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Single bacteria sensing using nonlinear electrical impedance response in high electric field created in nano-scaled space

Research Project

Project/Area Number 20H02160
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

Allocation TypeSingle-year Grants
Section一般
Review Section Basic Section 21030:Measurement engineering-related
Research InstitutionTokyo Institute of Technology

Principal Investigator

Yamamoto Takakatoki  東京工業大学, 工学院, 准教授 (20322688)

Project Period (FY) 2020-04-01 – 2023-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2022)
Budget Amount *help
¥17,940,000 (Direct Cost: ¥13,800,000、Indirect Cost: ¥4,140,000)
Fiscal Year 2022: ¥4,940,000 (Direct Cost: ¥3,800,000、Indirect Cost: ¥1,140,000)
Fiscal Year 2021: ¥4,940,000 (Direct Cost: ¥3,800,000、Indirect Cost: ¥1,140,000)
Fiscal Year 2020: ¥8,060,000 (Direct Cost: ¥6,200,000、Indirect Cost: ¥1,860,000)
Keywordsインピーダンス測定 / ナノポア / 単一粒子 / ウイルス / バクテリア / 交流測定 / ナノ流体 / マイクロ流体 / ナノ流路 / インピーダンス / 交流 / 単一粒子計測 / ナノデバイス / センサ / 機械学習 / 超微少電流 / 細菌1粒子センシング / ウイルス1粒子センシング / 感染回避 / 電気インピーダンス計測 / ナノ流体デバイス / 細菌1細胞解析 / ウイルス1粒子解析 / 電気インピーダンス / 誘電泳動 / ナノ電極 / ナノ流体システム / バイオセンサ / 細菌 / 感染症予防
Outline of Research at the Start

本研究では,ナノ空間に作られる高電界下での電気計測を合目的的に利用して,細菌を単一粒子レベルで計測する新しい細菌センシング法の創成と高電界計測の原理を解明する。具体的には,1)細菌1粒子の高電界非線形インピーダンス計測の実証,2)高電界測定における高感度化のメカニズムの解明,3)細菌の種類を同定する解析法の開発である。これらの項目に取り組みながら本手法の学理を深め,新しい計測法として確立する。また,さらなる高感度化の延長にあるウイルスセンシングに関しても先鞭を付け,安全・安寧な社会の実現に向けた病原性微生物の早期発見に資する計測技術の基盤を築く。

Outline of Final Research Achievements

Through the demonstration of the measurement of a single bacterial particle flowing in a microfluidic channel, we have demonstrated the electrical impedance measurement of a single bio-nanoparticle under a high electric field. Furthermore, we developed an analysis method to identify bacterial species from the measurement data using machine learning, and pioneered the realization of a "growing sensor," in which artificial intelligence grows in accordance with the amount of measurement and improves the classification performance of bacterial species. As a result, it was clarified that even if the size and material are the same, impedance characteristics can be obtained depending on the surface condition. By utilizing these characteristics and also using machine learning, we have demonstrated that bacteria of almost the same size can be classified with an accuracy of more than 95%.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

交流型(AC)測定によるナノポア測定は世界初の実証例である。また、従来の直流型(DC)ナノポア測定と比較した場合、位相差の情報が新たに増えることから機械学習における正解率も高くなる傾向が得られており、用途によってはACナノポア法はDCナノポア法の上位互換になり得るものである。まだ概念実証の段階ではあるものの、既に95%以上の正解率を得られており、微生物センサとしての有用性を示すものである。本手法は1つのセンサで網羅的に無数のバクテリアやウイルスをセンシングでき、かつ、測定するほどにセンサAIが強化されて性能が向上する「成長するセンサ」として、その創出に先鞭をつけるものである。

Report

(4 results)
  • 2022 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2021 Annual Research Report
  • 2020 Annual Research Report
  • Research Products

    (14 results)

All 2023 2022 2021 2020

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 3 results,  Open Access: 2 results) Presentation (10 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Invited: 1 results) Book (1 results)

  • [Journal Article] Nanopore Impedance Spectroscopy Reveals Electrical Properties of Single Nanoparticles for Detecting and Identifying Pathogenic Viruses2023

