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Evolutionary dynamics of cis-trans factors on the regulation of plant gene cluster for diterpenoid momilactone.

Research Project

Project/Area Number 20H02922
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

Allocation TypeSingle-year Grants
Section一般
Review Section Basic Section 38040:Bioorganic chemistry-related
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

Okada Kazunori  東京大学, 大学院農学生命科学研究科(農学部), 准教授 (20312241)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 澤崎 達也  愛媛大学, プロテオサイエンスセンター, 教授 (50314969)
宮本 皓司  帝京大学, 理工学部, 講師 (90721514)
Project Period (FY) 2020-04-01 – 2024-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2023)
Budget Amount *help
¥17,680,000 (Direct Cost: ¥13,600,000、Indirect Cost: ¥4,080,000)
Fiscal Year 2023: ¥3,120,000 (Direct Cost: ¥2,400,000、Indirect Cost: ¥720,000)
Fiscal Year 2022: ¥3,900,000 (Direct Cost: ¥3,000,000、Indirect Cost: ¥900,000)
Fiscal Year 2021: ¥4,810,000 (Direct Cost: ¥3,700,000、Indirect Cost: ¥1,110,000)
Fiscal Year 2020: ¥5,850,000 (Direct Cost: ¥4,500,000、Indirect Cost: ¥1,350,000)
Keywordsイネ / ファイトアレキシン / 遺伝子クラスター / 転写制御 / 転写因子 / イネファイトアレキシン / モミラクトン / 生合成遺伝子遺伝子クラスター / アレロパシー / エピジェネティック制御 / ケミカルディフェンス / 生合成遺伝子クラスター / 二次代謝産物 / シス因子 / トランス因子
Outline of Research at the Start

イネが生産する抗菌性物質モミラクトンの生合成遺伝子群は、ゲノム上で遺伝子クラスターを形成し、様々なストレスに応答して協調的に発現誘導を示す。最近、下等植物の蘚類ハイゴケでもモミラクトン生合成遺伝子がクラスターを構成することがわかった。本研究では、モミラクトン生産植物がどのように生合成遺伝子クラスターを構成し、その制御機構を発達させ利用してきたのかについて、進化過程に着目しつつその答えを探る。

Outline of Final Research Achievements

Genomic comparison and transcriptome analysis of cultivated and wild rice plants showed that the DPF transcription factor and the N-box cis-element are evolutionarily conserved transcriptional regulatory systems that play a central role in regulating the production of diterpene-type phytoalexins (DP) such as momilactone, an antibacterial substance that contributes to disease resistance in rice. Besides, we identified the Momilactone B synthase gene in bryophyte Calohypunum plumiforme and detected how it exists on chromosomes and apart from the Momilactone A biosynthesis gene cluster in the moss. The results here provide important information on the evolutionary trajectory of the cis-trans regulatory system in the regulation of DP biosynthetic gene clusters in rice, and are important for comparison with the regulatory mechanism in the bryophyte mosses.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

植物に競争力を与えるモミラクトンは重要作物の栽培イネのみならず、野生イネやイヌビエ、蘚類ハイゴケなど進化的に離れた植物種でも遺伝子クラスターと共に維持されている。本研究では、その制御機構の一端を明らかにした。得られた成果は、この遺伝子クラスターのcis-trans転写制御機構が、野生イネから栽培イネまでの進化過程で保存されたシステムあり、イネ以外の作物などにおけるモミラクトンの生物活性の利用の観点で、生産制御の面から学術的に価値があるだけでなく、将来的な環境保全型の農業の確立において、植物種を超えた転写制御システムを用いた有用形質の導入を目指す上で重要な情報を与えるものであり社会的意義をもつ。

Report

(5 results)
  • 2023 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2022 Annual Research Report
  • 2021 Annual Research Report
  • 2020 Annual Research Report
  • Research Products

    (40 results)

All 2024 2023 2022 2021 2020 Other

All Int'l Joint Research (4 results) Journal Article (12 results) (of which Int'l Joint Research: 6 results,  Peer Reviewed: 12 results,  Open Access: 4 results) Presentation (24 results) (of which Int'l Joint Research: 4 results,  Invited: 2 results)

  • [Int'l Joint Research] ミュンヘン大学/カールスルーヘ工科大学(ドイツ)

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      Shimada T, Minato S, Hasegawa Y, Miyamoto K, Minato Y, Shenton MR, Okada K, Kawaide H, Toyomasu T.
    • Journal Title

      Biosci Biotechnol Biochem.

