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合成糖鎖の代謝取り込みを利用した好熱性古細菌における翻訳後修飾糖鎖の機能解析

Research Project

Project/Area Number 20J20284
Research Category

Grant-in-Aid for JSPS Fellows

Allocation TypeSingle-year Grants
Section国内
Review Section Basic Section 37020:Chemistry and chemical methodology of biomolecules-related
Research InstitutionOsaka University

Principal Investigator

平尾 宏太郎  大阪大学, 理学研究科, 特別研究員(DC1)

Project Period (FY) 2020-04-24 – 2023-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2022)
Budget Amount *help
¥2,500,000 (Direct Cost: ¥2,500,000)
Fiscal Year 2022: ¥800,000 (Direct Cost: ¥800,000)
Fiscal Year 2021: ¥800,000 (Direct Cost: ¥800,000)
Fiscal Year 2020: ¥900,000 (Direct Cost: ¥900,000)
Keywordsリン酸化 / グリコシル化 / イノシトール / N-グリカン / 超好熱菌 / 好熱性古細菌
Outline of Research at the Start

好熱性古細菌Termococcus kodakarensisのN-グリカンの機能解明に向けて,始めにN-グリカンの全合成に着手する.合成したN-グリカンの還元末端のリン酸化および,すでに合成済みのドリコールとのカップリングを経て糖転移前駆体を得る.得られた糖鎖前駆体を用いて,合成糖鎖の生合成系への代謝取り込みを利用した生細胞系での機能解析を行う.これにより,N-グリカンの機能発現の分子基盤を解明し,原始的な生物である好熱性古細菌において,糖鎖が耐熱性獲得果たす役割を明らかにすることで,糖鎖の普遍的な機能に迫る.

Outline of Annual Research Achievements

N結合型糖鎖(N-グリカン)は,タンパク質のアスパラギン側鎖に結合した翻訳後修飾糖鎖で,多くの生物に普遍的に存在し,様々な生命現象に関与する.本研究では,超好熱性古細菌 Thermococcus kodakarensisに着目し,そのN-グリカンの耐熱性への寄与を合成化学的なアプローチによって迫ることを目的とした.
昨年度までに,合成N-グリカンを用いた構造解析の結果から,T. kodakarensisのN-グリカンの構成糖であるmyo-イノシトールリン酸の立体化学がL-myo-イノシトール-1-リン酸であることが示唆された.本年度は,L-myo-イノシトール-1-リン酸を有するN-グリカンを合成を達成した.さらに,NMR解析により,この合成糖鎖が単離糖鎖と良い相同性を示し,myo-イノシトール-1-リン酸の立体化学をL-myo-イノシトール-1-リン酸と確定した.本研究はT. kodakarensisのN-グリカンを天然構造に限らず,非天然構造,標識糖鎖の合成を供給できるため,糖鎖の耐熱性への寄与を,糖鎖構造に基づいて解析することを可能とする.
糖鎖の機能を解析するためには,タンパク質との複合化が鍵となる.本研究では,T. kodakarensisの糖鎖生合成経路に着目し,合成糖鎖を代謝的に取り込ませることで生体内で糖鎖とタンパク質との複合化を計画した.ドリコールリン酸GalNAcはN-グリカンの生合成初期段階の中間体であり,N-アセチル部分へアジド基を導入することでプローブ化した生合成中間体を設計した.その合成では,亜リン酸化GalNに対し,ドリコールとのカップリング後,アジド基を導入し,達成した.本プローブ化糖脂質は,生細胞へ代謝的に取り込ませることでN-グリカンの生合成へ干渉し,合成糖鎖のタンパク質への付加を可能とする.

Research Progress Status

令和4年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

令和4年度が最終年度であるため、記入しない。

Report

(3 results)
  • 2022 Annual Research Report
  • 2021 Annual Research Report
  • 2020 Annual Research Report
  • Research Products

    (14 results)

All 2023 2022 2021 2020

All Journal Article (3 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 3 results) Presentation (11 results)

  • [Journal Article] Structural Determination and Chemical Synthesis of the <i>N</i> ‐Glycan from the Hyperthermophilic Archaeon <i>Thermococcus kodakarensis</i>2023

    • Author(s)
      Hirao Kohtaro、Speciale Immacolata、Notaro Anna、Manabe Yoshiyuki、Teramoto Yoshiaki、Sato Takaaki、Atomi Haruyuki、Molinaro Antonio、Ueda Yoshihiro、De Castro Cristina、Fukase Koichi
    • Journal Title

      Angewandte Chemie International Edition

      Volume: 62 Issue: 13

    • DOI

      10.1002/anie.202218655

    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Mechanistic Studies for the Rational Design of Multivalent Glycodendrimers2022

