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Elucidation of the gene expression profile of bifidobacteria in the gut microbiota: development of selective recovery method

Research Project

Project/Area Number 20H02893
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

Allocation TypeSingle-year Grants
Section一般
Review Section Basic Section 38020:Applied microbiology-related
Research InstitutionHokkaido University

Principal Investigator

Fukiya Satoru  北海道大学, 農学研究院, 教授 (10370157)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 後藤 恭宏  九州大学, 医学研究院, 助教 (20558358)
Project Period (FY) 2020-04-01 – 2023-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2022)
Budget Amount *help
¥17,940,000 (Direct Cost: ¥13,800,000、Indirect Cost: ¥4,140,000)
Fiscal Year 2022: ¥4,420,000 (Direct Cost: ¥3,400,000、Indirect Cost: ¥1,020,000)
Fiscal Year 2021: ¥4,680,000 (Direct Cost: ¥3,600,000、Indirect Cost: ¥1,080,000)
Fiscal Year 2020: ¥8,840,000 (Direct Cost: ¥6,800,000、Indirect Cost: ¥2,040,000)
Keywordsビフィズス菌 / 選択的回収 / 腸内細菌叢 / 腸内生存 / トランスクリプトーム / RNA-Seq
Outline of Research at the Start

複雑な腸内細菌叢の中でそれぞれの菌種がどのようにして生存しているのかを明らかにすることは,ヒトの健康と密接にかかわる腸内細菌の働きを知る上で非常に重要である.しかし,多種多様な細菌が存在する中で,特定の菌についてそのメカニズムを明らかにすることは,非常に困難である.
そこで本研究では,ビフィズス菌を題材として,ビフィズス菌を腸内細菌叢から選択的に回収する手法を開発する.その手法を用いて回収したビフィズス菌の遺伝子の発現パターンを調べることにより,ビフィズス菌が腸内細菌叢の中でどのようにして生きているのかを明らかにすることができる.これにより,ヒトの健康増進に貢献する成果が得られると期待される.

Outline of Final Research Achievements

Molecular mechanisms of how bifidobacteria survive in the intestine are not fully understood especially in the presence of the gut microbiota. To clarify the mechanisms, we tried to establish an experimental system to collect Bifidobacterium longum administered into the conventional mouse intestine selectively to obtain its gene expression profiles in the presence of gut microbiota. Four kinds of B. longum strains expressing different peptide tags on the cell surface were constructed as a fusion with the surface-presenting protein. After verifying the tag expression and surface presentation, we established an optimum collection method in vitro using the Strep-tagII. In addition, the tag-expressing strain was successfully recovered from the artificial gut microbiota using the established collection method.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

本研究では,ペプチドタグを細胞表層に発現するビフィズス菌株を構築し,人工腸内細菌叢からビフィズス菌を選択的に回収する方法を確立した.これまで腸内細菌叢存在下でのビフィズス菌の詳細な遺伝子発現プロファイルは得られていないが,本研究の成果はその情報を得るためのブレークスルーとなる.また本研究の今後の進展により,ビフィズス菌の腸内での生存機構を明らかにすることが期待される.これにより,様々な健康効果をもたらすビフィズス菌を腸内でどのように維持し,人々の健康維持に貢献するかという社会的な課題に応える基盤的な情報を得ることができる.したがって,本研究の成果は社会的にも重要な成果であると評価できる.

Report

(4 results)
  • 2022 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2021 Annual Research Report
  • 2020 Annual Research Report
  • Research Products

    (8 results)

All 2023 2022 2021

All Presentation (8 results) (of which Invited: 1 results)

  • [Presentation] Bifidobacterium longum subsp. longum における1-Kestose 代謝メカニズムの解明2023

    • Author(s)
      難波 有希、倉持 碧海、山口 颯人、吉田 佳鼓、後藤 恭宏、門田 吉弘、栃尾 巧、小椋 義俊、林 哲也、前田 智也、横田 篤、吹谷 智
    • Organizer
      日本農芸化学会2023年度大会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] 腸内細菌叢からのビフィズス菌の選択的回収系の確立2022

    • Author(s)
      宮下 聖也、吉田 佳鼓、嶋田 みな、前田 智也、横田 篤、吹谷 智
    • Organizer
      日本乳酸菌学会2022年度大会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] Bifidobacterium longum subsp. longum における1-Kestose 代謝メカニズムの解明2022

    • Author(s)
      難波 有希、倉持 碧海、山口 颯人、吉田 佳鼓、後藤 恭宏、門田 吉弘、栃尾 巧、小椋 義俊、林 哲也、前田 智也、横田 篤、吹谷 智
    • Organizer
      日本乳酸菌学会2022年度大会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] 腸内細菌叢中に存在するビフィズス菌の選択的回収系の確立2022

    • Author(s)
      宮下聖也,吉田佳鼓,嶋田みな,前田智也,横田篤,吹谷智
    • Organizer
      令和4年度 日本農芸化学会 北海道・東北支部 合同支部会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] 腸内細菌叢中に存在するビフィズス菌の選択的回収系の確立2022

    • Author(s)
      吉田 佳鼓, 嶋田 みな, 宮下 聖也,前田 智也, 横田 篤, 吹谷 智
    • Organizer
      日本農芸化学会2022年度大会
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Presentation] Insertion Sequencing法によるビフィズス菌の腸内生存に寄与する遺伝子の同定2022

    • Author(s)
      吹谷 智
    • Organizer
      第95回日本細菌学会総会
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] 1-Kestose存在下で発現変動するビフィズス菌遺伝子のRNA-Seqによる同定2021

    • Author(s)
      難波有希,倉持碧海,山口颯人,吉田佳鼓,後藤恭宏,門田吉弘,栃尾 巧,小椋義俊,林 哲也,横田 篤,吹谷 智
    • Organizer
      日本生物工学会北日本支部2021年度第1回若手シンポジウム
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Presentation] Bifidobacterium longum subsp. longum における1-Kestose 代謝メカニズムの解明2021

    • Author(s)
      難波有希,吉田佳鼓,山口颯人,後藤恭宏,門田吉弘,栃尾 巧,小椋義俊,林 哲也,横田 篤,吹谷 智
    • Organizer
      第73回日本生物工学会大会
    • Related Report
      2021 Annual Research Report

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Published: 2020-04-28   Modified: 2024-01-30  

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