• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to previous page

Chemical Basis and Medicinal Application of Alkene Dipeptide Isosteres

Research Project

Project/Area Number 20H03363
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

Allocation TypeSingle-year Grants
Section一般
Review Section Basic Section 47010:Pharmaceutical chemistry and drug development sciences-related
Research InstitutionShizuoka University

Principal Investigator

Narumi Tetsuo  静岡大学, 工学部, 准教授 (50547867)

Project Period (FY) 2020-04-01 – 2023-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2022)
Budget Amount *help
¥18,070,000 (Direct Cost: ¥13,900,000、Indirect Cost: ¥4,170,000)
Fiscal Year 2022: ¥4,420,000 (Direct Cost: ¥3,400,000、Indirect Cost: ¥1,020,000)
Fiscal Year 2021: ¥4,160,000 (Direct Cost: ¥3,200,000、Indirect Cost: ¥960,000)
Fiscal Year 2020: ¥9,490,000 (Direct Cost: ¥7,300,000、Indirect Cost: ¥2,190,000)
Keywords中分子ペプチド / 生物学的等価体 / アルケン / 非共有結合性相互作用 / β-ターン構造 / グアニン四重鎖構造 / α-ヘリックス構造 / グアニン四重鎖 / ペプチド / ペプチド結合 / 生物化学等価体 / 立体選択的合成 / アジリジン / 等価体
Outline of Research at the Start

本研究は、アルケン型ペプチド結合等価体をペプチド創薬の実践的問題に適用し、既知のアルケン型ペプチド結合等価体と併せて詳細な機能解析や構造機能相関に関する研究を行うことにより、アルケン型ペプチド結合等価体の分子特性を解明し、これら等価体の特性を活かして、テロメア領域のグアニン四重鎖構造を安定化させるがん化学療法のための短鎖ペプチド性シード化合物を創出する研究課題である。

Outline of Final Research Achievements

In order to elucidate the chemical basis and molecular properties of alkene-type dipeptide isosteres, we investigated the peptide bond mimicry of non-covalent interactions, including n-pi* interactions and hyperconjugative interactions, which are crucial for the structure formation and molecular recognitions of peptides. Our studies revealed that the steric and stereoelectronic effects derived from the substituents on the alkene moieties play an extremely important role in stabilizing the conformation of peptides, which is essential for the structure formation and molecular recognitions of peptides. Based on these findings, we successfully identified med-sized beta-turn peptides and peptidomimetics that can selectively bind to the guanine quadruplex structure.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

本研究の学術的意義は、中分子ペプチド創薬において有用なバイオイソスターであるアルケン型ペプチド結合等価体について、それぞれの等価体には化学的特徴や固有の機能があり, アルケン上の置換基が特性を決めることを明らかにした点にある。これは様々なパラドックスや活性低下が問題となっていたアルケン型ペプチド結合等価体の創薬応用において、その解決策と明確な設計指針を提供するものである。これらの知見は、中分子ペプチド創薬の加速化につながることから、社会的意義も高い。

Report

(4 results)
  • 2022 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2021 Annual Research Report
  • 2020 Annual Research Report
  • Research Products

    (36 results)

All 2022 2021 2020

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 3 results,  Open Access: 2 results) Presentation (33 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Invited: 7 results)

  • [Journal Article] Synthesis and Structural Characterization of β-Turn Mimics Containing (Z)-Chloroalkene Dipeptide Isosteres2022

    • Author(s)
      Kodama Yuki、Takeo Sayuri、Fujimoto Junko、Sato Kohei、Mase Nobuyuki、Narumi Tetsuo
    • Journal Title

      The Journal of Organic Chemistry

      Volume: 87 Issue: 5 Pages: 2167-2177

    • DOI

      10.1021/acs.joc.1c03115

    • Related Report
      2021 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Stereoselective synthesis of highly functionalized (Z)-chloroalkene dipeptide isosteres containing an α,α-disubstituted amino acid2021

    • Author(s)
      Kodama Yuki、Imai Saki、Fujimoto Junko、Sato Kohei、Mase Nobuyuki、Narumi Tetsuo
    • Journal Title