    • Author(s)
      Manabe Yoshiyuki、Tsutsui Masato、Hirao Kohtaro、Kobayashi Risako、Inaba Hiroshi、Matsuura Kazunori、Yoshidome Daisuke、Kabayama Kazuya、Fukase Koichi
    • Journal Title

      Chemistry- A European Journal

      Volume: 28 Issue: 61

    • DOI

      10.1002/chem.202201848

    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Total Syntheses of C60- and C100-Dolichols2020

    • Author(s)
      Hirao Kohtaro、Ono Risako、Manabe Yoshiyuki、Masui Seiji、Atomi Haruyuki、Fukase Koichi
    • Journal Title

      The Journal of Organic Chemistry

      Volume: 85 Issue: 17 Pages: 11549-11559

    • DOI

      10.1021/acs.joc.0c01327

    • Related Report
      2020 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Posttranslational glycan modification in Thermococcus kodakarensis: discovery and synthesis of myo-inositol containing N-glycan2023

    • Author(s)
      ○ Kohtaro Hirao・Yoshiyuki Manabe・Immacolata Speciale・Anna Notaro・Haruyuki Atomi・Antonio Molinaro・ Cristina De Castro・Koichi Fukase
    • Organizer
      第3回大津会議合同研究発表会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] Posttranslational glycan modification in Thermococcus kodakarensis: discovery and synthesis of myo-inositol containing N-glycan2023

    • Author(s)
      ○平尾宏太郎 ,真鍋良幸 ,深瀬浩一
    • Organizer
      第103回日本化学会春季年会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] 超好熱性古細菌Thermococcus kodakarensis由来N-グリカン:高度グリコシル化イノシトール 含有糖鎖の構造決定と合成2022

    • Author(s)
      ○平尾宏太郎,真鍋良幸,跡見晴幸,Antonio Molinaro,Cristina De Castro,深瀬浩一
    • Organizer
      第22回関西グライコサイエンスフォーラム
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] 超好熱性古細菌 Thermococcus kodakarensis 由来 N- グリカンの合成2022

    • Author(s)
      ○平尾宏太郎 ,真鍋良幸 ,深瀬浩一
    • Organizer
      第42回有機合成若手セミナー 第103回日本化学会春季年会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] 超好熱性古細菌Thermococcus kodakarensis由来N-グリカンの単離・合成・機能研究2022

    • Author(s)
      〇平尾宏太郎,真鍋良幸,Immacolata Speciale, Anna Notaro,佐藤喬章,跡見晴幸,Antonio Molinaro,Cristina De Castro,深瀬浩一
    • Organizer
      第64回天然有機化合物討論会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] Study of N-glycan from thermophilic archaeon, Thermocossus kodakarensis: isolation, structural determination, and synthesis2022

    • Author(s)
      ○ Kohtaro Hirao・Yoshiyuki Manabe・Immacolata Speciale・Anna Notaro・Haruyuki Atomi・Antonio Molinaro・Cristina De Castro・Koichi Fukase
    • Organizer
      30th International Carbohydrate symposium
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] 翻訳後マンノース修飾に迫る蛍光標識ドリコールリン酸マンノー スの合成2022

    • Author(s)
      ○平尾 宏太郎 ,真鍋 良幸,樺山 一哉,深瀬 浩一
    • Organizer
      第102回 日本化学会春季年会
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Presentation] 超好熱性古細菌 Thermococcus kodakarensis 由 来 N-グリカンの合成2021

    • Author(s)
      ○平尾宏太郎 ,真鍋良幸 ,跡見晴幸 ,Antonio Molinaro,Cristina De Castro,深瀬 浩一
    • Organizer
      第11回CSJ化学フェスタ
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Presentation] 超好熱菌Thermococcus kodakarensis由来N-グリカンの単離・構造決定およびその合成2021

    • Author(s)
      ○平尾宏太郎,真鍋良幸,跡見晴幸,Antonio Molinaro,Cristina De Castro,深瀬浩一
    • Organizer
      第 40 回 日本糖質学会年会
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Presentation] Synthetic study of N-glycan from Thermococcus kodakarensis2021

    • Author(s)
      Kohtaro Hirao
    • Organizer
      第11回大津会議
    • Related Report
      2020 Annual Research Report
  • [Presentation] Synthetic study of N-glycan from hyperthermophilic archaeon Thermococcus kodakarensis2021

    • Author(s)
      ○K. Hirao, Y. Manabe, I. Speciale, H. Atomi, A. Molinaro, C. De, Castro. K. Fukase
    • Organizer
      The 101st CSJ Annual Meeting (2021) Online Meeting
    • Related Report
      2020 Annual Research Report

URL: 

Published: 2020-07-07   Modified: 2024-03-26  

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