Developmental study for nucleic acid profile from sample of mixture of body fluid.
| Project/Area Number |
20H03956
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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| Allocation Type | Single-year Grants |
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| Section | 一般 |
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| Review Section |
Basic Section 58040:Forensics medicine-related
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| Research Institution | Kyoto University |
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Principal Investigator |
Tamaki Keiji 京都大学, 医学研究科, 教授 (90217175)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
眞鍋 翔 関西医科大学, 医学部, 助教 (00794661)
橋谷田 真樹 関西医科大学, 医学部, 准教授 (40374938)
山田 亮 京都大学, 医学研究科, 教授 (50301106)
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| Project Period (FY) |
2020-04-01 – 2023-03-31
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| Project Status |
Completed (Fiscal Year 2022)
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| Budget Amount *help |
¥16,640,000 (Direct Cost: ¥12,800,000、Indirect Cost: ¥3,840,000)
Fiscal Year 2022: ¥4,940,000 (Direct Cost: ¥3,800,000、Indirect Cost: ¥1,140,000)
Fiscal Year 2021: ¥5,330,000 (Direct Cost: ¥4,100,000、Indirect Cost: ¥1,230,000)
Fiscal Year 2020: ¥6,370,000 (Direct Cost: ¥4,900,000、Indirect Cost: ¥1,470,000)
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| Keywords | DNA / 混合資料 / 個人識別 / 体液識別 / 混合試料 |
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| Outline of Research at the Start |
われわれは混合試料のDNA型の推定法、miRNAによる体液識別法を開発しているが、本研究では現場試料からDNAとRNAを抽出して、同時に「誰のDNA」だけでなく、「何の（体液）試料」の観点を探るだけでなく、新たにRNAやDNAの陳旧性を推定する方法を開発する。これらの3つの結果をネットワーク学習系などのAI手法によって確率的解釈に結び付けるシステムを作成する。判定法は最終的に次世代シーケンシングによる分析を目標とする。混合試料からその犯行様態などが捉えられるような高精度の核酸情報プロファイルが構築できる方法を確立したい。
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| Outline of Final Research Achievements |
We attempted to develop a more efficient DNA analysis method for samples such as bloodstains left at crime scenes. First, we examined the detection thresholds (AT and ST values) of a DNA testing system (GlobalFiler), which has recently been introduced into forensic practice in Japan. Then, we significantly improved the mixed sample analysis software (Kongoh) with developer validation. We also developed a discrimination method between semen and blood or saliva using the different methylation rates of exons of the gene (dishevelled binding antagonist of beta catenin 1, DACT1) in different body fluids. The amount of semen-derived DNA could be estimated in mixed samples of different body fluids. In addition, deamination of cytosine with age was observed in the aged samples of blood and saliva by the Sanger sequencing method.
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| Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements |
本研究は犯罪現場などの微量混合試料の分析について、３つの「誰の」「何の」「いつ頃の」DNA試料であるか分析を進める方法を開発しようとするもので、従前の研究とは一線を画する独自性の高い研究といえる。このうち、「誰の」試料であるかについて、われわれの開発したソフトウェアは開発者検証が終わって実務応用が行われており、その社会的意義は高い。また、「何の」資料かといった由来を推定することは、試料の遺留様態を推定したり、えん罪を防ぐ大きな意義があるといえる。さらに、今回は成果が得られなかったが試料の陳旧性を探るための研究は、現場資料に大きな付加価値情報を与えるものとして期待されると考えている。
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Report
(4 results)
Research Products
(18 results)
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[Presentation] GlobalFiler kit に対応した混合試料解析ソフトウェアの検証2021
Author(s)
眞鍋 翔, 深川貴志, 藤井宏治, 水野なつ子, 関口和正, 玉木敬二, 大林将弘, 榎本祐子, 松本智寛, 橋谷田真樹, 赤根 敦
Organizer
第105次日本法医学会学術全国集会
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