錯体を化学修飾し、光エネルギー移動を介した触媒反応の駆動を検討する。たとえばスズポルフィリンなどを共有結合でHTHPのタンパク質表面に存在するチオール基に修飾し、エネルギー移動に基づく水素発生の検出を試みる。以上、色素タンパク質の集合化による新しい光捕集系モデルの提案と実際の光駆動型触媒反応への応用を行う。

Report

(4 results)
  • 2022 Annual Research Report
  • 2021 Annual Research Report
  • 2020 Comments on the Screening Results   Annual Research Report
  • Research Products

    (15 results)

All 2023 2022 2021

All Journal Article (7 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Peer Reviewed: 7 results,  Open Access: 5 results) Presentation (8 results) (of which Int'l Joint Research: 7 results,  Invited: 8 results)

  • [Journal Article] Disulfide Bond-mediated Oligomerization of a Green Fluorescent Protein in Solution2023

    • Author(s)
      Soon Julian Wong、Oohora Koji、Uchihashi Takayuki、Hayashi Takashi
    • Journal Title

      Chemistry Letters

      Volume: 52 Issue: 2 Pages: 105-109

    • DOI

      10.1246/cl.220495

    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] A disulphide bond-mediated hetero-dimer of a hemoprotein and a fluorescent protein exhibiting efficient energy transfer2022

    • Author(s)
      Soon Julian Wong、Oohora Koji、Hayashi Takashi
    • Journal Title

      RSC Advances

      Volume: 12 Issue: 44 Pages: 28519-28524

    • DOI

      10.1039/d2ra05249k

    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] DNA‐Mediated Protein Shuttling between Coacervate‐Based Artificial Cells2022

    • Author(s)
      Mashima Tsuyoshi、Stevendaal Marleen H. M. E.、Cornelissens Femke R. A.、Mason Alexander F.、Rosier Bas J. H. M.、Altenburg Wiggert J.、Oohora Koji、Hirayama Shota、Hayashi Takashi、Hest Jan C. M.、Brunsveld Luc
    • Journal Title

      Angewandte Chemie International Edition

      Volume: 61 Issue: 17

    • DOI

      10.1002/anie.202115041

    • Related Report
      2022 Annual Research Report 2021 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Focusing on a nickel hydrocorphinoid in a protein matrix: methane generation by methyl-coenzyme M reductase with F430 cofactor and its models2022

    • Author(s)
      Miyazaki Yuta、Oohora Koji、Hayashi Takashi
    • Journal Title

      Chemical Society Reviews

      Volume: 51 Issue: 5 Pages: 1629-1639

    • DOI

      10.1039/d1cs00840d

    • Related Report
      2021 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] A Supramolecular Assembly of Hemoproteins Formed in a Star-Shaped Structure via Heme?Heme Pocket Interactions2021

    • Author(s)
      Soon Julian Wong、Oohora Koji、Hirayama Shota、Hayashi Takashi
    • Journal Title

      International Journal of Molecular Sciences

      Volume: 22 Issue: 3 Pages: 1012-1012

    • DOI

      10.3390/ijms22031012

    • Related Report
      2021 Annual Research Report 2020 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Myoglobins engineered with artificial cofactors serve as artificial metalloenzymes and models of natural enzymes2021

    • Author(s)
      Oohora Koji、Hayashi Takashi
    • Journal Title

      Dalton Transactions

      Volume: 50 Issue: 6 Pages: 1940-1949

    • DOI

      10.1039/d0dt03597a

    • Related Report
      2020 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Dynamic Protease Activation on a Multimeric Synthetic Protein Scaffold via Adaptable DNA‐Based Recruitment Domains2021

    • Author(s)
      Mashima Tsuyoshi、Rosier Bas J. H. M.、Oohora Koji、Greef Tom F. A.、Hayashi Takashi、Brunsveld Luc
    • Journal Title

      Angewandte Chemie International Edition

      Volume: 60 Issue: 20 Pages: 11262-11266

    • DOI

      10.1002/anie.202102160

    • Related Report
      2020 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Presentation] Catalysis in Myoglobins Reconstituted with Artificial Metalloporphyrinoids2022

    • Author(s)
      Takashi Hayashi and Koji Oohora
    • Organizer
      12th International Conference on Porphyrins and Phthalocyanines
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Conversion of Myoglobin into Artificial Metalloenzymes2022

    • Author(s)
      Takashi Hayashi, Koji Oohora and Shunsuke Kato
    • Organizer
      8th Asian Conference on Coordination Chemistry
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Artificial Metalloenzymes Formed by Incorporation of Synthetic Metal Cofactors into Apomyoglobin2022

    • Author(s)
      Takashi Hayashi and Koji Oohora
    • Organizer
      44th International Conference on Coordination Chemistry
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Reconstituted Hemoproteins with Ni Corrinoids toward Functional Models of Methane-producing Enzyme2021

    • Author(s)
      Takashi Hayashi
    • Organizer
      International Conference on Porphyrins and Phthalocyanines (ICPP11)
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Engineering of Hemoproteins to Create Artificial Metalloenzymes2021

    • Author(s)
      Takashi Hayashi
    • Organizer
      electronic Biological InorganicChemistry (eBIC)
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Conversion of myoglobin to an artificial metalloenzyme2021

    • Author(s)
      Takashi Hayashi
    • Organizer
      acifichem2021
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] タンパク質をつかって人工的な酵素をつくる2021

    • Author(s)
      林 高史
    • Organizer
      第11回CSJ化学フェスタ
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] Artificial Metalloenzymes Consisting of Conjugates between Apohemoproteins and Metal Complexes2021

    • Author(s)
      Takashi Hayashi
    • Organizer
      European Federation of Biotechnology 2021
    • Related Report
      2020 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research / Invited

URL: 

Published: 2020-04-28   Modified: 2023-12-25  

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