      Chemical Communications

      Volume: 57 Issue: 56 Pages: 6915-6918

    • DOI

      10.1039/d1cc02952e

    • NAID

      120007116799

    • Related Report
      2020 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Stereoselective synthesis of Gly-Gly-type (E)-methylalkene and (Z)-chloroalkene dipeptide isosteres and their application to 14-mer RGG peptidomimetics.2020

    • Author(s)
      Okita, H., Kato, Y., Masuzawa, T., Arai, K., Takeo, S., Sato, K., Mase, N., Oyoshi, T., Narumi, T.
    • Journal Title

      RSC Adv.

      Volume: 10 Issue: 49 Pages: 29373-29377

    • DOI

      10.1039/d0ra06554d

    • Related Report
      2020 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] 特殊ユビキチン鎖プローブの化学合成と応用2022

    • Author(s)
      田口佳紀, 鈴木裕務, 冨田拓哉 , 西澤拓真, 竹内伶音, 佐藤浩平, 間瀬暢之, 大竹史明, 佐伯泰, 鳴海哲夫
    • Organizer
      日本ケミカルバイオロジー学会 第16回年会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] 共役ジエンの置換基効果に基づくタウ結合性PBB化合物の高度化2022

    • Author(s)
      藤本准子、武田大、佐藤浩平、間瀬暢之、鳴海哲夫
    • Organizer
      日本ケミカルバイオロジー学会 第16回年会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] ペプチド・タンパク質の主鎖改変を基盤とする生物有機化学2022

    • Author(s)
      鳴海哲夫
    • Organizer
      創薬懇話会2022 in 名古屋
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] 光反応性向上を指向したキノリニウム型光感受性保護基の構造展開と理論的解析2022

    • Author(s)
      宮田光一、藤本准子、佐藤浩平、 間瀬暢之、野口良史、鳴海哲夫
    • Organizer
      創薬懇話会 2022 in 名古屋
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] Gly-Pro 型フルオロアルケンジペプチドイソスターの立体選択的合成とコラーゲンペプチドへの応用2022

    • Author(s)
      飯尾智裕、外山大地、佐藤浩平、 間瀬暢之、鳴海哲夫
    • Organizer
      創薬懇話会 2022 in 名古屋
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] アミド結合形成におけるベンゾトリアゾールエステルの隣接基効果に関する理論的解2022

    • Author(s)
      藤本准子、佐藤浩平、 間瀬暢之、鳴海哲夫
    • Organizer
      創薬懇話会 2022 in 名古屋
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] アルケン型ペプチド結合等価体を導入したRGGY ペプチドミメティックの合成 および構造解析2022

    • Author(s)
      竹尾沙優里、藤本准子、佐藤浩平、 間瀬暢之、鳴海哲夫
    • Organizer
      創薬懇話会 2022 in 名古屋
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] クロロアルケンジペプチドイソスターのC 末端エステルにおける加水分解反応の機構解明2022

    • Author(s)
      河原和寿、竹尾沙優里、藤本准子、佐藤浩平、 間瀬暢之、鳴海哲夫
    • Organizer
      創薬懇話会 2022 in 名古屋
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] Non-covalent interactions of (Z)-fluoroalkene dipeptide isosteres in the backbone of the collagen triple helix2022

    • Author(s)
      Chihiro Iio, Junko Fujimoto, Daichi Toyama, Kohei Sato, Nobuyuki Mase, Tetsuo Narumi
    • Organizer
      第59回ペプチド討論会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] Diastereoselective synthesis of (Z)-chloroalkene analogue of human NMUR2 selective agonist designed to prevent intramolecular acyl transfer reaction2022

    • Author(s)
      Daichi Toyama, Junko Fujimoto, Kohei Sato, Nobuyuki Mase, Kentaro Takayama, Tetsuo Narumi
    • Organizer
      第59回ペプチド討論会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] Development of helical peptidomimetics containing (Z)-chloroalkene dipeptide isostere2022

