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Prediction of periodontal disease progression by a mathematical model

Research Project

Project/Area Number 20H03864
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

Allocation TypeSingle-year Grants
Section一般
Review Section Basic Section 57030:Conservative dentistry-related
Research InstitutionOsaka University

Principal Investigator

Fujihara Chiharu  大阪大学, 大学院歯学研究科, 助教 (00755358)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 岡田 眞里子  大阪大学, 蛋白質研究所, 教授 (10342833)
三木 康史  大阪大学, 歯学部附属病院, 助教 (10598395)
柏木 陽一郎  大阪大学, 大学院歯学研究科, 助教 (20598396)
村上 伸也  大阪大学, 大学院歯学研究科, 教授 (70239490)
Project Period (FY) 2020-04-01 – 2023-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2022)
Budget Amount *help
¥17,550,000 (Direct Cost: ¥13,500,000、Indirect Cost: ¥4,050,000)
Fiscal Year 2022: ¥5,460,000 (Direct Cost: ¥4,200,000、Indirect Cost: ¥1,260,000)
Fiscal Year 2021: ¥5,200,000 (Direct Cost: ¥4,000,000、Indirect Cost: ¥1,200,000)
Fiscal Year 2020: ¥6,890,000 (Direct Cost: ¥5,300,000、Indirect Cost: ¥1,590,000)
Keywords歯周病重症化予測 / RNAシークエンス / マイクロバイオーム / マウスモデル / 数理モデル / 歯周病 / 細菌叢解析 / 歯槽骨吸収 / オミクス解析 / 歯周病進行経路 / 重症化予測 / オミックス解析 / マウス歯周病細菌叢 / 遺伝子発現解析
Outline of Research at the Start

歯周病は歯の喪失を招く第一の原因である。そのため、歯周病の進行を予測し、早期に介入することが、人々の健康増進や生活の質の維持には重要である。しかしながら、歯周病の重症化の病態は個人によって異なり、同疾患を正確に予測することは困難である。そこで、本研究では、歯周病進行の経路を数理モデル化することで歯周病重症化の病態解明及び歯周病の重症化を予測する診断技術開発の基盤を構築することを目的として研究を行う。

Outline of Final Research Achievements

We performed microbiome analysis and RNA sequencing analysis using gingival tissue during the progression of periodontal disease in mice and identified pathways specific to periodontal disease progression at the bacterial and molecular levels. We then developed a mathematical model of the interaction between the identified molecules and bacteria. Furthermore, by analyzing the mathematical model, we identified the factors that significantly influence the alveolar bone integrity in periodontal disease at the systems level. As a result, we predicted that molecules involved in monocyte migration and bacterial infection would affect alveolar bone resorption. We further validated the predictions by in vivo experiments. This study demonstrated that the mathematical model is useful for the development of prognosis and diagnosis of periodontal disease progression.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

歯周病は歯の喪失を招く第一の原因である。そのため、歯周病が重症化するのを予測・予防することが、人々の健康増進やQOLの維持には重要である。しかしながら、歯周病の重症化を正確に予測する実用的な診断技術は未だ開発されていない。そこで本研究では、歯周病の重症化を制御している細菌や遺伝子発現変化のダイナミクスをシステムレベルで捉えるために、システムバイオロジーの解析法を取り入れて歯周病重症化を予測する技術開発の基盤となる研究を実施した。本研究で構築されたモデルは、ヒト検体を用いて改良することで、個々の歯周病患者の重症化を予測することが可能となり、歯周病の個別化医療の実現に繋がることが期待される。

Report

(4 results)
  • 2022 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2021 Annual Research Report
  • 2020 Annual Research Report
  • Research Products

    (13 results)

All 2023 2022 2021 2020 Other

All Int'l Joint Research (3 results) Journal Article (4 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 3 results,  Open Access: 2 results) Presentation (6 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Invited: 1 results)

  • [Int'l Joint Research] Imperial College London(英国)

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  • [Int'l Joint Research] Srinakharinwirot University(タイ)

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  • [Int'l Joint Research] Imperial College London(英国)

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  • [Journal Article] Lysosomal acid lipase regulates bioenergetic process during the cytodifferentiation of human periodontal ligament cells2023

    • Author(s)
      Teerachate Nantakeeratipat, Chiharu Fujihara, Takuto Nogimori, Masahiro Matsumoto, Takuya Yamamoto, Shinya Murakami
    • Journal Title

      Biochemical and Biophysical Research Communications

      Volume: 662 Pages: 84-92

    • DOI

      10.1016/j.bbrc.2023.04.041

    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Lipase-a single-nucleotide polymorphism rs143793106 is associated with increased risk of aggressive periodontitis by negative influence on the cytodifferentiation of human periodontal ligament cells2022

    • Author(s)
      Masahiro Matsumoto, Chiharu Fujihara, Teerachate Nantakeeratipa, Jirouta Kitagaki, Yu Yamamoto, Satoru Yamada, Masahiro Kitamura, Shinya Murakami
    • Journal Title

      Journal of Periodontal Research

      Volume: 00 Issue: 1 Pages: 1-9

    • DOI

      10.1111/jre.13079

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      2022 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Energy metabolism in osteogenic differentiation and reprogramming: A strategy for periodontal regeneration.2022

    • Author(s)
      C Fujihara, T Nantakeeratipat, S Murakami
    • Journal Title

      Front Dent Med

      Volume: 3 Pages: 815140-815140

    • DOI

      10.3389/fdmed.2022.815140

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      2021 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] 歯周病新分類の解釈とその応用2021

    • Author(s)
      村上伸也、藤原千春、岩山智明
    • Journal Title

      日本臨床歯周病学会会誌

      Volume: 39(2) Pages: 20-26

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  • [Presentation] 数理モデルを用いた歯周病重症化の病因解明2022

    • Author(s)
      藤原 千春、Teerachate Nantakeeratipat, 井元 宏明、岡田 眞里子、村上 伸也
    • Organizer
      第43回日本炎症・再生医学会
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  • [Presentation] 数理モデルを用いた歯周病進行の病態理解2022

    • Author(s)
      藤原千春、村上伸也
    • Organizer
      第40回日本骨代謝学会学術集会
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  • [Presentation] 歯周病における歯槽骨吸収に影響を及ぼす要因の検討2022

    • Author(s)
      藤原千春、村上伸也
    • Organizer
      第157回日本歯科保存学会学術大会秋季大会
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      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] Elucidation of pathogenesis of periodontal disease using a mathematical modeling2021

    • Author(s)
      Chiharu Fujihara
    • Organizer
      the 2nd Ankara-Osaka University Dental Workshop
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    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] オミクス解析を用いた歯周病による組織破壊機構の理解2020

    • Author(s)
      藤原 千春, Teerachate Nantakeeratipat, Wibisana, Johannes Nicolaus, 飯田 渓太, 井元 宏明, 岡田 眞里子、村上伸也
    • Organizer
      第43回日本分子生物学会
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      2020 Annual Research Report
  • [Presentation] Building a mathematical model of periodontal disease2020

    • Author(s)
      Teerachate Nantakeeratipat, Chiharu Fujihara, Johannes Nicolaus Wibisana, Hiroaki Imoto, Keita Iida, Mariko Okada and Shinya Murakami
    • Organizer
      第43回日本分子生物学会
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      2020 Annual Research Report

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Published: 2020-04-28   Modified: 2024-01-30  

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