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Elucidation of mechanisms for transport and storage of hydrophobic metabolites in plant cells toward establishment of a polymer factory cell system

Research Project

Project/Area Number 20H02909
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

Allocation TypeSingle-year Grants
Section一般
Review Section Basic Section 38030:Applied biochemistry-related
Research InstitutionTohoku University

Principal Investigator

Takahashi Seiji  東北大学, 工学研究科, 准教授 (90343061)

Project Period (FY) 2020-04-01 – 2023-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2023)
Budget Amount *help
¥17,030,000 (Direct Cost: ¥13,100,000、Indirect Cost: ¥3,930,000)
Fiscal Year 2022: ¥5,200,000 (Direct Cost: ¥4,000,000、Indirect Cost: ¥1,200,000)
Fiscal Year 2021: ¥5,330,000 (Direct Cost: ¥4,100,000、Indirect Cost: ¥1,230,000)
Fiscal Year 2020: ¥6,500,000 (Direct Cost: ¥5,000,000、Indirect Cost: ¥1,500,000)
Keywords脂肪顆粒 / ゴム粒子 / ポリイソプレン / 無細胞翻訳系 / プレニルトランスフェラーぜ / 天然ゴム / 脂肪滴 / イソプレノイド / 無細胞タンパク質合成 / ポリイソプレノイド / プレニルトランスフェラーゼ / プレニル鎖延長酵素 / プレニル鎖延⻑酵素
Outline of Research at the Start

代謝工学により有用疎水性化合物を細胞内に高蓄積させるためには、脂肪顆粒(LD)やゴム粒子(RP)などの脂質一重層で覆われた構造のオルガネラへの隔離的貯蔵が重要となる。そのためには、外来酵素をそれらのオルガネラの膜に導入する必要があるが、LDやRPへのタンパク質移行機構は未解明である。本研究では、まず、無細胞タンパク質発現系を利用し、翻訳・折りたたみと共役させながらタンパク質をLDやRPに導入する手法を開発し、その系を用いて移行に必須なタンパク質モチーフとその分子機構を解明する。また、その移行機構を利用し新規ポリイソプレノイド合成酵素をRPやLDに導入することで、新規ポリマー高生産系を構築する。

Outline of Final Research Achievements

In this study, we developed a method to introduce foreign proteins into lipid droplets (LDs), coupled with translation and folding, by adding LDs prepared from Chlamydomonas reinhardtii to a wheat germ cell-free protein expression system. Functional analysis using this method revealed the membrane binding domain of LD membrane proteins, which consists of some amphipathic helices. Furthermore, by fusing the membrane binding domain, we were able to introduce a trans-prenyltransferase, first identified as an ultra-long chain trans-1,4-polyisoprene (tPI) synthase, to the LD membrane. This resulted in a tenfold increase in the degree of polymerization of the products, tPI.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

代謝工学により植物細胞内で有用疎水性化合物を高生産・高蓄積させるためには、細胞への悪影響を回避することが必要となる。LDやRPなどの脂質一重層オルガネラは、疎水性化合物を隔離的に貯蔵することから、それらの膜上に種々の外来酵素を配置することで、反応生成物を膜内部へ効率よく蓄積させる系の構築が可能となる。本研究で解明されたLD膜結合配列は、外来酵素のLD膜上への配置を可能とすることから、その学術的・産業的なインパクトが非常に大きい。また、本研究で初めてtPI合成酵素が同定された。これらの発見の統合により、脂質一重層オルガネラをシンク器官としたポリマーファクトリーセル構築が可能となった。

Report

(3 results)
  • 2023 Final Research Report ( PDF )
  • 2021 Annual Research Report
  • 2020 Annual Research Report
  • Research Products

    (18 results)

All 2022 2021 2020

All Journal Article (10 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 10 results,  Open Access: 3 results) Presentation (7 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Invited: 1 results) Patent(Industrial Property Rights) (1 results) (of which Overseas: 1 results)

  • [Journal Article] Identification of the Genes Coding for Carthamin Synthase, Peroxidase Homologs that Catalyze the Final Enzymatic Step of Red Pigmentation in Safflower (Carthamus tinctorius L.)2021

    • Author(s)
      Waki Toshiyuki、Terashita Miho、Fujita Naoki、Fukuda Keishi、Kato Mikiya、Negishi Takashi、Uchida Hiromi、Aoki Yuichi、Takahashi Seiji、Nakayama Toru
    • Journal Title

      Plant and Cell Physiology

      Volume: 62 Issue: 10 Pages: 1528-1541

    • DOI

      10.1093/pcp/pcab122

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    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Metabolon formation in plant specialized metabolism2021

    • Author(s)
      中山 亨、和氣 駿之、高橋 征司
    • Journal Title

      Regulation of Plant Growth & Development

      Volume: 56 Issue: 1 Pages: 14-25

    • DOI

      10.18978/jscrp.56.1_14

    • NAID

      130008161584

    • ISSN
      1346-5406, 2189-6305
    • Related Report
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    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Alteration of oxidative-stress and related marker levels in mouse colonic tissues and fecal microbiota structures with chronic ethanol administration: Implications for the pathogenesis of ethanol-related colorectal cancer2021

    • Author(s)
      Hideo Ohira, Atsuki Tsuruya, Daiki Oikawa, Wao Nakagawa, Rie Mamoto, Masahira Hattori, Toshiyuki Waki, Seiji Takahashi, Yoshio Fujioka, Toru Nakayama
    • Journal Title

      PLoS One .