      Volume: 88 Issue: 1 Pages: 8

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      10.1093/bbb/zbad146

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      Okumura Taichi、Kitajima Tsumugi、Kaji Takuya、Urano Haruyuki、Matsumoto Kotaro、Inagaki Hideo、Miyamoto Koji、Okada Kazunori、Ueda Minoru
    • Journal Title

      Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry

      Volume: 87 Issue: 10 Pages: 1122

    • DOI

      10.1093/bbb/zbad092

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      Zhang D, Wang Z, Yamamoto N, Wang M, Yi X, Li P, Lin R, Nasimi Z, Okada K, Mochida K, Noutoshi Y, Zheng A.
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      Pathogens

      Volume: 11(9) Issue: 9 Pages: 1026-1026

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      10.3390/pathogens11091026

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      Knoch E, Kovacs J, Deiber S, Tomita K, Shanmuganathan R, Serra Serra N, Okada K, Becker C, Schandry N.
    • Journal Title

      BMC Plant Biol

      Volume: A22(1) Issue: 1 Pages: 402-402

    • DOI

      10.1186/s12870-022-03780-w

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      Wu D, Hu Y, Akashi S, Nojiri H, Guo L, Ye C, Zhu Q. H, Okada K, Fan L.
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      Plant Journal

      Volume: 111 Issue: 5 Pages: 1354-1367

    • DOI

      10.1111/tpj.15893

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      Fukuda Kyohei、Uefune Masayoshi、Fukaki Hidehiro、Yamauchi Yasuo、Hara-Nishimura Ikuko、Ozawa Rika、Matsui Kenji、Sugimoto Koichi、Okada Kazunori、Imai Ryozo、Takahashi Kenshi、Enami Shinichi、Wurst Rene、Takabayashi Junji
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      Biology Letters

      Volume: 18 Issue: 5 Pages: 20210629-20210629

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      10.1098/rsbl.2021.0629

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      Valea Ioana、Motegi Atsushi、Kawamura Naoko、Kawamoto Koichi、Miyao Akio、Ozawa Rika、Takabayashi Junji、Gomi Kenji、Nemoto Keiichirou、Nozawa Akira、Sawasaki Tatsuya、Shinya Tomonori、Galis Ivan、Miyamoto Koji、Nojiri Hideaki、Okada Kazunori
    • Journal Title

      Plant Molecular Biology

      Volume: 109 Issue: 4-5 Pages: 651

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      10.1007/s11103-021-01186-0

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      Shinya Tomonori、Miyamoto Koji、Uchida Kenichi、Hojo Yuko、Yumoto Emi、Okada Kazunori、Yamane Hisakazu、Galis Ivan
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      Plant Molecular Biology

      Volume: 109 Issue: 4-5 Pages: 595

    • DOI

      10.1007/s11103-021-01217-w

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      Keisuke Tomita, Yoko Yashiroda, Yasuhiro Matsuo, Jeff S Piotrowski, Sheena C Li, Reika Okamoto, Mami Yoshimura, Hiromi Kimura, Yumi Kawamura, Makoto Kawamukai, Charles Boone, Minoru Yoshida, Hideaki Nojiri, Kazunori Okada
    • Journal Title

      G3 (Bethesda)

      Volume: 11 Issue: 8

    • DOI

      10.1093/g3journal/jkab156

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    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
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    • Author(s)
      Hideo Inagaki, Koji Miyamoto, Noriko Ando, Kohei Murakami, Koki Sugisawa, Shion Morita, Emi Yumoto, Miyu Teruya, Kenichi Uchida, Nobuki Kato, Takuya Kaji, Yousuke Takaoka, Yuko Hojo, Tomonori Shinya, Ivan Galis, Akira Nozawa, Tatsuya Sawasaki, Hideaki Nojiri, Minoru Ueda, Kazunori Okada
    • Journal Title

      Frontiers in Plant Science

      Volume: 12 Pages: 688565-688565

    • DOI

      10.3389/fpls.2021.688565

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  • [Journal Article] Evolution of Labdane-Related Diterpene Synthases in Cereals.2020

    • Author(s)
      Toyomasu T, Shenton MR, Okada K.
    • Journal Title

      Plant & Cell Physiology

      Volume: 61(11) Issue: 11 Pages: 1850-1859

    • DOI

      10.1093/pcp/pcaa106

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      Mao L, Kawaide H, Higuchi T, Chen M, Miyamoto K, Hirata Y, Kimura H, Miyazaki S, Teruya M, Fujiwara K, Tomita K, Yamane H, Hayashi K, Nojiri H, Jia L, Qiu J, Ye C, Timko MP, Fan L, and Okada K
    • Journal Title

      Proc Natl Acad Sci USA

      Volume: 117 Issue: 22 Pages: 12472

    • DOI

      10.1073/pnas.1914373117

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      ○萩原寛之,安藤卓也,畠山聡,吉野康佑,小原敏明,岡田憲典
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      植物化学調節学会
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      ○Youming Liu, Shiho Tomiyama, Naoki Yamamoto, Masaki Mori, Koji Miyamoto, Hideaki Nojiri, Kazunori Okada
    • Organizer
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      Youming Liu, Naoki Yamamoto, Masaki Mori, Koji Miyamoto, David Wari, Tomonori Shinya, Ivan Galis, Gen-ichiro Arimura, Takuya Sakamoto, Hideaki Nojiri, ○Kazunori Okada
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      TERPENT
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      富田啓介,萩原寛之,小原敏明,岡田憲典
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      岡田憲典
    • Organizer
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    • Organizer
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      ○萩原寛之,髙橋明里,鳥邉翔,冨山詩歩,富田啓介,有村源一郎2,岡田憲典,小原敏明
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      富田啓介, 松尾安浩, 川向誠, 八代田陽子, 吉田稔, 野尻秀昭, 岡田憲典
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Published: 2020-04-28   Modified: 2025-01-30  

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