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小分子結合ペプチドの分子進化工学的スクリーニング探索とバイオイメージングへの応用

Research Project

Project/Area Number 20J22783
Research Category

Grant-in-Aid for JSPS Fellows

Allocation TypeSingle-year Grants
Section国内
Review Section Basic Section 27040:Biofunction and bioprocess engineering-related
Research InstitutionUniversity of Yamanashi

Principal Investigator

山本 美月  山梨大学, 医工農学総合教育部, 特別研究員(DC1)

Project Period (FY) 2020-04-24 – 2023-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2022)
Budget Amount *help
¥2,800,000 (Direct Cost: ¥2,800,000)
Fiscal Year 2022: ¥900,000 (Direct Cost: ¥900,000)
Fiscal Year 2021: ¥900,000 (Direct Cost: ¥900,000)
Fiscal Year 2020: ¥1,000,000 (Direct Cost: ¥1,000,000)
KeywordsDirected evolution / SELEX / PUREシステム / cDNAディスプレイ / 蛍光ラベリング / 部位特異的ラベリング / 反応性ペプチドタグ / ノックダウン / ジベンゾシクロオクチン
Outline of Research at the Start

バイオイメージングは生体分子の動態をリアルタイムに画像として解析できる技術である。
その中心的存在の蛍光タンパク質は優れた特性がある一方、低分子蛍光プローブと比較すると不十分な蛍光特性と巨大なタグサイズによる標的タンパク質の機能阻害の問題点が存在する。これに対して、小分子を介して標的タンパク質に光学特性の高い非タンパク質性蛍光プローブを修飾させる小分子結合タンパク質タグが開発されたが、依然タグサイズの問題は解決されていない。本研究では、分子進化工学的スクリーニング探索により小分子に結合する低分子量の新規ペプチドタグを開発し、小分子蛍光プローブによるバイオイメージングへの応用を行う。

Outline of Annual Research Achievements

これまでに、PURE(Polypeptide synthesis Using Recombinant Elements)システムにより調製した数兆種類のcDNAディスプレイ型ペプチドタグライブラリーからのSELEXスクリーニングにより同定した新規小分子結合ペプチドタグについて、動物細胞内に発現させた合成小分子反応性ペプチドタグ融合タンパク質を、蛍光プローブで修飾した合成小分子で処理し、蛍光顕微鏡観察を行なった結果、合成小分子反応性ペプチドタグに特異的に蛍光ラベルがされていること、複数種類の動物細胞株(HEK293、COS-7、HeLa等)内で蛍光ラベル・イメージングが可能であること、様々なタンパク質(核局在GFP、チューブリン、ヒストン等)を蛍光ラベル・イメージング可能であること、複数種類の蛍光プローブ(青色クマリン、緑色フルオレセイン、赤色TMR、近赤外SiR等)で蛍光ラベル・イメージング可能であることが判明していた。そこで更に、動物細胞内に発現させた合成小分子反応性ペプチドタグ融合タンパク質を、ユビキチンリガーゼ結合リガンドで修飾した合成小分子で処理し、蛍光顕微鏡観察や免疫ブロッティング、発光測定による解析を行なった結果、様々なタンパク質(GFP、核局在GFP、アクチン、チューブリン、ヒストン、ルシフェラーゼ等)の分解誘導によるノックダウンが可能であること、複数種類の動物細胞株(HEK293、COS-7、HeLa等)内で分解誘導によるノックダウンが可能であることが判明した。
本研究成果は、日本農芸化学会2023年度大会および第74回日本生物工学会大会の学会で成果発表を行なっている。

Research Progress Status

令和4年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

令和4年度が最終年度であるため、記入しない。

Report

(3 results)
  • 2022 Annual Research Report
  • 2021 Annual Research Report
  • 2020 Annual Research Report
  • Research Products

    (24 results)

All 2022 2021 2020

All Journal Article (9 results) (of which Peer Reviewed: 9 results) Presentation (14 results) (of which Invited: 1 results) Book (1 results)

  • [Journal Article] In vitro display evolution of unnatural peptides spontaneously cyclized via intramolecular nucleophilic aromatic substitutions2022

    • Author(s)
      Yokoyama Takumi、Ando Takehiro、Takamori Yukio、Fuji Daisuke、Sato Masashi、Vedi Santhana、Yamamoto Mizuki、Kawakami Takashi
    • Journal Title

