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Development of non-random genome editing technology for therapeutic applications

Research Project

Project/Area Number 20H03442
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

Allocation TypeSingle-year Grants
Section一般
Review Section Basic Section 48040:Medical biochemistry-related
Research InstitutionTokyo Metropolitan Institute of Medical Science

Principal Investigator

MIYAOKA Yuichiro  公益財団法人東京都医学総合研究所, 疾患制御研究分野, プロジェクトリーダー (20549521)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 加藤 朋子  公益財団法人東京都医学総合研究所, 疾患制御研究分野, 研究員 (10638802)
高橋 剛  公益財団法人東京都医学総合研究所, 疾患制御研究分野, 研究員 (70802817)
Project Period (FY) 2020-04-01 – 2023-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2022)
Budget Amount *help
¥17,680,000 (Direct Cost: ¥13,600,000、Indirect Cost: ¥4,080,000)
Fiscal Year 2022: ¥5,980,000 (Direct Cost: ¥4,600,000、Indirect Cost: ¥1,380,000)
Fiscal Year 2021: ¥5,070,000 (Direct Cost: ¥3,900,000、Indirect Cost: ¥1,170,000)
Fiscal Year 2020: ¥6,630,000 (Direct Cost: ¥5,100,000、Indirect Cost: ¥1,530,000)
Keywordsゲノム編集 / Cas9 / Cas12a / HDR / NHEJ / HR / 欠失導入 / DNA組換え
Outline of Research at the Start

遺伝情報であるDNAを、人を含むあらゆる生物種で操作できるゲノム編集には、医療応用に向けて大きな期待が寄せられている。しかしその実現には、標的配列を常に狙い通りに改変できる、高い再現性が必要である。しかし日進月歩の技術革新をもってしても、未だ目的のDNA配列改変のみが得られるゲノム編集技術は存在しない。そこで私達は、[1] ゲノム中の不要な配列を除去できる欠失と、[2] 望む配列を持つDNAとゲノムDNAを高い効率で組換える技術を開発する。さらに、本研究をゲノム編集の幅広い医療応用への新たな架け橋とするために、患者由来iPS細胞とモデルマウスを用いて、筋ジストロフィー治療を実施する。

Outline of Final Research Achievements

CRISPR-Cas is the major genome editing tool that uses guide RNA (gRNA) to direct Cas nucleases to target sites to edit the genome. However, to achieve reproducible genome editing outcomes at target sites without random mutations remains one of the biggest challenges to apply genome editing to therapeutic purposes. In this study, we found two approaches to enhance the reproducibility of genome editing. One is to utilize two Cas12a molecules to induce dual cleavage to induce precise deletions. The other is to enhance genome editing mediated by DNA recombination by identification of enhancing factors of DNA recombination for genome editing.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

ゲノム編集は、DNA配列の改変という基本的に同一の反応を介して、全ての遺伝性疾患への究極の治療法となる可能性を持つ。しかし、ゲノム中の標的とする部分以外のDNAを不必要に変化させない正確さが重要である。本研究では、標的とするDNA配列において、ゲノム編集によって生じるランダムな改変を抑え、設計通りの編集を起こすためにより優れた条件を同定したため、ゲノム編集の医療応用に貢献する可能性がある。

Report

(4 results)
  • 2022 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2021 Annual Research Report
  • 2020 Annual Research Report
  • Research Products

    (33 results)

All 2023 2022 2021 2020 Other

All Int'l Joint Research (3 results) Journal Article (8 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results,  Peer Reviewed: 6 results,  Open Access: 7 results) Presentation (18 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Invited: 2 results) Book (2 results) Remarks (2 results)

  • [Int'l Joint Research] University of California, San Francisco/Harvard University/National Institute of Health(米国)

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    • Author(s)
      Nakajima Ittetsu、Tsukimura Takahiro、Ono Terumi、Shiga Tomoko、Shitara Hiroshi、Togawa Tadayasu、Sakuraba Hitoshi、Miyaoka Yuichiro
    • Journal Title

      Cell Transplantation

      Volume: 32 Pages: 1-11

    • DOI

      10.1177/09636897231173734

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    • Author(s)
      de Majo Martina、Koontz Mark、Marsan Elise、Salinas Nir、Ramsey Arren、Kuo Yien-Ming、Seo Kyounghee、Li Huinan、Drager Nina、Leng Kun、Gonzales Santiago L.、Kurnellas Michael、Miyaoka Yuichiro、Klim Joseph R.、Kampmann Martin、Ward Michael E.、Huang Eric J.、Ullian Erik M.
    • Journal Title

      Stem Cell Reports

      Volume: 18 Issue: 3 Pages: 706-719

    • DOI

      10.1016/j.stemcr.2023.01.012

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  • [Journal Article] Genome editing is induced in a binary manner in single human cells2022

