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Plant growth instability originated from disturbance of circadian rhythm and optimization of nonparametric cultivation environment

Research Project

Project/Area Number 20H00423
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (A)

Allocation TypeSingle-year Grants
Section一般
Review Section Medium-sized Section 39:Agricultural and environmental biology and related fields
Research InstitutionOsaka Metropolitan University (2022-2023)
Osaka Prefecture University (2020-2021)

Principal Investigator

Fukuda Hirokazu  大阪公立大学, 大学院工学研究科, 教授 (90405358)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 徳田 功  立命館大学, 理工学部, 教授 (00261389)
永野 惇  龍谷大学, 農学部, 教授 (00619877)
峰野 博史  静岡大学, グリーン科学技術研究所, 教授 (40359740)
高山 弘太郎  豊橋技術科学大学, 工学(系)研究科(研究院), 教授 (40380266)
谷垣 悠介  県立広島大学, 生物資源科学部, 講師 (80757154)
森 直哉  玉川大学, 学術研究所, 助教 (40804050)
Project Period (FY) 2020-04-01 – 2024-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2023)
Budget Amount *help
¥44,200,000 (Direct Cost: ¥34,000,000、Indirect Cost: ¥10,200,000)
Fiscal Year 2023: ¥6,240,000 (Direct Cost: ¥4,800,000、Indirect Cost: ¥1,440,000)
Fiscal Year 2022: ¥9,230,000 (Direct Cost: ¥7,100,000、Indirect Cost: ¥2,130,000)
Fiscal Year 2021: ¥12,740,000 (Direct Cost: ¥9,800,000、Indirect Cost: ¥2,940,000)
Fiscal Year 2020: ¥15,990,000 (Direct Cost: ¥12,300,000、Indirect Cost: ¥3,690,000)
Keywords植物工場 / オミクス / 不安定性 / 栽培環境最適化 / フェノタイピング / オミックス
Outline of Research at the Start

植物生産システムの高度自動化が求められている。しかしながら、生体内にはノイズ増幅の原因となる「不安定性」が存在し、自動制御における安定性の確立が課題となっている。そこで、本研究では、理論的研究(位相動力学)により生育不安定性のメカニズムを解明し、時系列生育データの高度解析手法の構築を目的とする。ここでは、主に日産6000株の大規模植物工場におけるレタス集団を対象に、画像解析技術を用いて大規模な生育データを取得し、結合振動子モデルを用いた定式化と解明を行う。最終的には、時間軸上の最適化法として新規に「ノンパラメトリック栽培環境最適化法」の枠組みを構築する。

Outline of Final Research Achievements

The aim of this study was to elucidate the amplification of noise and instability within plant organisms in the advanced automation of plant production systems and to establish stability in automatic control. This research focused on three main aspects: (A) Development of a new technology to reduce instability through non-parametric cultivation environment optimization, (B) Establishment of mathematical and informatics foundations (mathematical models of multiperiodicity and instability), and (C) Elucidation of physiological mechanisms (clarification of the physiological mechanisms of growth instability). As a result, we achieved: (A) A theory of growth instability due to circadian rhythm disruption based on an improved production flow mathematical model in mass-production artificial light plant factories, (B) Development of a digital model for VR-operated robots, and (C) Development of a coupled model of growth and circadian clocks.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

本研究の学術的意義は、植物生産システムの高度自動化における生体内のノイズ増幅と不安定性のメカニズムを解明し、安定した自動制御システムの確立に寄与する点にある。不安定性の低減技術、数理モデルの構築、生理学的機序の解明により、植物生産の効率と品質が向上する可能性が示された。特に、概日リズムの撹乱による生育不安定性理論やVR操作型ロボットのデジタルモデル開発は、農業分野における新たな学術として重要である。社会的意義としては、これらの成果が実用化されることで、植物工場などの自動化システムだけに留まらず、持続可能な農業生産の推進、食料供給の安定化、そして農業従事者の労働負担の軽減が期待される。

Report

(6 results)
  • 2023 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2022 Annual Research Report
  • 2021 Annual Research Report
  • 2020 Comments on the Screening Results   Annual Research Report
  • Research Products

    (27 results)

All 2024 2023 2022 2021 2020 Other

All Journal Article (7 results) (of which Peer Reviewed: 6 results,  Open Access: 5 results) Presentation (18 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Invited: 3 results) Remarks (2 results)

  • [Journal Article] 「パラダイム・シフト大賞(Grand Prix)」2024

    • Author(s)
      橋本 康・高山弘太郎・福田弘和
    • Journal Title

      植物環境工学

      Volume: 36 Pages: 66-68

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  • [Journal Article] 時計細胞集団の同期状態に着目した位相応答曲線の効率的な測定方法2022

    • Author(s)
      福田弘和、増田亘作
    • Journal Title

      時間生物学(日本時間生物学会誌)

      Volume: 28 Pages: 94-101

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    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Unstable Phase Response Curves Shown by Spatiotemporal Patterns in the Plant Root Circadian Clock2021

    • Author(s)
      Masuda Kosaku、Fukuda Hirokazu
    • Journal Title

      Journal of Biological Rhythms

      Volume: 36 Issue: 5 Pages: 432-441

    • DOI

      10.1177/07487304211028440

    • Related Report
      2021 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Time Lag Between Light and Heat Diurnal Cycles Modulates CIRCADIAN CLOCK ASSOCIATION 1 Rhythm and Growth in Arabidopsis thaliana2021

    • Author(s)
      Masuda Kosaku、Yamada Tatsuya、Kagawa Yuya、Fukuda Hirokazu
    • Journal Title

      Frontiers in Plant Science

      Volume: 11 Pages: 614360-614360

    • DOI

      10.3389/fpls.2020.614360

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      2020 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] The singularity response reveals entrainment properties of the plant circadian clock2021