      Chemical Communications

      Volume: 58 Issue: 34 Pages: 5237-5240

    • DOI

      10.1039/d2cc00584k

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  • [Journal Article] Discovery of IL-5-binding unnatural cyclic peptides from multiple libraries by directed evolution2022

    • Author(s)
      Fuji Daisuke、Ando Takehiro、Sato Masashi、Vedi Santhana、Takamori Yukio、Yokoyama Takumi、Yamamoto Mizuki、Kawakami Takashi
    • Journal Title

      Biochemical and Biophysical Research Communications

      Volume: 610 Pages: 188-195

    • DOI

      10.1016/j.bbrc.2022.04.043

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  • [Journal Article] Artificial aptamer that inhibits interleukin-23/interleukin-23 receptor interaction discovered via SELEX2022

    • Author(s)
      Takamori Yukio、Ando Takehiro、Sato Masashi、Vedi Santhana、Fuji Daisuke、Yokoyama Takumi、Tsukamoto Keita、Yamamoto Mizuki、Kawakami Takashi
    • Journal Title

      Biochemical and Biophysical Research Communications

      Volume: 614 Pages: 17-21

    • DOI

      10.1016/j.bbrc.2022.05.012

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    • Author(s)
      Yokoyama Takumi、Ando Takehiro、Iwamoto Rina、Fuji Daisuke、Yamamoto Mizuki、Kawakami Takashi
    • Journal Title

      Biochemical and Biophysical Research Communications

      Volume: 553 Pages: 148-153

    • DOI

      10.1016/j.bbrc.2021.03.076

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      Ando Takehiro、Takamori Yukio、Yokoyama Takumi、Yamamoto Mizuki、Kawakami Takashi
    • Journal Title

      Biochemical and Biophysical Research Communications

      Volume: 534 Pages: 27-33

    • DOI

      10.1016/j.bbrc.2020.12.002

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      Takamori Yukio、Ando Takehiro、Fuji Daisuke、Yokoyama Takumi、Yamamoto Mizuki、Kawakami Takashi
    • Journal Title

      Biochemical and Biophysical Research Communications

      Volume: 535 Pages: 47-53

    • DOI

      10.1016/j.bbrc.2020.11.123

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      Tsukamoto Keita、Ando Takehiro、Fuji Daisuke、Yokoyama Takumi、Takamori Yukio、Horiuchi Daisuke、Iwamoto Rina、Yamamoto Mizuki、Kawakami Takashi
    • Journal Title

      Biochemical and Biophysical Research Communications

      Volume: 534 Pages: 519-525

    • DOI

      10.1016/j.bbrc.2020.11.050

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    • Author(s)
      Ando Takehiro、Yamamoto Mizuki、Yokoyama Takumi、Horiuchi Daisuke、Kawakami Takashi
    • Journal Title

      Journal of Bioscience and Bioengineering

      Volume: 131 Issue: 3 Pages: 326-332

    • DOI

      10.1016/j.jbiosc.2020.10.009

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      Ando Takehiro、Yamamoto Mizuki、Takamori Yukio、Tsukamoto Keita、Fuji Daisuke、Kawakami Takashi
    • Journal Title

      Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry

      Volume: 85 Issue: 5 Pages: 1170-1174

    • DOI

      10.1093/bbb/zbaa124

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      山本美月、安東丈洋、高守幸男、Vedi Santhana、佐藤将、横山匠、冨士大輔、川上隆史
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      山本美月、安東丈洋、高守幸男、横山匠、Vedi Santhana、王桐、冨士大輔、川上隆史
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      安東丈洋、山本美月、高守幸男、Vedi Santhana、佐藤将、横山匠、冨士大輔、川上隆史
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      第74回日本細胞生物学会
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    • Invited
  • [Book] ペプチド医薬品開発のための新規ペプチド環状化法の開発と非天然型環状ペプチドSELEX への応用2022

    • Author(s)
      高守幸男、冨士大輔、安東丈洋、横山匠、佐藤将、ベディサンタナ、山本美月、川上隆史
    • Total Pages
      9
    • Publisher
      シーエムシー出版
    • Related Report
      2022 Annual Research Report

URL: 

Published: 2020-07-07   Modified: 2024-03-26  

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