    • Author(s)
      Takahashi Gou、Kondo Daiki、Maeda Minato、Morishita Yuji、Miyaoka Yuichiro
    • Journal Title

      iScience

      Volume: 25 Issue: 12 Pages: 105619-105619

    • DOI

      10.1016/j.isci.2022.105619

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    • Author(s)
      Song Dan、Takahashi Gou、Zheng Yun-Wen、Matsuo-Takasaki Mami、Li Jingyue、Takami Miho、An Yuri、Hemmi Yasuko、Miharada Natsumi、Fujioka Tsuyoshi、Noguchi Michiya、Nakajima Takashi、Saito Megumu K、Nakamura Yukio、Oda Tatsuya、Miyaoka Yuichiro、Hayashi Yohei
    • Journal Title

      Human Molecular Genetics

      Volume: 31 Issue: 21 Pages: 3652-3671

    • DOI

      10.1093/hmg/ddac080

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    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Genome Editing Is Induced in a Binary Manner in Single Human Cells2022

    • Author(s)
      Takahashi Gou、Kondo Daiki、Maeda Minato、Morishita Yuji、Miyaoka Yuichiro
    • Journal Title

      bioRxiv

      Volume: -

    • DOI

      10.1101/2022.03.04.482947

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    • Author(s)
      Fenix AM, Miyaoka Y, Bertero A, Blue SM, Spindler MJ, Tan KKB, Perez-Bermejo JA, Chan AH, Mayerl SJ, Nguyen TD, Russell CR, Lizarraga PP, Truong A, So PL, Kulkarni A, Chetal K, Sathe S, Sniadecki NJ, Yeo GW, Murry CE, Conklin BR, Salomonis N.
    • Journal Title

      Nature Communications

      Volume: 12 Issue: 1 Pages: 6324-6324

    • DOI

      10.1038/s41467-021-26623-y

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  • [Journal Article] CRISPR-Cas9とその医療応用2021

    • Author(s)
      中島 一徹、宮岡 佑一郎
    • Journal Title

      臨床免疫・アレルギー科

      Volume: 76 Pages: 437-442

    • NAID

      40022718383

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      Watry Hannah L.、Feliciano Carissa M.、Gjoni Ketrin、Takahashi Gou、Miyaoka Yuichiro、Conklin Bruce R.、Judge Luke M.
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 10 Issue: 1 Pages: 14896-14896

    • DOI

      10.1038/s41598-020-71742-z

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  • [Presentation] Genome editing is induced in a binary manner in single human cells.2022

    • Author(s)
      Takahashi G, Kondo D, Maeda M, Morishita Y, Miyaoka Y
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      林 洋平、宋 丹、高橋 剛、宮岡 佑一郎
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  • [Presentation] 高精度改変型Cas9によるHDR亢進因子の探索2022

    • Author(s)
      小野 輝美、加藤 朋子、宮岡 佑一郎
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  • [Presentation] ヒト1細胞中でゲノム編集は同時多発的に誘導される2022

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      高橋 剛、近藤 大輝、前田 湊、森下 祐至、宮岡 佑一郎
    • Organizer
      日本ゲノム編集学会第7回大会
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  • [Presentation] CRISPR-Cas9による相同組換え修復(HDR)を亢進する因子の探索2022

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      加藤 朋子、宮岡 佑一郎
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      日本ゲノム編集学会第7回大会
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  • [Presentation] iPS細胞でのゲノム編集技術応用2022

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      宮岡 佑一郎
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      第21回日本再生医療学会総会
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    • Organizer
      Cold Spring Harbor-Asia, Liver Development, Metabolism, Disease & Cancer Meeting
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  • [Presentation] On-chip SPiSによる1細胞レベルゲノム編集結果解析2021

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      近藤 大輝、高橋 剛、森下 祐至、宮岡 佑一郎
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      高橋 剛、森 秀人、石黒 宗、谷内江 望、宮岡 佑一郎
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      日本ゲノム編集学会第6回大会
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      近藤 大輝、高橋 剛、森下 祐至、宮岡 佑一郎
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      落合 弘光、高橋 剛、張 了了、福村 啓文、下井 岳、亀山 祐一、松島 芳文、和田 健太
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      第68回日本実験動物学会総会
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      宮岡 佑一郎
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  • [Presentation] Genome editing outcomes induced by CRISPR/Cas9 in single cells2020

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      近藤 大輝、高橋 剛、森下 祐至、宮岡 佑一郎
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  • [Presentation] Immunodeficient Mouse Model of Fabry Disease for Development of New Cell Therapy2020

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    • Author(s)
      宮岡 佑一郎 他著者40名
    • Total Pages
      315
    • Publisher
      情報機構
    • ISBN
      9784865022421
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      執筆者:96名(分担執筆者:宮岡 佑一郎)、技術情報協会
    • Total Pages
      602
    • Publisher
      技術情報協会
    • ISBN
      9784861048272
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  • [Remarks] 公益財団法人東京都医学総合研究所 再生医療プロジェクト ウェブサイト

    • URL

      https://www.igakuken-regmed.com/

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    • URL

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Published: 2020-04-28   Modified: 2024-01-30  

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