| Project/Area Number |
20H03196
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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| Allocation Type | Single-year Grants |
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| Section | 一般 |
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| Review Section |
Basic Section 43020:Structural biochemistry-related
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| Research Institution | University of Miyazaki |
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Principal Investigator |
和田 啓 宮崎大学, 医学部, 教授 (80379304)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
高橋 康弘 埼玉大学, 理工学研究科, 教授 (10154874)
藤田 祐一 名古屋大学, 生命農学研究科, 教授 (80222264)
井田 隆徳 宮崎大学, フロンティア科学総合研究センター, 准教授 (00381088)
永田 さやか 南九州大学, 健康栄養学部, 准教授 (00452920)
海野 昌喜 茨城大学, 理工学研究科(工学野), 教授 (10359549)
田中 良和 東北大学, 生命科学研究科, 教授 (20374225)
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| Project Period (FY) |
2020-04-01 – 2024-03-31
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| Project Status |
Granted (Fiscal Year 2023)
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| Budget Amount *help |
¥17,810,000 (Direct Cost: ¥13,700,000、Indirect Cost: ¥4,110,000)
Fiscal Year 2023: ¥3,640,000 (Direct Cost: ¥2,800,000、Indirect Cost: ¥840,000)
Fiscal Year 2022: ¥3,640,000 (Direct Cost: ¥2,800,000、Indirect Cost: ¥840,000)
Fiscal Year 2021: ¥3,770,000 (Direct Cost: ¥2,900,000、Indirect Cost: ¥870,000)
Fiscal Year 2020: ¥6,760,000 (Direct Cost: ¥5,200,000、Indirect Cost: ¥1,560,000)
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| Keywords | 鉄硫黄クラスター / X線結晶構造解析 / クライオ電子顕微鏡解析 / 無酸素環境実験 / 窒素固定 / 立体構造 / 窒素固定遺伝子群 / ATPase |
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| Outline of Research at the Start |
鉄硫黄クラスター(Fe-S)は、酸素に脆弱なタンパク質コファクターである。Fe-Sクラスターは単純な構造だが、この生合成にはSUFマシナリーと呼ばれる大掛かりな蛋白質群を必要とする。本研究では、Fe-Sクラスターを試験管内で人為的に合成する系を確立する。確立した系を利用することによって、複雑なFe-Sクラスター合成反応を自在にコントロールし、生合成の各ステップを分子レベルで捉える。
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| Outline of Annual Research Achievements |
鉄硫黄クラスター(Fe-S)は、酸素に脆弱なタンパク質コファクターである。Fe-Sクラスターは単純な構造だが、この生合成にはSUFマシナリーと呼ばれる大掛かり な蛋白質群を必要とする。本研究課題ではその"心臓部"といえるSufBCD複合体に焦点をあてる。この複合体は ATP 加水分解に共役して、鉄と硫黄原子をFe-Sクラスター へ変換する。本研究の目的は、酸素に不安定なFe-Sクラスター合成超複合体の作動メカニズムの全容解明である。また、窒素条件および低酸素条件を感知するタンパク質CnfRに関して、構造機能解析を進める。本年度は以下の項目を実施した。
(i)合成途上Fe-Sクラスター結合状態のSufBCD複合体の大量精製および結晶化スクリーニング：無酸素チャンバー内で精製することで、Fe-Sクラスター結合状態のコア複合体を得ることができている。無酸素条件下で稼働しているロボットを用いて、結晶化条件スクリーニングを行った。ATPアナログなどの添加剤、タンパク質濃度、温度など、これまでに7000条件以上のスクリーニングを実施した。得られた微結晶に関しては、大型放射光施設SPring-8にて回折能のチェックを行った。
(ii)SufBCD複合体の構造変化状態の補足：これまでの成果により、SufBCD複合体に変異を導入し、ATPおよび酸化剤存在下において複合体の構造変化をロックすることに成功している。この変異SufBCD複合体をもちいて構造変化をロックした状態でのクライオ電子顕微鏡解析（東北大学）を進め、粒子動画の収集を完了した。
(iii) 窒素固定のマスターレギュレーターCnfRの構造解析: 精製したCnfRの結晶化スクリーニングを行い、微結晶を得ることができた。大型放射光施設SPring-8にて、得られた結晶の回折能のチェックを行った。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
当初の計画において、「 無酸素条件下における"無細胞"クラスター合成系の確立」と「 窒素固定のマスターレギュレーターCnfR&ChlRの機能解析」を掲げていた。上記、実績の(i)~(ii)がクラスター合成系の確立に関する進捗であり、(iii)はCnfRおよびChlRの機能解析に該当する。
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| Strategy for Future Research Activity |
現在までに得られている複合体の構造機能解析に加え、今後は以下の項目を進める。
[1]SufBCD複合体の構造変化状態での構造解析
[2]鉄硫黄タンパク質の中性子構造解析を進める
[3]窒素固定のマスターレギュレーターCnfRの構造解析に向けた巨大複合体の作製する
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