    • Author(s)
      Masuda Kosaku、Tokuda Isao T.、Nakamichi Norihito、Fukuda Hirokazu
    • Journal Title

      Nature Communications

      Volume: 12 Issue: 1 Pages: 864-864

    • DOI

      10.1038/s41467-021-21167-7

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      2020 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Nondestructive Estimation of Circadian Time in Harvested Green Perilla Leaves Using Hyperspectral Data2020

    • Author(s)
      NAGANO Shogo、TANIGAKI Yusuke、FUKUDA Hirokazu
    • Journal Title

      Environment Control in Biology

      Volume: 58 Issue: 4 Pages: 91-97

    • DOI

      10.2525/ecb.58.91

    • NAID

      130007931063

    • ISSN
      1880-554X, 1883-0986
    • Year and Date
      2020-10-01
    • Related Report
      2020 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Oscillating Gene Expression Analysis by Long-term Sampling of Plant Factory Lettuce2020

    • Author(s)
      TANIGAKI Yusuke、MORIYUKI Shogo
    • Journal Title

      Shokubutsu Kankyo Kogaku

      Volume: 32 Issue: 3 Pages: 160-164

    • DOI

      10.2525/shita.32.160

    • NAID

      130007895136

    • ISSN
      1880-2028, 1880-3563
    • Related Report
      2020 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] SPA基礎研究の機械情報学的パラダイム・シフト2023

    • Author(s)
      福田弘和
    • Organizer
      日本生物環境工学会2023年
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      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] 植物概日時計における位相応答曲線の精密同定2023

    • Author(s)
      福田弘和
    • Organizer
      第30回日本時間生物学会学術大会
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      2023 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] 植物細胞格子における位相応答場を構築する位相応答シミュレーターの開発2023

    • Author(s)
      青山尚暉,八木亮太,福田弘和
    • Organizer
      食料農業工学会関西支部
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      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] 植物の側根形成時における概日リズムの乱れについての研究2023

    • Author(s)
      小田彬人,福田弘和
    • Organizer
      食料農業工学会関西支部
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      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] 薬剤投与による主観的昼と夜の比率変化に関する数理モデル解析2023

    • Author(s)
      田島優介,藤本風太,福田弘和
    • Organizer
      食料農業工学会関西支部
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      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] 画像処理による植物細胞間接触面積の算出方法2023

    • Author(s)
      豊嶋悠斗,奥山瑞生,福田弘和
    • Organizer
      食料農業工学会関西支部
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      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] 複雑環境下における概日時計の振舞いを支配する「位相応答場」の基礎研究2022

    • Author(s)
      福田弘和
    • Organizer
      日本生物環境工学会
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      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] 概日時計細胞集団に対する光照射を用いた位相特異点生成についての数値解析2022

    • Author(s)
      小田彬人・福田弘和
    • Organizer
      日本生物環境工学会
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      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] 植物概日時計の位相応答場技術2022

    • Author(s)
      福田弘和
    • Organizer
      第39日本植物バイオテクノロジー学会(堺)大会・シンポジウム
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      2022 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] 局部刺激で誘起する概日時計の位相特異点に関する数理モデル解析2022

    • Author(s)
      小田彬人・福田弘和
    • Organizer
      第39日本植物バイオテクノロジー学会(堺)大会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] 植物工場レタスの葉面積から概日リズムを算出する手法における U-net 法の検証とmask r-CNN の実装2022

    • Author(s)
      奥山瑞生,福田弘和
    • Organizer
      第29回日本時間生物学会学術大会
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      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] 位相応答の逆問題を用いた化学物質作用タイムラグ推定方法の精度評価2022

    • Author(s)
      藤本風太,福田弘和
    • Organizer
      第29回日本時間生物学会学術大会
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      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] 植物栽培用の培地中における周期的な大気圧変動シグナルの貫通性の評価2022

    • Author(s)
      池田和輝,福田弘和
    • Organizer
      第29回日本時間生物学会学術大会
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      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] A platform technology for analysis and control of the plant circadian clock under complex environments2022

    • Author(s)
      Hirokazu Fukuda
    • Organizer
      The XX CIGR World Congress 2022
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      2022 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] シロイヌナズナの葉における概日リズムの不均一な位相応答の計測2020

    • Author(s)
      田中綸,増田亘作,福田弘和
    • Organizer
      第 27 回 日本時間生物学会学術大会
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      2020 Annual Research Report
  • [Presentation] 光と温度の日周サイクルにおける位相差が植物の生育へ与える影響2020

    • Author(s)
      山田竜也,増田亘作,香河悠也 ,福田弘和
    • Organizer
      第 27 回 日本時間生物学会学術大会
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      2020 Annual Research Report
  • [Presentation] シロイヌナズナにおける概日時計の振幅を増大させる最適な明暗サイクル波形の検討2020

    • Author(s)
      香河悠也 ,増田亘作,山田竜也,福田弘和
    • Organizer
      第 27 回 日本時間生物学会学術大会
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      2020 Annual Research Report
  • [Presentation] 概日時計シンギュラリティから見た栽培環境の新たな設計2020

    • Author(s)
      福田弘和
    • Organizer
      日本植物学会 第84回大会・シンポジウム
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      2020 Annual Research Report
    • Invited
  • [Remarks] 大阪公立大学工学研究科 機械系専攻 バイオ生産システム工学研究グループ

    • URL

      https://www.omu.ac.jp/eng/bioproduction/

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  • [Remarks] 大阪公立大学 工学研究科 機械系専攻 バイオ生産システム工学研究グループ

    • URL

      https://www.omu.ac.jp/eng/bioproduction/

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      2021 Annual Research Report

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Published: 2020-04-28   Modified: 2025-01-30  

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