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酵母プリオンタンパク質Sup35の線維化を制御する新規添加剤の開発

Research Project

Project/Area Number 20J21732
Research Category

Grant-in-Aid for JSPS Fellows

Allocation TypeSingle-year Grants
Section国内
Review Section Basic Section 43040:Biophysics-related
Research InstitutionUniversity of Tsukuba

Principal Investigator

西奈美 卓  筑波大学, 理工情報生命学術院, 特別研究員(DC1)

Project Period (FY) 2020-04-24 – 2023-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2022)
Budget Amount *help
¥3,400,000 (Direct Cost: ¥3,400,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,100,000 (Direct Cost: ¥1,100,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,100,000 (Direct Cost: ¥1,100,000)
Fiscal Year 2020: ¥1,200,000 (Direct Cost: ¥1,200,000)
Keywordsタンパク質 / 添加剤 / 液-液相分離 / アミロイド / プリオン / 天然変性タンパク質 / プリオンタンパク質 / Sup35 / 溶媒効果 / 膜のないオルガネラ / ゲル
Outline of Research at the Start

本研究では、プリオンやプリオン様タンパク質の生理学的役割および神経変性疾患の機構を明らかにし、その制御法を確立することを目指している。実験では、主に酵母プリオンSup35を用い、アミロイド化の中間状態として液-液相分離した液滴という状態を新たに仮定し、液滴形成の分子機構およびアミロイド化との関係性を詳しく調べる。さらに、細胞内の夾雑環境下を模倣した共溶質を用い、プリオンの液滴やアミロイドに与える影響を体系的に解析することで、共溶質を用いたプリオンの新たな制御法を確立する。これにより、細胞内に豊富に存在する共溶質の生理学的な役割についても、理解が深まることが期待される。

Outline of Annual Research Achievements

タンパク質の液-液相分離やアミロイドの形成は、生物学的な機能や疾患に関わるとされている。一方、そのメカニズムや制御法は確立されていない。本研究では、タンパク質の液滴やアミロイドおよび凝集の溶液状態の理解を深めるため、タンパク質の構造の安定化剤や凝集抑制剤としてこれまで開発されてきた添加剤が、液滴の安定性やアミロイドへの成熟に与える効果について、酵母プリオンタンパク質Sup35のN末端側の天然変性領域を対象に調べた。変性剤や塩、オスモライト、糖、ポリオール、アミノ酸、アミン化合物、ヘキサンジオール、高分子などの特徴の異なる添加剤を系統的に調べ、液滴やアミロイドの形成に影響するメカニズムを調査した。タンパク質の凝集抑制剤として知られる変性剤やカオトロープは、液滴に対しても抑制する効果を示すことが分かった。タンパク質の凝集を促進する糖やポリオールは、反対に液滴を抑制することが分かった。また、オスモライトの中には凝集と液滴を促進するものがあることが分かった。高分子電解質は、添加濃度に伴い液滴の形成を抑制・促進する効果が観察され、官能基の性質によって液滴からアミロイドの成熟を促進する効果と抑制する効果があることが分かった。一連の結果は、水溶液中でのタンパク質の集合体に関わる相互作用と、凝集と液滴の安定化機構の違いを示唆する結果であり、タンパク質以外の成分がタンパク質の溶液状態に与える影響について洞察を与えた。

Research Progress Status

令和4年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

令和4年度が最終年度であるため、記入しない。

Report

(3 results)
  • 2022 Annual Research Report
  • 2021 Annual Research Report
  • 2020 Annual Research Report
  • Research Products

    (11 results)

All 2022 2021 2020

All Journal Article (7 results) (of which Peer Reviewed: 6 results,  Open Access: 1 results) Presentation (3 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Invited: 1 results) Book (1 results)

  • [Journal Article] Classification of protein solubilizing solutes by fluorescence assay2022

    • Author(s)
      Nishinami Suguru、Arakawa Tsutomu、Shiraki Kentaro
    • Journal Title

      International Journal of Biological Macromolecules

      Volume: 203 Pages: 695-702

    • DOI

      10.1016/j.ijbiomac.2022.01.137

    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Arginine and its Derivatives Suppress the Opalescence of an Antibody Solution2022

    • Author(s)
      Shogo Oki, Suguru Nishinami, Yoshitaka Nakauchi, Toshihiko Ogura, Kentaro Shiraki
    • Journal Title

      Journal of Pharmaceutical Sciences

      Volume: 111 Issue: 4 Pages: 1126-1132

    • DOI

      10.1016/j.xphs.2021.11.018

    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Opalescence arising from network assembly in antibody solution2022

    • Author(s)
      Nakauchi Yoshitaka、Nishinami Suguru、Murakami Yusuke、Ogura Toshihiko、Kano Hideaki、Shiraki Kentaro
    • Journal Title

      Molecular Pharmaceutics

      Volume: 19 Issue: 4 Pages: 1160-1167

    • DOI

      10.1021/acs.molpharmaceut.1c00929

    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] タンパク質溶液の状態はシミュレーションできるのか?2022

    • Author(s)
      西奈美 卓, 白木 賢太郎
    • Journal Title

      分子シミュレーション学会誌, アンサンブル

      Volume: 24 Pages: 220-224

    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Journal Article] Glass-like protein condensate for the long-term storage of proteins2021

    • Author(s)
      Nakauchi Yoshitaka、Nishinami Suguru、Shiraki Kentaro
    • Journal Title

      International Journal of Biological Macromolecules

      Volume: 182 Pages: 162-167

    • DOI

      10.1016/j.ijbiomac.2021.04.017

    • Related Report
      2020 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Aggregation of Hen Egg White Proteins with Additives During Agitation2021

    • Author(s)
      Hong Taehun、Iwashita Kazuki、Han Jeungmin、Nishinami Suguru、Handa Akihiro、Shiraki Kentaro
    • Journal Title

      LWT

      Volume: Mar 27 Pages: 111378-111378

    • DOI

      10.1016/j.lwt.2021.111378

    • Related Report
      2020 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Phasing Biology Reveals the Role of Prion Protein2020

    • Author(s)
      西奈美 卓、白木 賢太郎
    • Journal Title

      Butsuri

      Volume: 75 Issue: 4 Pages: 192-200

    • DOI

      10.11316/butsuri.75.4_192

    • NAID

      130007904154

    • ISSN
      0029-0181, 2423-8872
    • Year and Date
      2020-04-05
    • Related Report
      2020 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Characterization of protein solubilizing additive by fluorescence assay2022

    • Author(s)
      Suguru Nishinami, Tsutomu Arakawa, Kentaro Shiraki
    • Organizer
      2022 Colorado Protein Stability Conference
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Network association and glass-like condensation of highly concentrated proteins2022

    • Author(s)
      Suguru Nishinami, Yoshitaka Nakauchi, Kentaro Shiraki
    • Organizer
      2022 Colorado Protein Stability Conference
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Liquid-liquid phase separation of prions unraveled by solution additives2020

    • Author(s)
      Suguru Nishinami
    • Organizer
      第93回日本生化学会大会
    • Related Report
      2020 Annual Research Report
    • Invited
  • [Book] 相分離生物学の全貌(現代化学増刊46)2020

    • Author(s)
      白木 賢太郎 編
    • Publisher
      東京化学同人
    • ISBN
      9784807913466
    • Related Report
      2020 Annual Research Report

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Published: 2020-07-07   Modified: 2024-03-26  

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