    • Author(s)
      Kazuki Kitta, Maami Sakamoto, Kei Hayakawa, Akira Nukazuka, Kazuhiko Kano, and Takatoki Yamamoto
    • Journal Title

      ACS Omega

      Volume: 8 Issue: 16 Pages: 14684-14693

    • DOI

      10.1021/acsomega.3c00628

    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] 交流ナノポア法による単一ナノ粒子のインピーダンス計測とウイルスセンシングへの応用2023

    • Author(s)
      山本 貴富喜、橘田 和樹、坂本 まあみ、早川 渓、糠塚 明、加納 一彦
    • Journal Title

      電気学会論文誌E

      Volume: -

    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] One-Dimensional Flow of Bacteria on an Electrode Rail by Dielectrophoresis: Toward Single-Cell-Based Analysis2021

    • Author(s)
      Yukihiro Yamaguchi and Takatoki Yamamoto
    • Journal Title

      Micromachines

      Volume: 12 Issue: 2 Pages: 123-137

    • DOI

      10.3390/mi12020123

    • Related Report
      2020 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] 機械学習による交流ナノポア計測におけるウイルス・バクテリア同定能の高度化2022

    • Author(s)
      坂本 まあみ,山本 貴富喜
    • Organizer
      第39回「センサ・マイクロマシンと応用システム」 シンポジウム
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] 交流ナノポア法の広帯域化におけるナノポア形状の数値解析2022

    • Author(s)
      仲間礼佳、山本貴富喜
    • Organizer
      第39回「センサ・マイクロマシンと応用システム」 シンポジウム
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] 流路型ナノポアを用いた交流ナノポア法による単一ナノ粒子の周波数特性評価2022

    • Author(s)
      小若 龍世、山本 貴富喜
    • Organizer
      第13回 マイクロ・ナノ工学シンポジウム
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] ACナノポア法の広帯域化に向けたナノポア構造の検討2022

    • Author(s)
      堀 宏輔、坂本 まあみ、山本 貴富喜
    • Organizer
      第13回 マイクロ・ナノ工学シンポジウム
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] ACナノポア法による単一ナノ粒子の電気物性測定能に関する数値解析2022

    • Author(s)
      山本 貴富喜
    • Organizer
      COMSOL Conference Tokyo 2022
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] FOMATION OF BACTERIA STREAM IN LINE BY DIELECTROPHORESIS2021

    • Author(s)
      Takatoki Yamamoto
    • Organizer
      Miniaturized Systems for Chemistry and Life Sciences (Micro TAS 2021)
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] VIRUS IDENTIFICATION BY EASY TO FABRICATE NANOPORE-CHIP USING ULTRATHIN GLASS-FILM AND OPRICAL BONDING2020

    • Author(s)
      Takatoki Yamamoto
    • Organizer
      The 24th International Conference on Miniaturized Systems for Chemistry and Life Sciences (MicroTAS 2020)
    • Related Report
      2020 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] ブラウン運動を利用した細菌1細胞捕捉法の数値解析2020

    • Author(s)
      伊藤健地,山本貴富喜
    • Organizer
      マイクロ・ナノ工学シンポジウム
    • Related Report
      2020 Annual Research Report
  • [Presentation] ガラスフィルムを用いたナノポアデバイスの作成と バイオナノ粒子計測への応用2020

    • Author(s)
      中村泰輝, 山本貴富喜
    • Organizer
      第37回「センサ・マイクロマシンと応用システム」シンポジウム
    • Related Report
      2020 Annual Research Report
  • [Presentation] 誘電泳動力を用いた1細菌計数デバイスの実現に向けた細菌配列技術の実現2020

    • Author(s)
      山口 悠弘 正 山本貴富喜
    • Organizer
      マイクロ・ナノ工学シンポジウム
    • Related Report
      2020 Annual Research Report
  • [Book] AI・ナノ・量子による超高感度・迅速バイオセンシング2021

    • Author(s)
      山本 貴富喜 (執筆分担)
    • Total Pages
      244
    • Publisher
      シーエムシー出版
    • ISBN
      9784781316093
    • Related Report
      2021 Annual Research Report

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Published: 2020-04-28   Modified: 2024-01-30  

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