      Volume: 16(2):e0246580 Issue: 2 Pages: 1-20

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0246580

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      2021 Annual Research Report 2020 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Crystal structure of Thermobifida fusca cis-prenyltransferase reveals the dynamic nature of its RXG motif-mediated inter-subunit interactions critical for its catalytic activity2020

    • Author(s)
      Kurokawa Hirofumi、Ambo Takanori、Takahashi Seiji、Koyama Tanetoshi
    • Journal Title

      Biochemical and Biophysical Research Communications

      Volume: 532 Issue: 3 Pages: 459-465

    • DOI

      10.1016/j.bbrc.2020.08.062

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    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] A conserved strategy of chalcone isomerase-like protein to rectify promiscuous chalcone synthase specificity2020

    • Author(s)
      T. Waki, A. Hoshino, et al.
    • Journal Title

      Nature Communications

      Volume: 11 Issue: 1 Pages: 870-870

    • DOI

      10.1038/s41467-020-14558-9

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    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Molecular Mechanisms of Natural Rubber Biosynthesis2020

    • Author(s)
      Yamashita Satoshi、Takahashi Seiji
    • Journal Title

      Annual Review of Biochemistry

      Volume: 89 Issue: 1 Pages: 821-851

    • DOI

      10.1146/annurev-biochem-013118-111107

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  • [Journal Article] Crystal structure of chalcone synthase, a key enzyme for isoflavonoid biosynthesis in soybean2020

    • Author(s)
      Imaizumi Riki、Mameda Ryo、Takeshita Kohei、Kubo Hiroki、Sakai Naoki、Nakata Shun、Takahashi Seiji、Kataoka Kunishige、Yamamoto Masaki、Nakayama Toru、Yamashita Satoshi、Waki Toshiyuki
    • Journal Title

      Proteins: Structure, Function, and Bioinformatics

      Volume: 89 Issue: 1 Pages: 126-131

    • DOI

      10.1002/prot.25988

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  • [Journal Article] Managing enzyme promiscuity in plant specialized metabolism: A lesson from flavonoid biosynthesis2020

    • Author(s)
      Waki Toshiyuki、Takahashi Seiji、Nakayama Toru
    • Journal Title

      BioEssays

      Volume: 43 Issue: 3 Pages: 2000164-2000164

    • DOI

      10.1002/bies.202000164

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    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] 天然ゴム生合成機構から考える次世代の植物工学2020

    • Author(s)
      高橋 征司
    • Journal Title

      生物工学会誌

      Volume: 98 Pages: 600-603

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  • [Journal Article] 膜上の酵素複合体による巧妙な植物特化代謝の制御戦略2020

    • Author(s)
      高橋 征司, 和氣 駿之, 中山 亨
    • Journal Title

      公益社団法人日本化学会 バイオテクノロジー部会 NEWS LETTER

      Volume: 23 Pages: 3-12

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  • [Presentation] 比較機能解析によるテルペン合成酵素の生成物特性制御機構の解明2022

    • Author(s)
      天野博之 , 栗栖尚嗣 , 山家史大 , 廣森美樹 , 和氣駿之 , 中山亨 , 高橋征司
    • Organizer
      2022年日本農芸化学会大会
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  • [Presentation] パラゴムノキの天然ゴム生合成酵素複合体におけるタンパク質間相互作用ドメインとその機能的意義の解析2022

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      NUR SHAZANA BINTI ABU TALIB KHAN Nadia;廣森美樹;和氣駿之;山下哲;戸澤譲;山口晴彦;宮城ゆき乃;中山亨;高橋征司
    • Organizer
      2022年日本農芸化学会大会
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      高橋朋宏;山家史大;酒井勇貴;皆川知歩;和氣駿之;中山亨;高橋征司
    • Organizer
      2022年日本農芸化学会大会
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  • [Presentation] サポジラ(Manilkara zapota)由来trans型プレニルトランスフェラーゼの酵素機能解析2021

    • Author(s)
      三輪幸祐;廣森美樹;青木裕一;和氣駿之;小島幸治;山下哲;山口晴彦;宮城ゆき乃;戸澤譲;中山亨;高橋征司
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      第31回イソプレノイド研究会例会講演要旨集
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      黒岩風;西野輝;廣森美樹;モンドル慶子;山口晴彦;宮城ゆき乃;山下哲;高橋征司;戸澤譲
    • Organizer
      第31回イソプレノイド研究会例会講演要旨集
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    • Author(s)
      開琢海;三輪幸祐;廣森美樹;和氣駿之;山下哲;戸澤譲;山口晴彦;宮城ゆき乃;岩井雅子;太田啓之;中山亨;高橋征司
    • Organizer
      第31回イソプレノイド研究会例会講演要旨集
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  • [Presentation] In vitro synthesis of natural rubber by recombinant enzymes introduced on rubber particles2020

    • Author(s)
      Seiji Takahashi
    • Organizer
      Association for the Advancement of Industrial Crops
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    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Patent(Industrial Property Rights)] ポリイソプレノイドの製造方法、ベクター、形質転換植物、空気入りタイヤの製造方法及びゴム製品の製造方法2021

    • Inventor(s)
      山口晴彦,井之上ゆき乃,伏原和久,高橋征司,山下哲,中山亨
    • Industrial Property Rights Holder
      山口晴彦,井之上ゆき乃,伏原和久,高橋征司,山下哲,中山亨
    • Industrial Property Rights Type
      特許
    • Filing Date
      2021
    • Related Report
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    • Overseas

URL: 

Published: 2020-04-28   Modified: 2025-01-30  

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