    • Author(s)
      Sayuri Takeo, Yui Suruga, Junko Fujimoto, Kohei Sato, Nobuyuki Mase, Masakazu Tanaka, Tetsuo Narumi
    • Organizer
      第59回ペプチド討論会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] Chemical synthesis of ubiquitin dimer containing Gly-Gly-type (E)-methylalkene dipeptide isosteres2022

    • Author(s)
      Kohei Watanabe, Hiromu Suzuki, Yoshinori Taguchi, Sayuri Takeo, Junko Fujimoto, Kohei Sato, Nobuyuki Mase, Tetsuo Narumi
    • Organizer
      第59回ペプチド討論会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] α,α-二置換アミノ酸を含むクロロアルケン型ペプチド結合等価体の立体選択合成とペプチドミメティックへの応用2022

    • Author(s)
      鳴海哲夫, 竹尾沙優里, 駿河唯, 今井咲, 児玉有輝, 藤本准子, 佐藤浩平, 間瀬暢之
    • Organizer
      第48回反応と合成の進歩シンポジウム
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] アルケン型ペプチド結合等価体を利用した非水解性ユビキチン鎖の化学合成と機能評価2022

    • Author(s)
      渡邉紘平, 鈴木裕務, 田口佳紀, 竹尾沙優里, 藤本准子, 佐藤浩平, 間瀬暢之, 鳴海哲夫
    • Organizer
      第48回反応と合成の進歩シンポジウム
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] ペプチド主鎖の二面角制御を指向したフルオロアルケン型コラーゲンペプチドミメティックスの合成と構造解析2022

    • Author(s)
      飯尾智裕, 藤本准子, 外山大地, 佐藤浩平, 間瀬暢之, 鳴海哲夫
    • Organizer
      第48回反応と合成の進歩シンポジウム
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] タンパク質化学合成を基盤としたユビキチン鎖プローブの創製2022

    • Author(s)
      田口佳紀, 冨田拓哉, 西澤拓真, 竹内伶音, 佐藤浩平, 間瀬暢之, 大竹史明, 佐伯泰, 鳴海哲夫
    • Organizer
      第48回反応と合成の進歩シンポジウム
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] Peptidomimetic Synthesis via Amide-to-Alkene Isosteric Switching and Beyond2022

    • Author(s)
      Tetsuo Narumi
    • Organizer
      11th Singapore International Chemical Conference (SICC-11)
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] ペプチド・タンパク質の主鎖改変を基盤とするケミカルバイオロジー2022

    • Author(s)
      鳴海哲夫
    • Organizer
      東京医科歯科大学生体材料工学研究所第243回 IBBセミナー/第28回創薬学領域セミナー
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] アミド-アルケンの等価置換における隣接基効果: C末端エステルの加水分解反応の速度論的解析2022

    • Author(s)
      河原 和寿、竹尾 沙優里、藤本 准子、佐藤 浩平、間瀬 暢之、鳴海 哲夫
    • Organizer
      日本薬学会第142年会(名古屋)
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Presentation] クロロアルケンジペプチドイソスター含有β-ターンミミックの立体選択的合成と構造解析2022

    • Author(s)
      竹尾 沙優里、児玉 有輝、佐藤 浩平、間瀬 暢之、鳴海 哲夫
    • Organizer
      日本薬学会第142年会(名古屋)
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Presentation] アルケン型ペプチド結合等価体によるペプチドの二次構造制御2022

    • Author(s)
      鳴海哲夫
    • Organizer
      日本薬学会第142年会(名古屋)
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] グアニン四重鎖構造を標的としたRGGペプチドライブラリの構築および結合性評価2021

    • Author(s)
      竹尾沙優里, 田畑舞子, 加藤由奈, 児玉有輝, 佐藤浩平, 間瀬暢之, 大吉崇文, 鳴海哲夫
    • Organizer
      創薬懇話会2021 in 京都
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Presentation] ペプチド創薬:理論・設計・合成2021

    • Author(s)
      鳴海哲夫
    • Organizer
      近畿大学薬学部 医薬品化学研究室 公開セミナー
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] IDENTIFICATION OF G4-BINIDING PEPTIDE MOLECULES FROM THE RGG3 DOMAIN OF TRANSLOCATED IN LIPOSARCOMA/FUSED IN SARCOMA2021

