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Development of Ultrahigh-throughput Technology for Single cell Metabolic Phenotyping

Research Project

Project/Area Number 20H02872
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

Allocation TypeSingle-year Grants
Section一般
Review Section Basic Section 37020:Chemistry and chemical methodology of biomolecules-related
Research InstitutionNational Institute of Advanced Industrial Science and Technology

Principal Investigator

Miura Daisuke  国立研究開発法人産業技術総合研究所, 生命工学領域, 主任研究員 (40532627)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 藤村 由紀  九州大学, 農学研究院, 准教授 (20390304)
Project Period (FY) 2020-04-01 – 2023-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2022)
Budget Amount *help
¥17,940,000 (Direct Cost: ¥13,800,000、Indirect Cost: ¥4,140,000)
Fiscal Year 2022: ¥4,290,000 (Direct Cost: ¥3,300,000、Indirect Cost: ¥990,000)
Fiscal Year 2021: ¥5,070,000 (Direct Cost: ¥3,900,000、Indirect Cost: ¥1,170,000)
Fiscal Year 2020: ¥8,580,000 (Direct Cost: ¥6,600,000、Indirect Cost: ¥1,980,000)
Keywords代謝 / プロファイリング / 質量分析 / ハイスループット / MALDI-MS / singles cell / フェノタイピング / メタボロミクス / 一細胞
Outline of Research at the Start

本研究では、研究代表者が独自に開発してきたマトリックス支援レーザー脱離イオン化(MALDI)法を基盤とした超高感度生体内化合物分析技術を先鋭化し、超高速一細胞代謝プロファイリングプラットフォームの創生を目的とする。細胞単位での“物質的フェノタイプ”とも言われるメタボロームをプロファイルとして捉え、各々の“細胞の個性”を高解像度に捉える超高速・高感度分析法を開発し、疾患や薬剤投与などへの応答をフェノタイプとして捉える事が可能な技術へと昇華させる。

Outline of Final Research Achievements

In this study, we have investigated the use of W/O droplets mimicking animal cells in order to optimize the sample preparation method with high sensitivity and reproducibility, aiming to establish a metabolic profiling method for single cells using MALDI-MS. We succeeded in establishing a sample preparation method with high reproducibility and high sensitivity by providing a matrix by vapor deposition followed by recrystallization under mild conditions. Using these conditions, the droplet containing multiple metabolite standards can be detected independently by mass spectrometry, and the detection sensitivity was found to be very favorable, with detection at the atto mol level being sufficient.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

本研究で開発したMALDI-MSによる超高速一細胞代謝フェノタイピング技術は、“細胞の個性”を捉える超高感度解析を指向する一細胞メタボロミクスに新たなモダリティを与える革新的技術となり得る。特に、創薬における成功率の向上・迅速化・低コスト化による国際競争力の向上、病態マーカー探索・分析に対するスループットの向上への貢献が期待され、医療イノベーションにおけるキーテクノロジーになり得ると考える。

Report

(4 results)
  • 2022 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2021 Annual Research Report
  • 2020 Annual Research Report
  • Research Products

    (3 results)

All 2022 2021

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 2 results,  Open Access: 2 results) Presentation (1 results)

  • [Journal Article] Inflammatory markers S100A8/A9 and metabolic alteration for evaluating signs of early phase toxicity of anticancer agent treatment2022

    • Author(s)
      Tomomi Morikawa-Ichinose, Yoshinori Fujimura, Motofumi Kumazoe, Hiroaki Onda, Daisuke Miura, Hirofumi Tachibana
    • Journal Title

      Food and Chemical Toxicology

      Volume: 169 Pages: 113421-113421

    • DOI

      10.1016/j.fct.2022.113421

    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Validation and standardization of DNA extraction and library construction methods for metagenomics-based human fecal microbiome measurements2021

    • Author(s)
      Tourlousse Dieter M.、Narita Koji、Miura Takamasa、Sakamoto Mitsuo、et al.
    • Journal Title

      Microbiome

      Volume: 9 Issue: 1 Pages: 1-19

    • DOI

      10.1186/s40168-021-01048-3

    • Related Report
      2021 Annual Research Report 2020 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] 微生物のトキシン-アンチトキシンシステムType II のトキシンMazFが誘導 する増殖抑制メカニズムの解明2022

    • Author(s)
      石塚寛子、横田亜紀子、野田尚宏、三浦大典
    • Organizer
      第16回メタボロームシンポジウム
    • Related Report
      2022 Annual Research Report

URL: 

Published: 2020-04-28   Modified: 2024-01-30  

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