    • Author(s)
      Sayuri Takeo, Maiko Tabata, Yuki Kodama, Kohei Sato, Nobuyuki Mase, Takanori Oyoshi, Tetsuo Narumi
    • Organizer
      第58回ペプチド討論会
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Presentation] SYNTHESIS AND STRUCTURAL CHARACTERIZATION OF β-TURN MIMICS CONTAINING (Z)-CHLOROALKENE DIPEPTIDE ISOSTERES2021

    • Author(s)
      Yuki Kodama, Junko Fujimoto, Kohei Sato, Nobuyuki Mase, Kentaro Takayama, and Tetsuo Narumi
    • Organizer
      第58回ペプチド討論会
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Presentation] RGGペプチドライブラリの構築とグアニン四重鎖結合性ペプチドの探索2021

    • Author(s)
      竹尾沙優里, 田畑舞子, 児玉有輝, 佐藤浩平, 間瀬暢之, 大吉崇文, 鳴海哲夫
    • Organizer
      日本病院薬剤師会東海ブロック・日本薬学会東海支部 合同学術大会2021
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Presentation] ペプチド・タンパク質のバックボーンケミストリー2021

    • Author(s)
      鳴海哲夫
    • Organizer
      第15回超領域研究会/第3回静岡県三大学連携シンポジウム
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] 2型ニューロメジンU受容体選択的ペプチドアゴニストの分子内アシル転位反応の速度論的評価2021

    • Author(s)
      外山 大地、新井 康介、佐藤 浩平、間瀬 暢之、高山 健太郎、鳴海 哲夫
    • Organizer
      日本薬学会第141回年会(広島)
    • Related Report
      2020 Annual Research Report
  • [Presentation] α,α-二置換アミノ酸含有クロロアルケン型ペプチド結合等価体の高ジアステレオ選択的合成法の開発2021

    • Author(s)
      児玉有輝, 今井咲, 佐藤浩平, 間瀬暢之, 鳴海哲夫
    • Organizer
      創薬懇話会2021 in 京都
    • Related Report
      2020 Annual Research Report
  • [Presentation] DIASTEREOSELECTIVE SYNTHESIS OF A HIGHLY FUNCTIONALIZED (Z)-CHLOROALKENE DIPEPTIDE ISOSTERE OF LEU-DAP DIPEPTIDE2021

    • Author(s)
      Daichi Toyama, Yuki Kodama, Junko Fujimoto, Kohei Sato, Nobuyuki Mase, Kentaro Takayama, and Tetsuo Narumi
    • Organizer
      第58回ペプチド討論会
    • Related Report
      2020 Annual Research Report
  • [Presentation] Stereoselective Synthesis of α,α-Disubstituted Amino Acid-Containing (Z)-Chloroalkene Dipeptide Isosteres2021

    • Author(s)
      Yuki Kodama, Saki Imai, Junko Fujimoto, Kohei Sato, Nobuyuki Mase, and Tetsuo Narumi
    • Organizer
      AIMECS 2021. 13th AFMC INTERNATIONAL MEDICINAL CHEMISTRY SYMPOSIUM.
    • Related Report
      2020 Annual Research Report
  • [Presentation] ペプチドと分子科学で何ができるか-創薬や医療におけるモダリティ分子としての可能性-2020

    • Author(s)
      鳴海哲夫
    • Organizer
      浜松医科大学大学院特別講義
    • Related Report
      2020 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] Noncovalent interactions in the chloroalkene-type RGG peptidomimetics stabilize the beta-turn structure2020

    • Author(s)
      Tetsuo Narumi, Yuki Kodama, Yuna Kato, Kosuke Arai, Sayuri Takeo, Tatsuki Masuzawa, Kohei Sato, Nobuyuki Mase, Takanori Oyoshi
    • Organizer
      The 57th Japanese Peptide Symposium
    • Related Report
      2020 Annual Research Report

URL: 

Published: 2020-04-28   Modified: 2024-01-30  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi